MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 480

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022271	GA	3	6	23	28	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022271	TAT	2	6	111	116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022271	TAT	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022271	TTC	2	6	861	866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022271	TC	3	6	984	989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022271	TTCT	2	8	990	997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022271	TCA	2	6	1903	1908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022271	GGC	2	6	1988	1993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022271	TCC	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_022271	GTTC	2	8	2076	2083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022271	TCC	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_022271	TA	3	6	2313	2318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022271	GC	3	6	2325	2330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022271	AGA	2	6	2339	2344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022271	ACG	2	6	2374	2379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022271	GGC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022271	CGC	2	6	3347	3352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_022271	T	7	7	3354	3360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022271	GCG	2	6	3522	3527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022271	CT	3	6	3686	3691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022271	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022271	ATG	2	6	3819	3824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022271	TGA	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022271	GTTG	2	8	3973	3980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022271	CAA	2	6	3981	3986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022271	AAC	2	6	4069	4074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022271	TGG	2	6	4132	4137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022271	CGT	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022271	CTC	2	6	4194	4199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_022271	GTTC	2	8	4242	4249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022271	TCC	2	6	4384	4389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_022271	TA	3	6	4479	4484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022271	GC	3	6	4491	4496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022271	AGA	2	6	4505	4510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022271	ACG	2	6	4540	4545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022271	GGGCA	2	10	5273	5282	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022271	TTC	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022271	GTAT	2	8	5403	5410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022271	TGT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022271	CTA	2	6	5450	5455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022271	CAC	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_022271	CT	3	6	5501	5506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_022271	GGC	2	6	5510	5515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022271	T	8	8	5516	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022271	T	6	6	5528	5533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022271	A	6	6	5597	5602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022271	GGTA	2	8	5606	5613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022271	ACAAG	2	10	7292	7301	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022271	AGA	2	6	7412	7417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022271	A	6	6	7421	7426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022271	T	6	6	7438	7443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022271	TTCGA	2	10	10849	10858	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022271	CTA	2	6	10954	10959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022271	TTC	2	6	10971	10976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022271	CGT	2	6	10987	10992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022271	CCA	2	6	11024	11029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_022271	AATT	2	8	11089	11096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022271	TAT	2	6	11099	11104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022271	TTTA	2	8	11118	11125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022271	TAG	2	6	11233	11238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022271	AGC	2	6	11989	11994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022271	CTC	2	6	12000	12005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_022271	AAC	2	6	12007	12012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022271	TCA	2	6	12043	12048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022271	CTT	2	6	12089	12094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022271	TAT	2	6	13858	13863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022271	TAT	2	6	13903	13908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022271	TTC	2	6	14608	14613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022271	GTA	2	6	15206	15211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022271	CAG	2	6	15221	15226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022271	AG	3	6	15225	15230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022271	ATCA	2	8	15659	15666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_022271	T	7	7	15701	15707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022271	A	6	6	15750	15755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022271	A	6	6	15773	15778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022271	A	6	6	15784	15789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022271	ATTAC	4	20	15804	15823	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022271	CGT	2	6	16656	16661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022271	AAG	2	6	16708	16713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022271	CTT	2	6	16744	16749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022271	GTA	2	6	17473	17478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022271	CAG	2	6	17488	17493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022271	AG	3	6	17492	17497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022271	ATCA	2	8	17926	17933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_022271	TTC	2	6	17965	17970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022271	AGG	2	6	18129	18134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022271	GAA	2	6	18236	18241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022271	AGA	2	6	18251	18256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022271	ATG	2	6	18264	18269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022271	TCT	2	6	18291	18296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022271	ACT	2	6	18319	18324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022271	TGG	2	6	18406	18411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022271	GAG	2	6	18509	18514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022271	GCC	2	6	18535	18540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_022271	TCAC	2	8	18613	18620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022271	GGC	2	6	18788	18793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022271	GTT	2	6	19995	20000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022271	AC	3	6	20004	20009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022271	GAT	2	6	20110	20115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022271	GA	3	6	20127	20132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022271	AGC	2	6	20475	20480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022271	CTC	2	6	20486	20491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_022271	AAC	2	6	20493	20498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_022271	TCA	2	6	20529	20534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022271	CGC	2	6	20582	20587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_022271	CAG	2	6	20634	20639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022271	A	7	7	20649	20655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022271	TGT	2	6	20665	20670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022271	GTT	2	6	20720	20725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022271	AAGC	2	8	20756	20763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022271	TCT	2	6	21928	21933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022271	TCG	2	6	21945	21950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022271	GGA	2	6	21979	21984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022271	GGT	2	6	22066	22071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022271	AT	3	6	22163	22168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022271	TCT	2	6	23359	23364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022271	TCA	2	6	23435	23440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022271	GT	3	6	24700	24705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022271	AGT	2	6	24822	24827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022271	TCAT	2	8	26478	26485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_022271	CTA	2	6	26489	26494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022271	TGC	2	6	26496	26501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022271	A	6	6	26549	26554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022271	CATT	2	8	26581	26588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_022271	TAAC	2	8	26593	26600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_022271	TCC	2	6	26636	26641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_022271	AAC	2	6	26653	26658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_022271	ACA	2	6	26674	26679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022271	CTTT	2	8	26890	26897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022271	GA	3	6	26945	26950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022271	TAT	2	6	27509	27514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022271	GAA	3	9	27518	27526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022271	T	6	6	27539	27544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022271	GAA	2	6	27586	27591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022271	TGG	2	6	28733	28738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022271	TAAG	2	8	28790	28797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022271	ATT	2	6	28804	28809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022271	TCAG	2	8	28958	28965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_022271	TGC	2	6	28979	28984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022271	ATT	2	6	29035	29040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022271	CTG	2	6	29043	29048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_022271	T	6	6	33639	33644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022271	CAA	2	6	34891	34896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_022271	GGT	2	6	34959	34964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022271	ACCA	2	8	35015	35022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022271	T	6	6	37897	37902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022271	A	7	7	37909	37915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022271	GCG	2	6	37925	37930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_022271	CT	3	6	44519	44524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022271	CT	3	6	44610	44615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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282	NC_022271	TCCAT	2	10	63389	63398	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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287	NC_022271	T	7	7	63892	63898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_022271	ATC	2	6	63910	63915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_022271	TGA	2	6	63948	63953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_022271	CAA	2	6	83158	83163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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436	NC_022271	AGC	2	6	83365	83370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_022271	AAG	2	6	83450	83455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
438	NC_022271	AAT	2	6	83515	83520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_022271	GT	3	6	83541	83546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
440	NC_022271	TTA	2	6	83582	83587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_022271	AGAA	2	8	83601	83608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
442	NC_022271	A	6	6	83615	83620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_022271	TTA	2	6	83633	83638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_022271	TTA	2	6	83650	83655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_022271	TCC	2	6	84330	84335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
446	NC_022271	ATG	2	6	84373	84378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
447	NC_022271	TGA	2	6	84411	84416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_022271	AG	3	6	84455	84460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
449	NC_022271	AGG	2	6	84612	84617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
450	NC_022271	GATACA	2	12	84646	84657	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
451	NC_022271	GAA	2	6	84719	84724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NC_022271	GTC	2	6	86317	86322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_022271	GT	3	6	86622	86627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
454	NC_022271	T	6	6	86642	86647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_022271	ATT	2	6	86686	86691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_022271	GATA	2	8	86695	86702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
457	NC_022271	TTA	2	6	87883	87888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_022271	TTG	2	6	87890	87895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
459	NC_022271	TTACCT	2	12	88047	88058	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_022271	CTT	2	6	88064	88069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_022271	CAAC	2	8	88104	88111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
462	NC_022271	TGA	2	6	88122	88127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
463	NC_022271	CAT	2	6	88132	88137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_022271	AAG	2	6	88182	88187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
465	NC_022271	CG	3	6	88205	88210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
466	NC_022271	TTC	2	6	88239	88244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_022271	TCT	2	6	88311	88316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_022271	GCG	2	6	88330	88335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
469	NC_022271	ACC	2	6	88350	88355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
470	NC_022271	TTG	2	6	88358	88363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
471	NC_022271	GGC	2	6	88382	88387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
472	NC_022271	GAT	2	6	88520	88525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
473	NC_022271	GAT	2	6	88562	88567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
474	NC_022271	TGT	2	6	88600	88605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
475	NC_022271	GAC	2	6	88624	88629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
476	NC_022271	GCA	2	6	88730	88735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
477	NC_022271	GTC	2	6	88754	88759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
478	NC_022271	CTT	2	6	88820	88825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
479	NC_022271	GTC	2	6	88836	88841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
480	NC_022271	CTT	2	6	88858	88863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.