MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 9592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_022247	CTC	2	6	4305904	4305909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7002	NC_022247	GTG	2	6	4305960	4305965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_022247	G	6	6	4306032	4306037	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_022247	GGA	2	6	4306050	4306055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_022247	CGG	2	6	4306080	4306085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_022247	GC	3	6	4306088	4306093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7007	NC_022247	ACAAGG	2	12	4306100	4306111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7008	NC_022247	A	7	7	4306116	4306122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_022247	CCG	2	6	4306129	4306134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7010	NC_022247	GAT	2	6	4307651	4307656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_022247	GCGCG	2	10	4307677	4307686	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7012	NC_022247	G	6	6	4307695	4307700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_022247	CGG	2	6	4307715	4307720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_022247	CGC	2	6	4307726	4307731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_022247	CGG	2	6	4307769	4307774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_022247	GCT	2	6	4307815	4307820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_022247	AGG	3	9	4307891	4307899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_022247	GAGCA	2	10	4307923	4307932	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7019	NC_022247	AAC	2	6	4307957	4307962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_022247	CAGA	2	8	4307983	4307990	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7021	NC_022247	TGC	2	6	4309335	4309340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_022247	TGC	2	6	4309363	4309368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_022247	GTCT	2	8	4309406	4309413	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7024	NC_022247	CT	4	8	4311815	4311822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7025	NC_022247	GC	3	6	4311834	4311839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7026	NC_022247	CAC	2	6	4311869	4311874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7027	NC_022247	TTG	2	6	4311945	4311950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_022247	ACGG	2	8	4311979	4311986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7029	NC_022247	T	7	7	4311991	4311997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_022247	GCC	2	6	4312006	4312011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_022247	CGA	2	6	4319259	4319264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_022247	TACA	2	8	4319301	4319308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7033	NC_022247	GAT	2	6	4319310	4319315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_022247	CTT	2	6	4326102	4326107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_022247	CCTT	2	8	4326108	4326115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7036	NC_022247	GAA	2	6	4329281	4329286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_022247	TCGGC	2	10	4329314	4329323	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7038	NC_022247	T	6	6	4329343	4329348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_022247	ACG	2	6	4331683	4331688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_022247	GTG	2	6	4331711	4331716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_022247	GAA	2	6	4333526	4333531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_022247	ATGT	2	8	4334840	4334847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_022247	AT	3	6	4334895	4334900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_022247	CCA	2	6	4334997	4335002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7045	NC_022247	CCAC	2	8	4337305	4337312	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7046	NC_022247	ACTT	2	8	4338096	4338103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7047	NC_022247	CG	3	6	4338151	4338156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7048	NC_022247	CG	3	6	4338289	4338294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7049	NC_022247	GT	3	6	4338321	4338326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_022247	CG	3	6	4338340	4338345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7051	NC_022247	CAG	2	6	4338404	4338409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_022247	GCG	2	6	4338439	4338444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_022247	GTG	2	6	4338471	4338476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_022247	GCG	2	6	4338512	4338517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_022247	CAG	2	6	4338563	4338568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_022247	GTG	2	6	4338570	4338575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_022247	TGG	2	6	4338585	4338590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_022247	GCA	2	6	4338607	4338612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_022247	CG	4	8	4338628	4338635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7060	NC_022247	GT	3	6	4338644	4338649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_022247	CG	3	6	4338694	4338699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7062	NC_022247	CTG	2	6	4338707	4338712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_022247	CGG	2	6	4338717	4338722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_022247	TGC	2	6	4338744	4338749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_022247	ACG	2	6	4338756	4338761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_022247	CAG	2	6	4338776	4338781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_022247	AGT	2	6	4338796	4338801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7069	NC_022247	CGC	2	6	4338908	4338913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7070	NC_022247	GCT	2	6	4338921	4338926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_022247	CAGA	2	8	4338935	4338942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7072	NC_022247	CCA	2	6	4338949	4338954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7073	NC_022247	CCA	2	6	4339054	4339059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7074	NC_022247	CG	3	6	4339067	4339072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7075	NC_022247	TG	3	6	4339128	4339133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_022247	CG	3	6	4339221	4339226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7077	NC_022247	GCC	2	6	4339231	4339236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7078	NC_022247	CGG	2	6	4339311	4339316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_022247	GCA	2	6	4339340	4339345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_022247	GTC	2	6	4339354	4339359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_022247	GAA	2	6	4339389	4339394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7083	NC_022247	CCG	2	6	4339419	4339424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7084	NC_022247	GCG	2	6	4339437	4339442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_022247	GCTG	2	8	4339476	4339483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7086	NC_022247	AACC	2	8	4339514	4339521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7087	NC_022247	CCCT	2	8	4339546	4339553	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7088	NC_022247	AAGT	2	8	4339597	4339604	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_022247	AGGG	2	8	4339617	4339624	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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7092	NC_022247	GCCG	2	8	4345228	4345235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7093	NC_022247	CGC	2	6	4345263	4345268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7094	NC_022247	ACGT	2	8	4348110	4348117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7095	NC_022247	CGG	2	6	4348125	4348130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7098	NC_022247	GGC	2	6	4348198	4348203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_022247	AGG	2	6	4349588	4349593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_022247	CG	3	6	4349594	4349599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7101	NC_022247	AAC	2	6	4351971	4351976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_022247	ACCCG	2	10	4352004	4352013	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7103	NC_022247	CTT	2	6	4352049	4352054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_022247	TGCA	2	8	4352089	4352096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7105	NC_022247	AC	3	6	4352109	4352114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7106	NC_022247	CCGA	2	8	4354216	4354223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7107	NC_022247	G	6	6	4354226	4354231	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_022247	GCC	2	6	4355364	4355369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7109	NC_022247	AGGCG	2	10	4355371	4355380	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7110	NC_022247	CG	5	10	4355428	4355437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7117	NC_022247	GTT	2	6	4363388	4363393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_022247	TGG	2	6	4363396	4363401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_022247	GCC	2	6	4363405	4363410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7120	NC_022247	CGCC	2	8	4363492	4363499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7121	NC_022247	CCGCTT	2	12	4365889	4365900	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7122	NC_022247	GCA	2	6	4365922	4365927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_022247	CGGT	2	8	4365955	4365962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7124	NC_022247	TCA	2	6	4365984	4365989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_022247	TTA	2	6	4366044	4366049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_022247	AT	3	6	4366050	4366055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_022247	GC	3	6	4367035	4367040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7128	NC_022247	CAGG	2	8	4368941	4368948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7129	NC_022247	CG	3	6	4369996	4370001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7130	NC_022247	GGCA	2	8	4370006	4370013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7132	NC_022247	AGG	2	6	4370078	4370083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7398	NC_022247	GTC	2	6	4582814	4582819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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