MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 4806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021822	TC	3	6	545737	545742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_021822	AAAC	2	8	548018	548025	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_021822	ATC	2	6	548042	548047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021822	GTT	2	6	548053	548058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021822	ATTTA	2	10	548095	548104	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021822	A	6	6	548107	548112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021822	CAG	2	6	548239	548244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_021822	TTA	2	6	548256	548261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021822	GAA	2	6	548272	548277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021822	GCT	2	6	548297	548302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_021822	ACA	2	6	550457	550462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_021822	TTATGA	2	12	550983	550994	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021822	T	6	6	551019	551024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021822	CGAACA	2	12	552096	552107	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_021822	AAAAAC	2	12	555122	555133	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1516	NC_021822	T	6	6	555153	555158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021822	TGA	2	6	560040	560045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021822	TTTTA	2	10	560073	560082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021822	TCT	2	6	560143	560148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_021822	TGT	2	6	560173	560178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021822	ATT	2	6	560203	560208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021822	AC	3	6	560298	560303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_021822	TGC	2	6	561865	561870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021822	GAG	2	6	561900	561905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021822	T	7	7	561910	561916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021822	GC	3	6	561917	561922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_021822	AAAAAG	2	12	561962	561973	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021822	TGA	2	6	561986	561991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021822	ATTTA	2	10	565195	565204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021822	CAA	2	6	565261	565266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_021822	T	6	6	565289	565294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021822	TA	3	6	566887	566892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021822	CTA	2	6	566988	566993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_021822	TTA	2	6	575015	575020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021822	ATGAG	2	10	577460	577469	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021822	T	6	6	577510	577515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021822	CAA	2	6	577523	577528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_021822	GTT	2	6	577553	577558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021822	TG	3	6	578613	578618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021822	GAA	2	6	578639	578644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021822	GATT	2	8	579738	579745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021822	TCA	2	6	579860	579865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_021822	AAGC	2	8	579867	579874	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_021822	CGC	2	6	579927	579932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_021822	AGTAG	2	10	579958	579967	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021822	CAA	2	6	579968	579973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_021822	TCA	2	6	580039	580044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_021822	A	6	6	584214	584219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021822	ATCAA	2	10	584250	584259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1550	NC_021822	T	6	6	585556	585561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021822	TTAC	2	8	585643	585650	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_021822	AAT	2	6	585660	585665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021822	TA	3	6	585703	585708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021822	T	6	6	585841	585846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021822	AGC	2	6	585875	585880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_021822	TGTA	2	8	585925	585932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021822	GC	3	6	585937	585942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_021822	A	6	6	585973	585978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021822	T	6	6	586048	586053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021822	TTG	2	6	586058	586063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021822	TTTTG	2	10	586485	586494	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021822	TCT	2	6	586523	586528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021822	AAT	2	6	586541	586546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021822	TA	3	6	589063	589068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021822	AGT	2	6	589069	589074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021822	ACTT	2	8	589095	589102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_021822	A	7	7	590647	590653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021822	ATA	2	6	590744	590749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021822	TAA	2	6	590753	590758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021822	T	6	6	590814	590819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021822	GAAA	2	8	590831	590838	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021822	TGAA	2	8	590854	590861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021822	AAT	2	6	590872	590877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021822	ATT	2	6	590896	590901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_021822	AAC	2	6	592128	592133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1578	NC_021822	AGT	2	6	592252	592257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1582	NC_021822	T	6	6	592976	592981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021822	TGAG	2	8	593674	593681	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1586	NC_021822	A	6	6	593760	593765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_021822	AAC	2	6	593877	593882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_021822	A	6	6	593891	593896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1593	NC_021822	AATA	2	8	597435	597442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_021822	GTA	2	6	597478	597483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_021822	GCA	2	6	598671	598676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1601	NC_021822	ACTAA	2	10	598710	598719	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1602	NC_021822	TAAAT	2	10	598745	598754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021822	CTC	2	6	598792	598797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_021822	TAA	2	6	598837	598842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021822	TAT	2	6	598898	598903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021822	TGC	2	6	598917	598922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_021822	TG	3	6	598964	598969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021822	TGT	2	6	598977	598982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021822	A	6	6	599042	599047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021822	TGT	2	6	599086	599091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1612	NC_021822	CTG	2	6	599189	599194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_021822	GTT	2	6	599196	599201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021822	A	6	6	599207	599212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021822	T	6	6	600090	600095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_021822	TGT	2	6	600134	600139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_021822	AGT	2	6	603890	603895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_021822	T	6	6	604884	604889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_021822	TCAT	2	8	604894	604901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_021822	GTA	2	6	604988	604993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_021822	GATT	2	8	605070	605077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021822	GT	3	6	605096	605101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021822	ATG	2	6	605122	605127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021822	GCT	2	6	605149	605154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1628	NC_021822	AAT	2	6	606245	606250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021822	TAAG	2	8	606322	606329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_021822	AGTA	2	8	606399	606406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_021822	GT	3	6	606415	606420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021822	AC	3	6	606436	606441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_021822	AC	3	6	606452	606457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_021822	TAG	2	6	606465	606470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021822	GAG	2	6	606539	606544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_021822	A	6	6	607429	607434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_021822	CTG	2	6	607464	607469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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