MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 5393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021821	TCAA	2	8	1220779	1220786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_021821	TCTT	2	8	1220791	1220798	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_021821	TTG	2	6	1222454	1222459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021821	CTAGG	2	10	1222494	1222503	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3505	NC_021821	GATTG	2	10	1223927	1223936	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_021821	A	6	6	1223939	1223944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021821	T	6	6	1223961	1223966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021821	CATC	2	8	1225398	1225405	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_021821	AAT	2	6	1225528	1225533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021821	ATTAA	2	10	1225547	1225556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_021821	CAC	2	6	1225573	1225578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_021821	AAAG	2	8	1227937	1227944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021821	TTG	2	6	1227949	1227954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021821	AT	3	6	1230195	1230200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021821	AGG	2	6	1230340	1230345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_021821	TGA	2	6	1232580	1232585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_021821	TAAG	2	8	1232587	1232594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021821	AG	3	6	1232593	1232598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021821	TTTG	2	8	1232640	1232647	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021821	AAT	2	6	1235614	1235619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021821	ATTG	2	8	1235643	1235650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021821	AAG	2	6	1235728	1235733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021821	TGG	2	6	1236082	1236087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021821	A	6	6	1236095	1236100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021821	TAAA	2	8	1237748	1237755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021821	ATT	2	6	1237784	1237789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021821	GTT	2	6	1237809	1237814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021821	CAAA	2	8	1237829	1237836	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3529	NC_021821	AAT	2	6	1237858	1237863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021821	ATT	2	6	1237876	1237881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_021821	GA	3	6	1238354	1238359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_021821	ATT	2	6	1238763	1238768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021821	GCG	2	6	1238775	1238780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_021821	TGA	2	6	1241254	1241259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_021821	TC	3	6	1241265	1241270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_021821	CCCAA	2	10	1241276	1241285	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3537	NC_021821	TCC	2	6	1241316	1241321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_021821	TTTCA	2	10	1241354	1241363	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3539	NC_021821	CAAA	2	8	1241501	1241508	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3540	NC_021821	A	6	6	1241506	1241511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021821	TGG	2	6	1241548	1241553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021821	AAC	2	6	1241583	1241588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021821	GC	3	6	1241610	1241615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_021821	GTC	2	6	1241625	1241630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_021821	ACAA	2	8	1241682	1241689	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3546	NC_021821	AGA	2	6	1241713	1241718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021821	CCA	2	6	1241746	1241751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_021821	T	6	6	1241762	1241767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021821	TCA	2	6	1241832	1241837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_021821	CAGA	2	8	1242064	1242071	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_021821	AAT	2	6	1242074	1242079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021821	CAAA	2	8	1242081	1242088	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_021821	ACG	2	6	1242109	1242114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_021821	TTAT	2	8	1242134	1242141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021821	TGG	2	6	1243630	1243635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021821	TGG	2	6	1243638	1243643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021821	GCC	2	6	1243996	1244001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3559	NC_021821	T	6	6	1244024	1244029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021821	A	6	6	1244098	1244103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021821	AAAT	2	8	1244151	1244158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021821	AG	3	6	1244238	1244243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021821	A	7	7	1244255	1244261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021821	TAGT	2	8	1244262	1244269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021821	TTATT	2	10	1244620	1244629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021821	AAAT	2	8	1244631	1244638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021821	GGAA	2	8	1244639	1244646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021821	A	6	6	1245140	1245145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021821	GCCA	2	8	1245149	1245156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_021821	TCTT	2	8	1245181	1245188	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_021821	GT	3	6	1245276	1245281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_021821	GGA	2	6	1245836	1245841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021821	TAAGT	2	10	1245883	1245892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021821	GAG	2	6	1246376	1246381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021821	CAT	2	6	1246902	1246907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3579	NC_021821	ATT	2	6	1247109	1247114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_021821	T	6	6	1248710	1248715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_021821	TTTTA	2	10	1248762	1248771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021821	CTT	2	6	1248859	1248864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_021821	CAT	2	6	1248904	1248909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_021821	TC	4	8	1249005	1249012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_021821	GTG	2	6	1249025	1249030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021821	ACTT	2	8	1250487	1250494	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3588	NC_021821	TGA	2	6	1250573	1250578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021821	TCT	2	6	1250622	1250627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3592	NC_021821	T	6	6	1250665	1250670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_021821	TGGT	2	8	1252586	1252593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021821	GA	3	6	1252706	1252711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021821	TAT	2	6	1253361	1253366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021821	AAAG	2	8	1253381	1253388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021821	TTG	2	6	1254405	1254410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021821	TTA	2	6	1254436	1254441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021821	TGT	2	6	1254472	1254477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021821	GATT	2	8	1255422	1255429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021821	GGC	2	6	1255443	1255448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_021821	AAC	2	6	1255516	1255521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_021821	CAT	2	6	1255527	1255532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_021821	GAT	2	6	1255551	1255556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021821	ATC	2	6	1255558	1255563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_021821	A	6	6	1255569	1255574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021821	AAC	2	6	1255579	1255584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_021821	TAG	2	6	1256474	1256479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3610	NC_021821	GAA	2	6	1256790	1256795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021821	GGT	2	6	1256823	1256828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021821	GAA	2	6	1256902	1256907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021821	ATTA	2	8	1257206	1257213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021821	GGC	2	6	1257281	1257286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3616	NC_021821	TCG	2	6	1257310	1257315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_021821	CAT	2	6	1257324	1257329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_021821	CATT	2	8	1257360	1257367	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3619	NC_021821	T	7	7	1257372	1257378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021821	T	6	6	1257391	1257396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021821	TG	3	6	1257417	1257422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021821	ATT	2	6	1257469	1257474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021821	AGTTA	2	10	1257482	1257491	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021821	TTC	2	6	1259548	1259553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_021821	TTG	2	6	1260077	1260082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3627	NC_021821	CGG	2	6	1260570	1260575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_021821	TAT	2	6	1260601	1260606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_021821	T	6	6	1261260	1261265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_021821	GTT	2	6	1261291	1261296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_021821	GAA	2	6	1261299	1261304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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