MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 5393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021821	AGC	2	6	169904	169909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021821	TCA	2	6	171607	171612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021821	GAT	2	6	171646	171651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021821	GCC	2	6	171696	171701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_021821	TGGT	2	8	171707	171714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021821	CAA	2	6	171744	171749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021821	T	6	6	171814	171819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021821	GTTTT	2	10	173901	173910	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021821	CAA	2	6	173960	173965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021821	A	7	7	173964	173970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021821	AATT	2	8	174909	174916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021821	ATT	2	6	174923	174928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021821	A	6	6	174942	174947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021821	ACA	2	6	174985	174990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_021821	CTGCC	2	10	176761	176770	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
516	NC_021821	ACT	2	6	176792	176797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021821	ACTG	2	8	176868	176875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
518	NC_021821	AAGT	2	8	176938	176945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021821	A	6	6	178227	178232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021821	T	7	7	178251	178257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021821	CTTG	2	8	178678	178685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_021821	TCA	2	6	178792	178797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_021821	ATA	2	6	178799	178804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021821	CCA	2	6	178866	178871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_021821	TCA	2	6	178876	178881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021821	AC	3	6	180007	180012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_021821	A	6	6	180067	180072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021821	AAGTG	2	10	180814	180823	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021821	AAAGC	2	10	180829	180838	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
530	NC_021821	CAAA	2	8	180888	180895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_021821	CTC	2	6	180908	180913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_021821	ATG	2	6	180930	180935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021821	ACAT	2	8	184303	184310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_021821	ATT	2	6	184327	184332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021821	GAT	2	6	186223	186228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021821	TTA	2	6	186233	186238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021821	AAGT	2	8	186294	186301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021821	A	6	6	186325	186330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021821	TAAAAA	2	12	186383	186394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021821	AGA	2	6	186444	186449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021821	TTA	2	6	186489	186494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021821	A	6	6	186559	186564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021821	A	6	6	187670	187675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021821	TCA	3	9	187688	187696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021821	CAA	2	6	187699	187704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_021821	TCA	2	6	187765	187770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021821	GA	3	6	187785	187790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021821	TTCC	2	8	188999	189006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_021821	GTT	2	6	189009	189014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021821	AATT	2	8	189086	189093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021821	AAGGA	2	10	189106	189115	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021821	CCTTC	2	10	192467	192476	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
553	NC_021821	ACG	2	6	192515	192520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_021821	ATT	2	6	193958	193963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021821	ATT	2	6	193998	194003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021821	T	6	6	194026	194031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021821	T	6	6	194061	194066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021821	TGA	2	6	194075	194080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021821	CCAA	2	8	194101	194108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_021821	AAC	2	6	194111	194116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021821	TAA	2	6	194168	194173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021821	ATTA	2	8	194235	194242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021821	AT	3	6	194360	194365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021821	AGT	2	6	194378	194383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021821	CAAA	2	8	194385	194392	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_021821	AAG	2	6	194459	194464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021821	TCTG	2	8	194996	195003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_021821	CCT	2	6	196397	196402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_021821	TCCTT	2	10	197148	197157	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
570	NC_021821	TTTC	2	8	197203	197210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_021821	TGG	3	9	197247	197255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021821	AACA	2	8	197275	197282	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
573	NC_021821	CCA	2	6	197301	197306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_021821	CTT	2	6	198865	198870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_021821	CGC	2	6	199456	199461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_021821	TG	3	6	202390	202395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021821	CA	3	6	202799	202804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_021821	TAC	2	6	202853	202858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_021821	A	6	6	202885	202890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021821	CTTT	2	8	202908	202915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_021821	TCAT	2	8	202919	202926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_021821	GCG	2	6	204315	204320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021821	CT	3	6	204328	204333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_021821	TC	3	6	204834	204839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_021821	TTGC	2	8	204885	204892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_021821	ACTT	2	8	204912	204919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_021821	GTAA	2	8	205932	205939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021821	GTTC	2	8	205960	205967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
589	NC_021821	A	6	6	206926	206931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021821	G	6	6	213297	213302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021821	ATTG	2	8	216073	216080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021821	A	6	6	216111	216116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021821	AAC	2	6	216134	216139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021821	T	7	7	216152	216158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021821	ATA	2	6	216159	216164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021821	AAC	2	6	216202	216207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021821	TTA	2	6	216237	216242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021821	TTA	2	6	216278	216283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021821	TAAAAC	2	12	216342	216353	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
600	NC_021821	AGA	2	6	216393	216398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021821	AACCC	2	10	223492	223501	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
602	NC_021821	CTAAA	2	10	223508	223517	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
603	NC_021821	T	6	6	223537	223542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021821	AAC	2	6	223621	223626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021821	ATC	2	6	223658	223663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_021821	T	6	6	223674	223679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021821	TAGT	2	8	223729	223736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021821	GAAA	2	8	223760	223767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021821	CAAAAG	2	12	224682	224693	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
610	NC_021821	T	6	6	224710	224715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021821	AGC	2	6	225145	225150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021821	TTA	2	6	225154	225159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021821	GA	3	6	225403	225408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021821	CTG	2	6	231711	231716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021821	TAG	2	6	231755	231760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021821	CACTT	2	10	232150	232159	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
617	NC_021821	CGC	2	6	232282	232287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_021821	TTG	2	6	232298	232303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021821	ATCA	2	8	232357	232364	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_021821	ATC	2	6	232378	232383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021821	GTC	2	6	232449	232454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_021821	ATC	2	6	232795	232800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021821	AG	3	6	232824	232829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021821	ATTTT	2	10	232836	232845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021821	GTA	2	6	234043	234048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021821	CAAA	2	8	234067	234074	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_021821	CTTTT	2	10	237513	237522	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
628	NC_021821	ATT	2	6	237577	237582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021821	CGG	2	6	237624	237629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021821	CAT	2	6	237652	237657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021821	TCC	2	6	238388	238393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_021821	TCGA	2	8	238394	238401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_021821	ACT	2	6	238519	238524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_021821	ACT	2	6	238539	238544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_021821	CAAG	2	8	238565	238572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_021821	ATT	2	6	238628	238633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021821	TTG	2	6	240191	240196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021821	TAT	2	6	240283	240288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021821	AG	3	6	240303	240308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_021821	ATT	2	6	242487	242492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_021821	TAA	2	6	243464	243469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_021821	TCA	2	6	243491	243496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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644	NC_021821	CA	3	6	243587	243592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
645	NC_021821	ACG	2	6	243595	243600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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647	NC_021821	C	6	6	243759	243764	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
648	NC_021821	ATT	2	6	243789	243794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_021821	TCA	2	6	243807	243812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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652	NC_021821	GTTT	2	8	250681	250688	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
653	NC_021821	CTT	2	6	250760	250765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_021821	TTGA	2	8	251577	251584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
655	NC_021821	CTGAT	2	10	251585	251594	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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659	NC_021821	CCT	2	6	253018	253023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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662	NC_021821	TTA	2	6	253126	253131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_021821	GTCGC	2	10	253175	253184	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
664	NC_021821	GAA	2	6	253702	253707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
665	NC_021821	T	6	6	253749	253754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
666	NC_021821	T	6	6	253763	253768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
667	NC_021821	TAG	2	6	254121	254126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
668	NC_021821	TA	3	6	255389	255394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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682	NC_021821	TCA	2	6	263867	263872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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696	NC_021821	TTCA	2	8	265373	265380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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773	NC_021821	AAT	2	6	287993	287998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
774	NC_021821	AG	3	6	288004	288009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
775	NC_021821	AATC	2	8	288018	288025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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778	NC_021821	ACA	2	6	288194	288199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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789	NC_021821	AAC	2	6	292552	292557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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924	NC_021821	GGA	2	6	332435	332440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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954	NC_021821	GTTT	2	8	345478	345485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
955	NC_021821	T	6	6	349232	349237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
956	NC_021821	CTTTT	2	10	349297	349306	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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967	NC_021821	T	6	6	361162	361167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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969	NC_021821	TGCC	2	8	364595	364602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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983	NC_021821	GCG	2	6	371681	371686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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986	NC_021821	A	6	6	372799	372804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
987	NC_021821	CATT	2	8	372819	372826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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