MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 5393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021821	ACA	2	6	1765752	1765757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_021821	GTT	2	6	1765763	1765768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021821	CAG	2	6	1765787	1765792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_021821	TAAT	2	8	1765806	1765813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021821	TTC	2	6	1765866	1765871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_021821	TCA	2	6	1765886	1765891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_021821	A	6	6	1765941	1765946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021821	TAAT	2	8	1769605	1769612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021821	AGA	2	6	1769685	1769690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021821	TAA	2	6	1769762	1769767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021821	AAG	2	6	1769826	1769831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021821	AGAGT	2	10	1769873	1769882	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021821	AG	3	6	1769888	1769893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021821	ATAG	2	8	1769899	1769906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021821	T	6	6	1771406	1771411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021821	GCT	2	6	1771489	1771494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_021821	TTA	2	6	1771520	1771525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021821	CAA	2	6	1771571	1771576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_021821	TTA	2	6	1771586	1771591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021821	TGTT	2	8	1771686	1771693	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021821	TC	3	6	1772219	1772224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_021821	TGG	2	6	1772232	1772237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021821	GAT	2	6	1772327	1772332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021821	ATA	2	6	1773405	1773410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021821	GTC	2	6	1773447	1773452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_021821	TGA	2	6	1773478	1773483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021821	TGT	2	6	1774071	1774076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021821	A	6	6	1774085	1774090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021821	CTCC	2	8	1774110	1774117	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5030	NC_021821	ACG	2	6	1774132	1774137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_021821	TATT	2	8	1774696	1774703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021821	TATG	2	8	1774725	1774732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021821	CGA	2	6	1774774	1774779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_021821	TTC	2	6	1775312	1775317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_021821	CAC	2	6	1776719	1776724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_021821	A	7	7	1776747	1776753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021821	GTAA	2	8	1776815	1776822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021821	AAG	2	6	1781465	1781470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021821	TAA	2	6	1781552	1781557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021821	CTCTT	2	10	1782054	1782063	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5041	NC_021821	ATC	2	6	1782106	1782111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_021821	ATT	2	6	1782266	1782271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021821	AATC	2	8	1782316	1782323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_021821	TTG	2	6	1782431	1782436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021821	AACAA	2	10	1782467	1782476	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5046	NC_021821	TGT	2	6	1782482	1782487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021821	TCC	2	6	1783291	1783296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5049	NC_021821	AAC	2	6	1783308	1783313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_021821	T	6	6	1783373	1783378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021821	AGT	2	6	1784063	1784068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021821	GCA	2	6	1784092	1784097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_021821	A	7	7	1785233	1785239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021821	GCA	2	6	1785273	1785278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_021821	GTTTAG	2	12	1785361	1785372	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021821	CA	3	6	1786053	1786058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_021821	AAC	2	6	1786128	1786133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_021821	AC	4	8	1786144	1786151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_021821	CGGT	2	8	1786156	1786163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_021821	AG	3	6	1787228	1787233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021821	TGA	2	6	1787244	1787249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021821	TAC	2	6	1787261	1787266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_021821	ACG	2	6	1787344	1787349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_021821	T	6	6	1788266	1788271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021821	GCT	2	6	1788294	1788299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_021821	AGC	2	6	1788306	1788311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_021821	T	6	6	1788313	1788318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021821	CTT	2	6	1790166	1790171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_021821	TTG	2	6	1790190	1790195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021821	AG	3	6	1790268	1790273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021821	TAC	2	6	1790303	1790308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_021821	T	6	6	1790323	1790328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021821	GAC	2	6	1790395	1790400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5075	NC_021821	ATC	2	6	1790657	1790662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5078	NC_021821	AGTA	2	8	1792796	1792803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021821	TGA	2	6	1792838	1792843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_021821	CA	3	6	1792924	1792929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_021821	ATT	2	6	1794722	1794727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021821	CAAA	2	8	1795703	1795710	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_021821	TTG	2	6	1795721	1795726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021821	TGC	2	6	1795753	1795758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_021821	ATA	2	6	1795896	1795901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021821	CAGCAC	2	12	1796013	1796024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_021821	TGA	2	6	1796119	1796124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021821	TGT	2	6	1796170	1796175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_021821	T	6	6	1796261	1796266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021821	TA	3	6	1796287	1796292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021821	CCG	2	6	1797161	1797166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_021821	AAG	2	6	1798222	1798227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5096	NC_021821	CAA	2	6	1798538	1798543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_021821	GTAA	2	8	1798634	1798641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021821	ATT	2	6	1798680	1798685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021821	AGA	2	6	1798810	1798815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021821	CTA	2	6	1798826	1798831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_021821	CA	3	6	1798931	1798936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_021821	CA	4	8	1799012	1799019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_021821	ATT	2	6	1800462	1800467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021821	AAAT	2	8	1806212	1806219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021821	ATA	2	6	1806243	1806248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021821	T	6	6	1806270	1806275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021821	TTTC	2	8	1806277	1806284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_021821	TGT	2	6	1806316	1806321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021821	A	6	6	1806322	1806327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_021821	CAGTA	2	10	1806337	1806346	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5111	NC_021821	CAT	2	6	1806349	1806354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_021821	T	6	6	1806368	1806373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021821	GTA	2	6	1806380	1806385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021821	AT	3	6	1806452	1806457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021821	TTAG	2	8	1806544	1806551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021821	AT	3	6	1806592	1806597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021821	T	7	7	1806696	1806702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021821	GTT	2	6	1806708	1806713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021821	ATG	2	6	1806725	1806730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021821	AAT	2	6	1806771	1806776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021821	TAA	2	6	1806804	1806809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021821	TAG	2	6	1806831	1806836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021821	ACA	2	6	1806904	1806909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_021821	AACA	2	8	1806927	1806934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_021821	CAA	2	6	1806954	1806959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_021821	AAG	2	6	1807089	1807094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021821	ACG	2	6	1807101	1807106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_021821	GCA	2	6	1807173	1807178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_021821	GAGTT	2	10	1807179	1807188	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021821	AT	3	6	1807255	1807260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021821	AG	3	6	1807312	1807317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021821	AAT	2	6	1807412	1807417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_021821	GTT	2	6	1807485	1807490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5135	NC_021821	CTA	2	6	1807552	1807557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5177	NC_021821	A	7	7	1814613	1814619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5245	NC_021821	ATT	2	6	1829472	1829477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_021821	A	6	6	1829503	1829508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_021821	AGTG	2	8	1829520	1829527	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5252	NC_021821	GAC	2	6	1829651	1829656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5253	NC_021821	ATAA	2	8	1829703	1829710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_021821	AAT	2	6	1829711	1829716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_021821	T	6	6	1829775	1829780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_021821	AATT	2	8	1829868	1829875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_021821	TAAAAC	2	12	1829877	1829888	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5259	NC_021821	CTA	2	6	1829993	1829998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5261	NC_021821	TAC	2	6	1830056	1830061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5393	NC_021821	ATTCA	2	10	1861322	1861331	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

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