MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 10698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019955	AT	4	8	13	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019955	TA	4	8	27	34	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019955	TAT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019955	ACT	2	6	66	71	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019955	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019955	TCT	2	6	110	115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019955	GTT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019955	T	6	6	276	281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019955	T	6	6	297	302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019955	CTT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019955	ATTA	2	8	2311	2318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019955	CAAAAA	2	12	2336	2347	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019955	GCC	2	6	2360	2365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_019955	GTTA	2	8	4012	4019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019955	TGG	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019955	C	6	6	4058	4063	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_019955	TTCA	2	8	4064	4071	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019955	GATAAA	2	12	4213	4224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019955	AGT	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019955	AAG	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019955	TA	3	6	4824	4829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019955	GAA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019955	CAA	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019955	CCGG	2	8	4917	4924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019955	AGAAA	2	10	6409	6418	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019955	AATG	2	8	6430	6437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019955	TAC	2	6	7285	7290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019955	GTTA	2	8	7292	7299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019955	TAAA	2	8	7307	7314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019955	AG	3	6	7339	7344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019955	TAA	2	6	7345	7350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019955	ATA	2	6	7368	7373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019955	AGG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019955	A	6	6	7428	7433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019955	GAAA	2	8	7443	7450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019955	ATA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019955	GA	3	6	11345	11350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019955	TAGA	2	8	13787	13794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019955	A	6	6	13794	13799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019955	GCT	2	6	13813	13818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019955	T	6	6	13818	13823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019955	TGG	2	6	13830	13835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019955	CAC	2	6	13845	13850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019955	CTA	2	6	13877	13882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019955	TGCTTT	2	12	13956	13967	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019955	AAG	2	6	14107	14112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019955	CCG	2	6	14683	14688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019955	TTG	2	6	14707	14712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019955	T	7	7	14764	14770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019955	TGA	2	6	14796	14801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019955	AGA	2	6	14846	14851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019955	CA	3	6	14908	14913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019955	TTAA	2	8	15050	15057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019955	TTA	2	6	16938	16943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019955	GAA	3	9	16967	16975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019955	A	6	6	16974	16979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019955	TCA	2	6	16985	16990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019955	A	6	6	17016	17021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019955	TGG	2	6	17045	17050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019955	AAC	2	6	19165	19170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019955	CAA	2	6	19214	19219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019955	AAT	2	6	19266	19271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019955	CAA	2	6	19298	19303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019955	A	6	6	19302	19307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019955	CG	3	6	22371	22376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019955	AATAA	2	10	22457	22466	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019955	CTG	2	6	22562	22567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019955	CAA	2	6	22616	22621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019955	TGA	2	6	22663	22668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019955	GTTC	2	8	22686	22693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019955	ATC	2	6	22769	22774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019955	AAT	2	6	22813	22818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019955	TAC	2	6	22865	22870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019955	TAAC	2	8	24170	24177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019955	CGTT	2	8	24194	24201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019955	A	6	6	24203	24208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019955	T	7	7	24235	24241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019955	AAC	2	6	24268	24273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019955	T	9	9	24580	24588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019955	AGC	2	6	26677	26682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019955	CTT	2	6	26711	26716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019955	TCA	2	6	26739	26744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019955	TAA	2	6	26783	26788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019955	GCC	2	6	26809	26814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_019955	TCG	2	6	30297	30302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019955	TATTCT	2	12	30328	30339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019955	AGTT	2	8	30354	30361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019955	T	6	6	30391	30396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019955	TCAA	2	8	31154	31161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019955	ATT	2	6	31180	31185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019955	TCG	2	6	31190	31195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019955	TGC	2	6	33186	33191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019955	A	7	7	33209	33215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019955	TG	3	6	33459	33464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019955	TGA	2	6	33474	33479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019955	GGC	2	6	33651	33656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019955	GCG	2	6	33725	33730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019955	ATG	2	6	33802	33807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019955	CGA	2	6	33900	33905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019955	GAT	2	6	33925	33930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019955	GCA	2	6	33974	33979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019955	GT	3	6	34027	34032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019955	GAA	2	6	34033	34038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019955	GTAGT	2	10	34077	34086	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019955	ATT	2	6	34097	34102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019955	AGA	2	6	34116	34121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019955	CAG	2	6	34142	34147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019955	GGT	2	6	34207	34212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019955	G	6	6	34289	34294	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019955	GGC	2	6	34353	34358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019955	GAA	2	6	34596	34601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019955	TGC	2	6	34672	34677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019955	GTC	2	6	34684	34689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019955	GGA	2	6	34798	34803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019955	GAC	2	6	34811	34816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019955	TCA	2	6	34823	34828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019955	AC	3	6	34849	34854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019955	GGC	2	6	34878	34883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019955	CGT	2	6	34917	34922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019955	AC	3	6	35018	35023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019955	GTAG	2	8	35059	35066	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019955	G	6	6	35077	35082	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019955	CCT	2	6	35159	35164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_019955	GAT	2	6	35170	35175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019955	CA	3	6	35193	35198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019955	TAAAG	2	10	35214	35223	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019955	AGA	3	9	35224	35232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019955	CGG	2	6	35294	35299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019955	TTC	2	6	35410	35415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019955	GAA	2	6	35421	35426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019955	CCA	2	6	35510	35515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019955	GAA	2	6	35617	35622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019955	ACA	2	6	35657	35662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019955	TTG	2	6	35668	35673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019955	CAT	2	6	35766	35771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019955	TCA	2	6	35805	35810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019955	GTA	2	6	35892	35897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019955	GTA	2	6	35920	35925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019955	AGG	2	6	36005	36010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019955	GCG	2	6	36077	36082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019955	CGA	2	6	36141	36146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019955	GAC	2	6	36170	36175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019955	GT	3	6	36176	36181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019955	G	6	6	36229	36234	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019955	TCC	2	6	36239	36244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_019955	TAC	2	6	36254	36259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019955	TGAC	2	8	36260	36267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_019955	GTAC	2	8	36343	36350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_019955	GGA	2	6	36548	36553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019955	TAC	2	6	36671	36676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_019955	AGTA	2	8	36746	36753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019955	AC	3	6	36765	36770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_019955	CGTC	2	8	36783	36790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_019955	AAC	2	6	36802	36807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_019955	TAC	2	6	36834	36839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_019955	AGC	2	6	36891	36896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_019955	CAT	2	6	36897	36902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_019955	AAAG	2	8	36905	36912	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019955	AGT	2	6	36964	36969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019955	GT	3	6	37035	37040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019955	CCT	2	6	37108	37113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_019955	CTT	2	6	37223	37228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_019955	ACG	2	6	37340	37345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_019955	TTA	2	6	37597	37602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_019955	TGAAAT	2	12	37832	37843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_019955	TAC	2	6	37897	37902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_019955	TG	3	6	37972	37977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019955	ACC	2	6	37994	37999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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175	NC_019955	TCC	2	6	38080	38085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
176	NC_019955	GGA	2	6	38097	38102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
177	NC_019955	GGT	2	6	38217	38222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
178	NC_019955	CGG	2	6	38304	38309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_019955	TCA	2	6	38332	38337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_019955	GCT	2	6	38466	38471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_019955	ACG	2	6	38647	38652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_019955	GT	3	6	38665	38670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
184	NC_019955	ACA	2	6	38726	38731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_019955	AT	3	6	39980	39985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_019955	A	6	6	42068	42073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_019955	AGC	2	6	42077	42082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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198	NC_019955	TTCA	2	8	46993	47000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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281	NC_019955	ATAG	2	8	77684	77691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_019955	T	6	6	112284	112289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_019955	ATT	3	9	112322	112330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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