MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 10698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019955	ATTT	2	8	319233	319240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019955	GTG	2	6	319251	319256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019955	TGT	2	6	320351	320356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019955	ATT	2	6	320418	320423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019955	TTTA	2	8	320428	320435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019955	A	6	6	320449	320454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019955	CA	3	6	325949	325954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_019955	AGA	2	6	327422	327427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019955	TTACAT	2	12	328542	328553	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1010	NC_019955	ATTT	2	8	328670	328677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019955	ATTC	2	8	328695	328702	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_019955	AAG	3	9	328762	328770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019955	ATCC	2	8	330880	330887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_019955	TCAA	2	8	330922	330929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_019955	GCC	2	6	331033	331038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_019955	GAGC	2	8	331084	331091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_019955	ACCC	2	8	332089	332096	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1018	NC_019955	A	6	6	334427	334432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019955	T	7	7	334453	334459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019955	TC	3	6	334921	334926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_019955	TTA	2	6	337550	337555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019955	TTC	2	6	337572	337577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_019955	AGTG	2	8	337827	337834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019955	CCTT	2	8	338812	338819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_019955	ATT	2	6	338826	338831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_019955	TCCAA	2	10	338889	338898	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1027	NC_019955	A	6	6	338927	338932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019955	TGAT	2	8	339000	339007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019955	AGTT	2	8	339032	339039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019955	GTG	2	6	339097	339102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019955	AGT	2	6	339110	339115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019955	ATAA	2	8	339137	339144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019955	TTTC	2	8	339162	339169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_019955	TCG	2	6	339201	339206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_019955	AT	4	8	339730	339737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019955	AACAG	2	10	339793	339802	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_019955	ATT	2	6	339814	339819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019955	AAT	2	6	339874	339879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019955	ACA	2	6	339901	339906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_019955	ATTG	2	8	339939	339946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019955	AAG	2	6	340992	340997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019955	T	6	6	341019	341024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019955	ACA	2	6	341065	341070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_019955	TGG	2	6	341363	341368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019955	TA	3	6	342386	342391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019955	AAT	2	6	342399	342404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019955	A	6	6	342410	342415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019955	T	6	6	342483	342488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019955	TCT	2	6	342516	342521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_019955	TGA	2	6	342540	342545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019955	CGG	2	6	343248	343253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_019955	T	6	6	343256	343261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019955	CACG	2	8	343374	343381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_019955	AGT	2	6	343383	343388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_019955	TC	3	6	344577	344582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_019955	TAA	2	6	344607	344612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019955	T	7	7	344634	344640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019955	GAT	2	6	344659	344664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019955	CCT	2	6	344715	344720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_019955	TC	3	6	346540	346545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_019955	TAA	3	9	347833	347841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019955	T	6	6	350974	350979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019955	GAA	2	6	350980	350985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019955	TCC	2	6	353215	353220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_019955	GTG	2	6	353299	353304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019955	ACAA	2	8	353308	353315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_019955	ATTGA	2	10	353362	353371	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019955	ACT	3	9	353385	353393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1070	NC_019955	GAC	2	6	353489	353494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_019955	CGT	3	9	353592	353600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_019955	T	6	6	354535	354540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_019955	GGAT	2	8	354585	354592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_019955	AG	3	6	355379	355384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019955	GTT	3	9	355424	355432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_019955	TTCT	2	8	355433	355440	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_019955	AAAAC	2	10	355455	355464	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1078	NC_019955	AAG	2	6	355501	355506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019955	TTCCT	2	10	357544	357553	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1080	NC_019955	CGT	2	6	357554	357559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_019955	GAT	2	6	357577	357582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019955	TCT	2	6	358736	358741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_019955	ATT	2	6	358756	358761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019955	TG	3	6	358773	358778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_019955	CTTC	2	8	360358	360365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_019955	A	7	7	360419	360425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_019955	CG	3	6	360487	360492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1091	NC_019955	T	6	6	360621	360626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019955	TAA	2	6	360648	360653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019955	TCAA	2	8	360678	360685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1098	NC_019955	GTTT	2	8	363460	363467	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_019955	TTGT	2	8	363475	363482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_019955	TTC	2	6	363522	363527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_019955	TTTCGA	2	12	363558	363569	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1104	NC_019955	ATT	2	6	363623	363628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019955	T	6	6	363670	363675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019955	TGTT	2	8	363716	363723	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019955	ATAC	2	8	363746	363753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_019955	GTT	2	6	363772	363777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019955	T	6	6	363784	363789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_019955	TTG	2	6	363804	363809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019955	ATA	2	6	363930	363935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_019955	GCC	2	6	363974	363979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_019955	TAT	2	6	365020	365025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019955	TGA	2	6	365032	365037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019955	ATC	2	6	365059	365064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_019955	GA	3	6	365088	365093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_019955	TTAA	2	8	365123	365130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_019955	TTA	2	6	365210	365215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019955	GTAA	2	8	365303	365310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019955	TGA	2	6	367148	367153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_019955	CCAG	2	8	367162	367169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_019955	GCA	2	6	367202	367207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_019955	TGA	2	6	367216	367221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019955	T	8	8	367277	367284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019955	T	6	6	367294	367299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019955	TGC	2	6	367305	367310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_019955	TC	3	6	367384	367389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_019955	TAA	2	6	367404	367409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019955	TGA	2	6	367424	367429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_019955	TGC	2	6	369849	369854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_019955	AAT	2	6	369857	369862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_019955	TAG	2	6	369879	369884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019955	CAT	2	6	369886	369891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_019955	GA	3	6	371798	371803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_019955	A	6	6	371822	371827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_019955	TAA	2	6	371851	371856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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