MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 10698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019955	AAAGG	2	10	1395480	1395489	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_019955	CCT	2	6	1399798	1399803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_019955	T	6	6	1399813	1399818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_019955	G	6	6	1399836	1399841	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_019955	T	6	6	1400327	1400332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_019955	TCA	2	6	1400376	1400381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_019955	TAA	2	6	1400405	1400410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_019955	TTTG	2	8	1400457	1400464	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_019955	TGT	2	6	1400517	1400522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_019955	TA	3	6	1400573	1400578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_019955	GAA	2	6	1400579	1400584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_019955	CGG	2	6	1403097	1403102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_019955	GAC	2	6	1403123	1403128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_019955	ATTT	2	8	1403150	1403157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_019955	GCAAA	2	10	1403160	1403169	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4516	NC_019955	CAA	2	6	1403178	1403183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_019955	A	7	7	1403208	1403214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_019955	TGAAA	2	10	1403249	1403258	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_019955	CAT	2	6	1408943	1408948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_019955	ACG	2	6	1408960	1408965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_019955	CGC	2	6	1408974	1408979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_019955	A	7	7	1408995	1409001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_019955	AG	3	6	1409027	1409032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_019955	AGT	2	6	1410696	1410701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_019955	TAAAA	2	10	1410909	1410918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_019955	TCTT	2	8	1412099	1412106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_019955	TC	3	6	1412179	1412184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4528	NC_019955	GAC	2	6	1412274	1412279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_019955	TGA	2	6	1412367	1412372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_019955	AAT	2	6	1412381	1412386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_019955	TGC	2	6	1412387	1412392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_019955	TGT	2	6	1412535	1412540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_019955	CT	3	6	1412563	1412568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_019955	CT	3	6	1412574	1412579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_019955	GTT	2	6	1412643	1412648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_019955	AATTT	2	10	1412704	1412713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_019955	TC	3	6	1412821	1412826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_019955	GGGA	2	8	1413999	1414006	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_019955	TCC	2	6	1416903	1416908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4540	NC_019955	TTC	2	6	1416917	1416922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_019955	TTG	2	6	1416959	1416964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_019955	GTT	2	6	1417002	1417007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_019955	T	6	6	1417738	1417743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_019955	GAAA	2	8	1417777	1417784	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_019955	TA	3	6	1418158	1418163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_019955	ATC	2	6	1418207	1418212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_019955	TGA	2	6	1418258	1418263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_019955	GGT	2	6	1418370	1418375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_019955	TGAAT	2	10	1418401	1418410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_019955	TAC	2	6	1418455	1418460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_019955	CCA	2	6	1418501	1418506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_019955	AGA	2	6	1418513	1418518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_019955	TGG	2	6	1418531	1418536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_019955	CTT	2	6	1418578	1418583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_019955	AAG	2	6	1419809	1419814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_019955	TC	3	6	1421967	1421972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_019955	ATGTGT	2	12	1422003	1422014	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_019955	ATTT	2	8	1422024	1422031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_019955	GTAA	2	8	1424635	1424642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_019955	TCA	2	6	1424724	1424729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_019955	TCG	2	6	1424803	1424808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_019955	TGA	2	6	1424882	1424887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_019955	TGA	2	6	1425056	1425061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_019955	GTGA	2	8	1425067	1425074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_019955	ATA	2	6	1425168	1425173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_019955	AAT	2	6	1425192	1425197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_019955	GGC	2	6	1425302	1425307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_019955	GCA	2	6	1425381	1425386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_019955	CAA	2	6	1425415	1425420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_019955	ACA	2	6	1425489	1425494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_019955	TCT	2	6	1425562	1425567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_019955	ATT	2	6	1425589	1425594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_019955	ACG	2	6	1426607	1426612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_019955	ATC	2	6	1427597	1427602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_019955	ATT	2	6	1428293	1428298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_019955	TTGC	2	8	1428339	1428346	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_019955	T	6	6	1428790	1428795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_019955	GTAG	2	8	1428796	1428803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_019955	T	6	6	1429150	1429155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_019955	GGAT	2	8	1429957	1429964	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_019955	GTT	2	6	1430919	1430924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_019955	CCAA	2	8	1430985	1430992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_019955	AGT	3	9	1431002	1431010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_019955	TCC	2	6	1436055	1436060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_019955	ATT	2	6	1436127	1436132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_019955	TAG	2	6	1436156	1436161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_019955	ATC	2	6	1436218	1436223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_019955	ATT	2	6	1436291	1436296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_019955	TAA	2	6	1436306	1436311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_019955	ATAAAA	2	12	1436337	1436348	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_019955	TC	3	6	1436366	1436371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_019955	TGA	2	6	1436408	1436413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_019955	TAA	2	6	1436471	1436476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_019955	TAAT	2	8	1437771	1437778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_019955	GTTT	2	8	1438581	1438588	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_019955	T	8	8	1438586	1438593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_019955	TACC	2	8	1438656	1438663	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_019955	T	6	6	1438684	1438689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_019955	AGC	2	6	1441146	1441151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_019955	AC	3	6	1441163	1441168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_019955	GC	3	6	1441177	1441182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_019955	GAT	2	6	1442131	1442136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_019955	TGG	2	6	1442273	1442278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_019955	TAAT	2	8	1442512	1442519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_019955	GAC	2	6	1442521	1442526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_019955	AGG	2	6	1442570	1442575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_019955	A	6	6	1443354	1443359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_019955	TAAA	2	8	1443360	1443367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_019955	TAAAA	2	10	1444562	1444571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_019955	ACTA	2	8	1444607	1444614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_019955	AAT	2	6	1444615	1444620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_019955	T	7	7	1444665	1444671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_019955	T	7	7	1444674	1444680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_019955	TTTAT	2	10	1444683	1444692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_019955	TCG	2	6	1444700	1444705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_019955	CA	3	6	1444720	1444725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_019955	ATA	2	6	1444726	1444731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_019955	ATT	2	6	1444760	1444765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_019955	CTTT	2	8	1454121	1454128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_019955	TGTGAT	2	12	1454260	1454271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_019955	TGA	2	6	1454278	1454283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_019955	GTG	2	6	1454290	1454295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_019955	ATA	2	6	1454310	1454315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_019955	TA	3	6	1454327	1454332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_019955	CATG	2	8	1454337	1454344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4626	NC_019955	TAC	2	6	1454384	1454389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_019955	ATG	2	6	1454405	1454410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_019955	TATT	2	8	1454508	1454515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_019955	A	6	6	1454601	1454606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_019955	TAA	2	6	1454649	1454654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4632	NC_019955	AAC	2	6	1454681	1454686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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