MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 11407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017270	AG	3	6	2385200	2385205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_017270	CT	3	6	2385215	2385220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_017270	TGT	2	6	2385221	2385226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_017270	CTA	2	6	2388469	2388474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_017270	TCT	2	6	2389590	2389595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_017270	ATT	2	6	2389656	2389661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_017270	CTA	2	6	2389678	2389683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_017270	ATTTA	2	10	2389769	2389778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_017270	TGA	2	6	2389793	2389798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_017270	TCA	2	6	2389805	2389810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_017270	A	7	7	2389819	2389825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_017270	A	8	8	2390064	2390071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_017270	CAG	2	6	2390075	2390080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_017270	TGGC	2	8	2390082	2390089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10015	NC_017270	A	6	6	2391018	2391023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_017270	GTT	2	6	2391515	2391520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_017270	TAA	2	6	2391558	2391563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_017270	TGT	2	6	2394289	2394294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_017270	TC	3	6	2394298	2394303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10020	NC_017270	TG	3	6	2394385	2394390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_017270	TGA	2	6	2394399	2394404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_017270	TTAA	2	8	2394430	2394437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_017270	TGC	2	6	2394439	2394444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_017270	CAA	2	6	2394467	2394472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_017270	TTG	2	6	2394490	2394495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_017270	AAG	2	6	2394596	2394601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_017270	A	6	6	2395163	2395168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_017270	TAT	2	6	2395193	2395198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_017270	ATT	2	6	2395200	2395205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_017270	ATTT	2	8	2396149	2396156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_017270	CGGC	2	8	2396169	2396176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10032	NC_017270	ACA	2	6	2396177	2396182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_017270	CCGA	2	8	2396183	2396190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10034	NC_017270	TC	3	6	2397452	2397457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10035	NC_017270	A	6	6	2411862	2411867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_017270	CCA	2	6	2411869	2411874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_017270	ATG	2	6	2411887	2411892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_017270	GTA	2	6	2411946	2411951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_017270	TCAC	2	8	2411973	2411980	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_017270	CCT	2	6	2412001	2412006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_017270	ATCCC	2	10	2412124	2412133	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10042	NC_017270	CGG	2	6	2412148	2412153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_017270	CT	3	6	2412158	2412163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10044	NC_017270	C	6	6	2412187	2412192	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10045	NC_017270	TCC	2	6	2412232	2412237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_017270	CGG	2	6	2412306	2412311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_017270	A	7	7	2412411	2412417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_017270	AGC	2	6	2412427	2412432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_017270	TCAA	2	8	2412440	2412447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10050	NC_017270	TCTA	2	8	2413950	2413957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10051	NC_017270	GTT	2	6	2413958	2413963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_017270	ACA	2	6	2414089	2414094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_017270	GAC	2	6	2414186	2414191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_017270	GTAA	2	8	2414217	2414224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_017270	GACAGT	2	12	2414269	2414280	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10056	NC_017270	AC	3	6	2414342	2414347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10057	NC_017270	TTC	2	6	2414473	2414478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_017270	CAGC	2	8	2414486	2414493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_017270	ACC	2	6	2414545	2414550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10060	NC_017270	TTC	2	6	2414593	2414598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_017270	CGT	2	6	2414615	2414620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_017270	CAGA	2	8	2414621	2414628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10063	NC_017270	ATG	2	6	2414677	2414682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_017270	CGCTT	2	10	2414716	2414725	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10065	NC_017270	ATC	2	6	2414800	2414805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_017270	GCC	2	6	2414944	2414949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_017270	GC	3	6	2414954	2414959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10068	NC_017270	CTT	2	6	2414981	2414986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_017270	TCT	2	6	2415004	2415009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_017270	GAC	2	6	2415077	2415082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_017270	ACT	2	6	2415085	2415090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_017270	TTG	2	6	2415134	2415139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_017270	GCC	2	6	2415148	2415153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10074	NC_017270	GCT	2	6	2415163	2415168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_017270	GGTGCT	2	12	2415187	2415198	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10076	NC_017270	GCT	3	9	2415196	2415204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_017270	CCG	2	6	2415430	2415435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10078	NC_017270	CTT	2	6	2415452	2415457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_017270	TGC	2	6	2415462	2415467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_017270	AGC	2	6	2415477	2415482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_017270	GGC	3	9	2415483	2415491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_017270	TGC	2	6	2415513	2415518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_017270	ACTTCA	2	12	2415715	2415726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_017270	CAC	2	6	2415728	2415733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10085	NC_017270	CTT	2	6	2415752	2415757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_017270	GCA	2	6	2415781	2415786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_017270	TGC	2	6	2415792	2415797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_017270	GCT	2	6	2415825	2415830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_017270	AG	3	6	2415858	2415863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_017270	ACT	2	6	2415888	2415893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_017270	GTTG	2	8	2418762	2418769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_017270	TTC	2	6	2419575	2419580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_017270	TTC	2	6	2419589	2419594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_017270	CAA	2	6	2419713	2419718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_017270	GAA	2	6	2419817	2419822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_017270	T	6	6	2419832	2419837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_017270	T	6	6	2419858	2419863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_017270	AGG	2	6	2419889	2419894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_017270	ATC	2	6	2419902	2419907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_017270	TCG	2	6	2419909	2419914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_017270	TTA	2	6	2419995	2420000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_017270	TTAG	2	8	2420006	2420013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_017270	TGAC	2	8	2420040	2420047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10104	NC_017270	GA	3	6	2421977	2421982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_017270	GTT	2	6	2421987	2421992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_017270	GA	3	6	2423700	2423705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_017270	AGCTCT	2	12	2425483	2425494	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_017270	CAGA	2	8	2425591	2425598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10109	NC_017270	ATT	2	6	2425604	2425609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_017270	C	6	6	2426196	2426201	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10111	NC_017270	GGGA	2	8	2426213	2426220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_017270	GAAC	2	8	2426947	2426954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10113	NC_017270	GCCA	2	8	2427056	2427063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10114	NC_017270	GGTTT	2	10	2427076	2427085	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_017270	AGG	2	6	2428047	2428052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_017270	CCT	2	6	2428060	2428065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10117	NC_017270	T	6	6	2428119	2428124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_017270	TCA	2	6	2428129	2428134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_017270	ACTC	2	8	2428160	2428167	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_017270	C	6	6	2428190	2428195	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10121	NC_017270	TAACC	2	10	2430034	2430043	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10122	NC_017270	GC	3	6	2431317	2431322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10123	NC_017270	TGA	2	6	2433676	2433681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_017270	CA	3	6	2433692	2433697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_017270	GCT	2	6	2433733	2433738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_017270	A	6	6	2433763	2433768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_017270	AAAG	2	8	2433956	2433963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_017270	CTC	2	6	2433977	2433982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10129	NC_017270	ATA	2	6	2438155	2438160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10254	NC_017270	TGCTT	2	10	2491947	2491956	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10255	NC_017270	CAAC	2	8	2492061	2492068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10257	NC_017270	GGTT	2	8	2494361	2494368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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