MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio anguillarum 775 chromosome I

Total Repeats: 8335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015633	ATG	2	6	2946859	2946864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_015633	TTC	2	6	2947934	2947939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_015633	AGA	2	6	2947958	2947963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_015633	TG	3	6	2948087	2948092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_015633	ATT	2	6	2954291	2954296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_015633	TA	3	6	2954767	2954772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_015633	ATAAA	2	10	2954838	2954847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_015633	TTAC	2	8	2954866	2954873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8009	NC_015633	TC	3	6	2955360	2955365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8010	NC_015633	TTA	2	6	2955983	2955988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_015633	TAT	2	6	2955994	2955999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_015633	TA	3	6	2967564	2967569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_015633	A	6	6	2967569	2967574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_015633	T	6	6	2967592	2967597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_015633	CAT	2	6	2968162	2968167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_015633	T	6	6	2968273	2968278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_015633	TTTA	2	8	2968348	2968355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_015633	GTG	2	6	2969121	2969126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_015633	AAATAA	2	12	2969175	2969186	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_015633	T	7	7	2970155	2970161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_015633	A	7	7	2973057	2973063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_015633	GTAAA	2	10	2973066	2973075	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_015633	A	6	6	2974909	2974914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_015633	ATA	2	6	2976407	2976412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_015633	AACTG	2	10	2976996	2977005	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8026	NC_015633	TCAAGC	2	12	2977022	2977033	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_015633	CAAG	2	8	2977049	2977056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8028	NC_015633	AGTC	2	8	2977071	2977078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8029	NC_015633	AAAC	2	8	2977201	2977208	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8030	NC_015633	GA	3	6	2977243	2977248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_015633	CAA	2	6	2977317	2977322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_015633	CTA	2	6	2977336	2977341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_015633	ACT	2	6	2977370	2977375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_015633	CGA	2	6	2977376	2977381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_015633	TAA	3	9	2977414	2977422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_015633	AAT	2	6	2977460	2977465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_015633	T	6	6	2977495	2977500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_015633	AGT	2	6	2977521	2977526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_015633	TATT	2	8	2977572	2977579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_015633	ATCA	2	8	2977651	2977658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8041	NC_015633	TGAT	2	8	2977709	2977716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_015633	AAC	2	6	2977726	2977731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_015633	TCAGCA	2	12	2977734	2977745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_015633	T	8	8	2977778	2977785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_015633	ATTTT	2	10	2979017	2979026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_015633	AATG	2	8	2979074	2979081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_015633	AGA	2	6	2979093	2979098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_015633	TCA	2	6	2979229	2979234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_015633	TGA	2	6	2979242	2979247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_015633	CT	3	6	2979303	2979308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8051	NC_015633	AGT	2	6	2980735	2980740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_015633	A	6	6	2980753	2980758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_015633	T	6	6	2980780	2980785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_015633	CTC	2	6	2986015	2986020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_015633	A	6	6	2986046	2986051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_015633	TGA	2	6	2986153	2986158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_015633	AAAG	2	8	2986176	2986183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_015633	CA	3	6	2986205	2986210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8059	NC_015633	AACA	2	8	2986239	2986246	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8060	NC_015633	ATT	2	6	2986256	2986261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_015633	GAA	2	6	2986262	2986267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_015633	TG	3	6	2986351	2986356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_015633	AGA	2	6	2986369	2986374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_015633	A	6	6	2986391	2986396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_015633	AGAA	2	8	2986418	2986425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_015633	CTT	2	6	2986447	2986452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_015633	GCGGA	2	10	2986461	2986470	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8068	NC_015633	TGT	2	6	2986617	2986622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_015633	CA	3	6	2986718	2986723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8070	NC_015633	TTC	2	6	2986731	2986736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_015633	AC	3	6	2986823	2986828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8072	NC_015633	AAC	2	6	2986854	2986859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_015633	AGC	2	6	2987022	2987027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_015633	ACG	2	6	2987076	2987081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_015633	TGA	2	6	2987156	2987161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_015633	CCG	2	6	2987184	2987189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8077	NC_015633	ACC	2	6	2987271	2987276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_015633	CTC	2	6	2987390	2987395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_015633	GAG	2	6	2987409	2987414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_015633	CCA	2	6	2987434	2987439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8081	NC_015633	GGT	2	6	2987494	2987499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_015633	GTA	2	6	2987591	2987596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_015633	ATTTCA	2	12	2987650	2987661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8084	NC_015633	CAT	2	6	2987689	2987694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_015633	GCC	2	6	2987764	2987769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8086	NC_015633	TAA	2	6	2987891	2987896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_015633	TC	3	6	2988018	2988023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8088	NC_015633	ACC	2	6	2988048	2988053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8089	NC_015633	AGC	2	6	2988138	2988143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_015633	CGT	2	6	2988148	2988153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_015633	C	6	6	2988248	2988253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8092	NC_015633	CGG	2	6	2988375	2988380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_015633	C	6	6	2988393	2988398	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8094	NC_015633	ACA	2	6	2988450	2988455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_015633	TAC	2	6	2988523	2988528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_015633	CTTT	2	8	2988581	2988588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8097	NC_015633	ATG	2	6	2988591	2988596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_015633	GCT	2	6	2988597	2988602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_015633	TAG	2	6	2988652	2988657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_015633	GTT	2	6	2988686	2988691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_015633	ACG	2	6	2988701	2988706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_015633	GT	3	6	2988723	2988728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_015633	TACT	2	8	2988740	2988747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8104	NC_015633	AGT	2	6	2988816	2988821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_015633	TCGGT	2	10	2988931	2988940	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8106	NC_015633	CAC	2	6	2989118	2989123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8107	NC_015633	GTAC	2	8	2989143	2989150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8108	NC_015633	GTCA	2	8	2989226	2989233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8109	NC_015633	GTA	2	6	2989234	2989239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_015633	GGA	2	6	2989249	2989254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_015633	C	6	6	2989259	2989264	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8112	NC_015633	ATG	2	6	2989314	2989319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_015633	CAT	2	6	2989375	2989380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_015633	TCGC	2	8	2989406	2989413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8115	NC_015633	TCT	2	6	2989440	2989445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_015633	CCT	2	6	2989483	2989488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8117	NC_015633	TAC	2	6	2989596	2989601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_015633	GAA	2	6	2989668	2989673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_015633	TC	3	6	2989705	2989710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8120	NC_015633	ATT	2	6	2989711	2989716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_015633	GA	3	6	2989726	2989731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_015633	GTA	2	6	2989769	2989774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_015633	AAC	2	6	2989850	2989855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_015633	TGT	2	6	2989865	2989870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_015633	TCAG	2	8	2989873	2989880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8126	NC_015633	TGG	2	6	2989957	2989962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_015633	CATGC	2	10	2989994	2990003	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8128	NC_015633	TC	3	6	2990037	2990042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8129	NC_015633	TG	3	6	2990066	2990071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_015633	TCA	2	6	2990077	2990082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8132	NC_015633	GTG	2	6	2990170	2990175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8257	NC_015633	CTTC	2	8	3027746	3027753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.