MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vulcanisaeta moutnovskia 768-28 chromosome

Total Repeats: 6626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015151	A	6	6	2261075	2261080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_015151	TA	3	6	2261107	2261112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_015151	ATT	2	6	2261124	2261129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_015151	ATA	2	6	2261163	2261168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_015151	ATA	2	6	2261260	2261265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_015151	TTA	2	6	2261300	2261305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_015151	TTA	2	6	2261307	2261312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_015151	TAAA	2	8	2261323	2261330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_015151	TTA	2	6	2262928	2262933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_015151	TAT	2	6	2262955	2262960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_015151	ATT	2	6	2262975	2262980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_015151	TA	3	6	2262981	2262986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_015151	TAA	2	6	2263005	2263010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_015151	AAT	3	9	2263011	2263019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_015151	TAA	2	6	2263385	2263390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_015151	TAA	2	6	2264354	2264359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_015151	TGA	3	9	2264381	2264389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_015151	GAT	2	6	2264408	2264413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_015151	TCA	2	6	2264478	2264483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_015151	ATT	2	6	2264523	2264528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_015151	GA	3	6	2265379	2265384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_015151	T	6	6	2265390	2265395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_015151	CAT	2	6	2265435	2265440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_015151	A	6	6	2266978	2266983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_015151	TAA	2	6	2266990	2266995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_015151	TAA	2	6	2268257	2268262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_015151	ATC	2	6	2269748	2269753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_015151	TAA	2	6	2269800	2269805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_015151	GAGG	2	8	2269824	2269831	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_015151	ATG	2	6	2269879	2269884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_015151	GCG	2	6	2269926	2269931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_015151	AGATA	2	10	2269943	2269952	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_015151	CAA	2	6	2270045	2270050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_015151	TGACAT	2	12	2270084	2270095	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6535	NC_015151	GAT	2	6	2270175	2270180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_015151	TAA	2	6	2270209	2270214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_015151	GAA	2	6	2270234	2270239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_015151	CCGG	2	8	2270380	2270387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6539	NC_015151	CGTT	2	8	2270395	2270402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6540	NC_015151	TC	3	6	2270404	2270409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6541	NC_015151	TAT	2	6	2270423	2270428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_015151	ATTTA	2	10	2270429	2270438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_015151	CTT	2	6	2270440	2270445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_015151	ATG	2	6	2270450	2270455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_015151	TTTTA	2	10	2270478	2270487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_015151	TAAC	2	8	2270555	2270562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6547	NC_015151	AGT	2	6	2270564	2270569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_015151	TAT	2	6	2270607	2270612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_015151	TTTA	2	8	2270891	2270898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_015151	TAA	2	6	2272276	2272281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_015151	ATT	2	6	2272285	2272290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_015151	ATA	2	6	2272297	2272302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_015151	TAA	2	6	2272318	2272323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_015151	TTTTA	2	10	2272928	2272937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_015151	GGT	2	6	2272997	2273002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_015151	TAAG	2	8	2273014	2273021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_015151	TTGT	2	8	2273343	2273350	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_015151	TAA	2	6	2274432	2274437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_015151	TTA	2	6	2274438	2274443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_015151	ATT	2	6	2275668	2275673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_015151	AAT	2	6	2275679	2275684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_015151	CAC	2	6	2277875	2277880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6563	NC_015151	AACT	2	8	2277892	2277899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6564	NC_015151	ATT	2	6	2277910	2277915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_015151	TAA	2	6	2281402	2281407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_015151	TAA	2	6	2281963	2281968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_015151	TAAATA	2	12	2286879	2286890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_015151	AAAAT	2	10	2287191	2287200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_015151	TACT	2	8	2287245	2287252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6570	NC_015151	TAA	2	6	2290580	2290585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_015151	TTAAAA	2	12	2290599	2290610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_015151	TGA	2	6	2290639	2290644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_015151	GAT	2	6	2290656	2290661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_015151	GAA	2	6	2290662	2290667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_015151	GAA	2	6	2290690	2290695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_015151	TCT	2	6	2295423	2295428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_015151	TGTT	2	8	2295814	2295821	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_015151	GATTT	2	10	2295841	2295850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_015151	T	6	6	2295848	2295853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_015151	CACCC	2	10	2295870	2295879	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6581	NC_015151	AAT	2	6	2296619	2296624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_015151	AAC	2	6	2296650	2296655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_015151	TTAAC	2	10	2296723	2296732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6584	NC_015151	TTA	2	6	2296757	2296762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_015151	TCAA	2	8	2296767	2296774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6586	NC_015151	TCC	2	6	2296778	2296783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6587	NC_015151	ACA	2	6	2296811	2296816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_015151	ATG	2	6	2296948	2296953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_015151	GAA	2	6	2296980	2296985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_015151	TGCC	2	8	2297001	2297008	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6591	NC_015151	TC	3	6	2297022	2297027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6592	NC_015151	CAC	2	6	2297088	2297093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6593	NC_015151	AGT	2	6	2297107	2297112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_015151	TTA	2	6	2297165	2297170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_015151	ATT	2	6	2297194	2297199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_015151	GACA	2	8	2297238	2297245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6597	NC_015151	CTT	2	6	2297256	2297261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_015151	TGG	2	6	2297385	2297390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_015151	ACA	2	6	2297426	2297431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_015151	AATA	2	8	2297526	2297533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_015151	ATCC	2	8	2297557	2297564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6602	NC_015151	CCT	2	6	2297599	2297604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_015151	ATC	2	6	2297611	2297616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_015151	TGT	2	6	2297656	2297661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_015151	TTA	2	6	2297921	2297926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_015151	AAT	2	6	2297983	2297988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_015151	ATT	2	6	2297994	2297999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_015151	TA	3	6	2298021	2298026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_015151	TATAAC	2	12	2298036	2298047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6610	NC_015151	AGGA	2	8	2298102	2298109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_015151	GGT	2	6	2298205	2298210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_015151	AAG	2	6	2298268	2298273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_015151	ATG	2	6	2298278	2298283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_015151	AAT	2	6	2298310	2298315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_015151	TGA	2	6	2298357	2298362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_015151	ATA	2	6	2298454	2298459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_015151	ATC	2	6	2298465	2298470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_015151	AGCCCT	2	12	2298549	2298560	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6619	NC_015151	GAG	2	6	2298643	2298648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_015151	GAT	2	6	2298657	2298662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_015151	ATA	2	6	2298670	2298675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_015151	TAA	2	6	2298764	2298769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_015151	TTG	2	6	2298770	2298775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_015151	AAAAC	2	10	2298827	2298836	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6625	NC_015151	TAA	2	6	2298851	2298856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_015151	ATA	2	6	2298902	2298907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.