MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014931	T	7	7	5825533	5825539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_014931	CGG	2	6	5825564	5825569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_014931	AAAG	2	8	5825595	5825602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_014931	AAAG	2	8	5825610	5825617	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_014931	CTG	2	6	5825624	5825629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_014931	GCTTC	2	10	5825643	5825652	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11007	NC_014931	CGCTC	2	10	5825735	5825744	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11008	NC_014931	CGG	2	6	5825842	5825847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_014931	ACC	2	6	5825854	5825859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11010	NC_014931	CAG	2	6	5825926	5825931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_014931	A	7	7	5825936	5825942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_014931	ACG	2	6	5825958	5825963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_014931	ACCCC	2	10	5826018	5826027	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11014	NC_014931	GAG	2	6	5826041	5826046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_014931	AGCGA	2	10	5826083	5826092	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11016	NC_014931	AGCGA	2	10	5826138	5826147	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11017	NC_014931	AAAG	2	8	5826204	5826211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_014931	A	6	6	5826246	5826251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_014931	TTG	2	6	5828153	5828158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_014931	GGTG	2	8	5828209	5828216	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_014931	CTT	2	6	5828244	5828249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_014931	CAC	2	6	5828304	5828309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11023	NC_014931	TG	3	6	5828311	5828316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_014931	CCCGG	2	10	5828346	5828355	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11025	NC_014931	GC	3	6	5830715	5830720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11026	NC_014931	GGCGC	2	10	5830752	5830761	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11027	NC_014931	GCC	2	6	5831553	5831558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11028	NC_014931	CGA	2	6	5833086	5833091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_014931	GCC	2	6	5833096	5833101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11030	NC_014931	TGC	2	6	5833103	5833108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_014931	GCC	2	6	5833109	5833114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11032	NC_014931	GTC	2	6	5833118	5833123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_014931	CTGT	2	8	5833124	5833131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11034	NC_014931	TTG	2	6	5836438	5836443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_014931	GC	3	6	5836467	5836472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11036	NC_014931	GCCG	2	8	5836486	5836493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11037	NC_014931	TGC	2	6	5836494	5836499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_014931	CTT	2	6	5837694	5837699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_014931	CCGG	2	8	5839576	5839583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11040	NC_014931	CAG	2	6	5840829	5840834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_014931	CGC	2	6	5840840	5840845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11042	NC_014931	CGG	2	6	5841980	5841985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_014931	CGCGG	2	10	5844208	5844217	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11044	NC_014931	GAAA	2	8	5845064	5845071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_014931	CG	3	6	5845124	5845129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11046	NC_014931	CG	3	6	5845167	5845172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11047	NC_014931	TCA	2	6	5848965	5848970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_014931	AGC	2	6	5851605	5851610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_014931	GCGCC	2	10	5852540	5852549	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11050	NC_014931	GCC	2	6	5852552	5852557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11051	NC_014931	CAAG	2	8	5852559	5852566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11052	NC_014931	TCGA	2	8	5853574	5853581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11053	NC_014931	TTCC	2	8	5854583	5854590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_014931	GCG	2	6	5856448	5856453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_014931	CGA	2	6	5856551	5856556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_014931	GCG	2	6	5856559	5856564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_014931	CTG	2	6	5856642	5856647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_014931	GC	3	6	5856654	5856659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11059	NC_014931	CGCAG	2	10	5856682	5856691	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11060	NC_014931	GCGA	2	8	5856730	5856737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11061	NC_014931	ACG	2	6	5856781	5856786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_014931	GTC	3	9	5858931	5858939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_014931	GCG	2	6	5859892	5859897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_014931	CGGG	2	8	5859950	5859957	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11065	NC_014931	GCCG	2	8	5859960	5859967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11066	NC_014931	ACC	2	6	5859996	5860001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_014931	GGCC	2	8	5860002	5860009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11068	NC_014931	GCG	2	6	5863924	5863929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_014931	CGGCA	2	10	5863974	5863983	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11070	NC_014931	GAG	2	6	5865726	5865731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_014931	GTCT	2	8	5868801	5868808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11072	NC_014931	CTT	2	6	5868838	5868843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_014931	CG	4	8	5868863	5868870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11074	NC_014931	CGG	2	6	5868903	5868908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_014931	CGC	2	6	5868948	5868953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11076	NC_014931	GC	3	6	5868952	5868957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11077	NC_014931	TGAT	2	8	5869883	5869890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_014931	CAG	2	6	5874576	5874581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_014931	CCG	2	6	5874613	5874618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11080	NC_014931	CGGCA	2	10	5876793	5876802	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11081	NC_014931	AC	3	6	5876842	5876847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11082	NC_014931	GCG	2	6	5876882	5876887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_014931	GCCCAT	2	12	5876913	5876924	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11084	NC_014931	GC	3	6	5876925	5876930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11085	NC_014931	CCGG	2	8	5878970	5878977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11086	NC_014931	CAC	2	6	5879014	5879019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11087	NC_014931	AC	3	6	5879085	5879090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11088	NC_014931	GC	3	6	5881836	5881841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11089	NC_014931	CGC	2	6	5882884	5882889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11090	NC_014931	CGA	4	12	5884539	5884550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_014931	CAA	2	6	5889232	5889237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_014931	CAA	2	6	5889833	5889838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_014931	GCA	2	6	5889872	5889877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_014931	ATCG	2	8	5889905	5889912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11095	NC_014931	GA	4	8	5891909	5891916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_014931	TGG	2	6	5892860	5892865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_014931	TCGAT	2	10	5895623	5895632	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11098	NC_014931	A	6	6	5895665	5895670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_014931	ATC	2	6	5895748	5895753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_014931	TCA	2	6	5895815	5895820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_014931	GCTT	2	8	5895901	5895908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11102	NC_014931	TGA	2	6	5895951	5895956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_014931	GT	3	6	5896190	5896195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_014931	ACG	2	6	5896274	5896279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_014931	GATGA	2	10	5896350	5896359	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_014931	CCG	2	6	5896382	5896387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11107	NC_014931	ACC	2	6	5896469	5896474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11108	NC_014931	CTC	2	6	5896588	5896593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11109	NC_014931	GAG	2	6	5896607	5896612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_014931	AC	3	6	5896683	5896688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11111	NC_014931	GGT	2	6	5896692	5896697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_014931	CAT	2	6	5896835	5896840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_014931	AGG	2	6	5896869	5896874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_014931	GCC	2	6	5896962	5896967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11115	NC_014931	TCAA	2	8	5896981	5896988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11116	NC_014931	CAT	2	6	5897001	5897006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_014931	TAA	2	6	5897078	5897083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_014931	T	6	6	5897101	5897106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_014931	GTT	2	6	5897125	5897130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_014931	AC	3	6	5897135	5897140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11121	NC_014931	CTT	2	6	5897154	5897159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_014931	TC	3	6	5897202	5897207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11123	NC_014931	TA	3	6	5897261	5897266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_014931	AAT	2	6	5897392	5897397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_014931	TA	3	6	5897441	5897446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_014931	ACTC	2	8	5897510	5897517	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11127	NC_014931	GAC	2	6	5897735	5897740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_014931	CTTT	2	8	5897761	5897768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11129	NC_014931	ATG	2	6	5897771	5897776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_014931	GCT	2	6	5897777	5897782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11131	NC_014931	GTT	2	6	5897866	5897871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11253	NC_014931	CG	3	6	5950556	5950561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11254	NC_014931	CAA	2	6	5950584	5950589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11255	NC_014931	CG	3	6	5950620	5950625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11256	NC_014931	GCG	2	6	5951382	5951387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11390	NC_014931	A	6	6	6038416	6038421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11395	NC_014931	CAATGG	2	12	6046235	6046246	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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11433	NC_014931	A	6	6	6063044	6063049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11500	NC_014931	T	7	7	6094521	6094527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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