MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_014931	TCG	2	6	5582613	5582618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_014931	TCA	2	6	5584496	5584501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_014931	CGT	2	6	5584525	5584530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_014931	ACC	2	6	5584600	5584605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10505	NC_014931	TTGAA	2	10	5585004	5585013	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_014931	GCTG	2	8	5585577	5585584	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10507	NC_014931	CAA	2	6	5585637	5585642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_014931	TCA	2	6	5585680	5585685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_014931	TCGCG	2	10	5585723	5585732	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10510	NC_014931	AAG	2	6	5585751	5585756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_014931	AGC	2	6	5585826	5585831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_014931	T	6	6	5585837	5585842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_014931	AAC	2	6	5585845	5585850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_014931	ACT	2	6	5585895	5585900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_014931	TGC	2	6	5585920	5585925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_014931	C	6	6	5585940	5585945	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10517	NC_014931	GC	3	6	5585964	5585969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10518	NC_014931	CCG	2	6	5586026	5586031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10519	NC_014931	CGAG	2	8	5586078	5586085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10520	NC_014931	CTGG	2	8	5586209	5586216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10521	NC_014931	ATG	2	6	5586246	5586251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_014931	CTCC	2	8	5586268	5586275	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10523	NC_014931	TGC	2	6	5586412	5586417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_014931	ACG	2	6	5586441	5586446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_014931	GCAA	2	8	5586552	5586559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10526	NC_014931	GGT	2	6	5586580	5586585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_014931	CGC	2	6	5586668	5586673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10528	NC_014931	GAT	2	6	5587034	5587039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_014931	TG	3	6	5587040	5587045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_014931	GCT	2	6	5587073	5587078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_014931	CGC	2	6	5587149	5587154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10532	NC_014931	CTT	2	6	5588211	5588216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_014931	GCG	2	6	5588267	5588272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_014931	ACTG	2	8	5588273	5588280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10535	NC_014931	CTG	2	6	5588286	5588291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_014931	GCTGTT	10	60	5588294	5588353	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10537	NC_014931	GAC	2	6	5591980	5591985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_014931	AG	3	6	5592030	5592035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_014931	GGCC	2	8	5592851	5592858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10540	NC_014931	CGT	2	6	5592871	5592876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10541	NC_014931	AGAGGG	2	12	5592899	5592910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_014931	TGA	2	6	5593954	5593959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_014931	CAC	2	6	5593965	5593970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10544	NC_014931	GTCC	2	8	5594017	5594024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10545	NC_014931	GCCC	2	8	5594044	5594051	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10546	NC_014931	GCC	2	6	5594068	5594073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10547	NC_014931	CGGC	2	8	5594608	5594615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10548	NC_014931	GGT	2	6	5594627	5594632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_014931	CAG	2	6	5594645	5594650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_014931	ACC	2	6	5594667	5594672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10551	NC_014931	AAG	2	6	5594688	5594693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_014931	GCCGA	2	10	5594708	5594717	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10553	NC_014931	ACC	2	6	5594718	5594723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10554	NC_014931	TGC	2	6	5594728	5594733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_014931	GCG	2	6	5594743	5594748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_014931	T	7	7	5594773	5594779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_014931	GCC	2	6	5594794	5594799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10558	NC_014931	ACG	2	6	5594842	5594847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_014931	TGCC	2	8	5594894	5594901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10560	NC_014931	GAC	2	6	5597609	5597614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_014931	C	6	6	5597625	5597630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10562	NC_014931	T	6	6	5597641	5597646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_014931	C	6	6	5597735	5597740	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10564	NC_014931	CG	3	6	5597744	5597749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10565	NC_014931	TCCC	2	8	5597768	5597775	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10566	NC_014931	AAC	2	6	5597833	5597838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_014931	AGG	2	6	5597869	5597874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_014931	GCC	2	6	5597878	5597883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10569	NC_014931	GTT	2	6	5597987	5597992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_014931	CTC	2	6	5597998	5598003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10571	NC_014931	GCT	2	6	5598245	5598250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_014931	GGC	2	6	5598326	5598331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_014931	CTG	3	9	5598408	5598416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10574	NC_014931	GCT	2	6	5598423	5598428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_014931	TGGG	2	8	5598477	5598484	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_014931	TGT	2	6	5598595	5598600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_014931	CTG	2	6	5598613	5598618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10578	NC_014931	GC	3	6	5598648	5598653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10579	NC_014931	TAGC	2	8	5598720	5598727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10580	NC_014931	GCT	2	6	5598747	5598752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10581	NC_014931	TCG	2	6	5598755	5598760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10582	NC_014931	CCT	2	6	5598779	5598784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10583	NC_014931	CGC	2	6	5598791	5598796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10584	NC_014931	CAGC	2	8	5599788	5599795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10585	NC_014931	AAGA	2	8	5599809	5599816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_014931	CGC	2	6	5601225	5601230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10587	NC_014931	CGT	2	6	5606761	5606766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10588	NC_014931	AAG	2	6	5606893	5606898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_014931	GAC	2	6	5606947	5606952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10590	NC_014931	CGAGTA	2	12	5606964	5606975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10591	NC_014931	CA	3	6	5607009	5607014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10592	NC_014931	CGGGAG	2	12	5607168	5607179	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10593	NC_014931	GCC	2	6	5607189	5607194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10594	NC_014931	GCTA	2	8	5610386	5610393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10595	NC_014931	C	7	7	5610398	5610404	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10596	NC_014931	GGGA	2	8	5611890	5611897	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_014931	GGGA	2	8	5611913	5611920	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_014931	GGGA	2	8	5611936	5611943	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_014931	GGA	2	6	5611960	5611965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_014931	GGGA	2	8	5611983	5611990	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_014931	TGG	2	6	5612011	5612016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_014931	CCA	2	6	5612041	5612046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10603	NC_014931	GTG	2	6	5612109	5612114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_014931	CGA	2	6	5612115	5612120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_014931	GTG	2	6	5612137	5612142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_014931	CGA	2	6	5612143	5612148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_014931	GTG	2	6	5612165	5612170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_014931	GCAG	2	8	5615122	5615129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10609	NC_014931	CGT	2	6	5616962	5616967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10610	NC_014931	CGTC	2	8	5620455	5620462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10611	NC_014931	ATCT	2	8	5620463	5620470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10612	NC_014931	GCT	2	6	5620477	5620482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_014931	ACG	2	6	5620486	5620491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10614	NC_014931	GGCC	2	8	5621075	5621082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10615	NC_014931	TGC	2	6	5621091	5621096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10616	NC_014931	CT	3	6	5621104	5621109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10617	NC_014931	GCG	2	6	5625297	5625302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10618	NC_014931	GCC	2	6	5625306	5625311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10619	NC_014931	T	7	7	5625542	5625548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_014931	AGG	2	6	5625588	5625593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_014931	TGC	2	6	5625659	5625664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10622	NC_014931	GC	3	6	5625673	5625678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10623	NC_014931	TCC	2	6	5625698	5625703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10624	NC_014931	CT	3	6	5625718	5625723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10625	NC_014931	TCT	3	9	5625721	5625729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10626	NC_014931	CAT	2	6	5627199	5627204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10628	NC_014931	CG	3	6	5628648	5628653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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