MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014931	GC	3	6	5317929	5317934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10002	NC_014931	TAA	2	6	5318007	5318012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_014931	GCG	2	6	5319069	5319074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_014931	CGC	2	6	5319075	5319080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10005	NC_014931	GGTGG	2	10	5320332	5320341	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_014931	GAG	2	6	5323372	5323377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_014931	CTC	2	6	5324180	5324185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10008	NC_014931	TG	4	8	5324216	5324223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_014931	GGGC	2	8	5324241	5324248	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10010	NC_014931	GC	3	6	5324285	5324290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_014931	GAA	2	6	5326236	5326241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_014931	GCAT	2	8	5327518	5327525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10013	NC_014931	GCG	2	6	5327526	5327531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_014931	GC	3	6	5327538	5327543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_014931	GCC	2	6	5327589	5327594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10016	NC_014931	AAG	2	6	5327601	5327606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_014931	ACC	2	6	5327658	5327663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_014931	GGTGC	2	10	5327706	5327715	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10019	NC_014931	TAAAAA	2	12	5328089	5328100	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_014931	A	7	7	5328109	5328115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_014931	C	6	6	5329774	5329779	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10022	NC_014931	A	6	6	5336891	5336896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_014931	TCG	2	6	5336905	5336910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_014931	GAA	2	6	5336918	5336923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_014931	GCA	2	6	5336943	5336948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_014931	ATGA	2	8	5336971	5336978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_014931	TTC	2	6	5337940	5337945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_014931	TGT	3	9	5337947	5337955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_014931	T	6	6	5337975	5337980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_014931	GCA	2	6	5338151	5338156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_014931	GCA	2	6	5338164	5338169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_014931	GTC	2	6	5338171	5338176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_014931	CTG	2	6	5338812	5338817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_014931	GCT	2	6	5338836	5338841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_014931	GAC	2	6	5338866	5338871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_014931	AC	3	6	5338999	5339004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10037	NC_014931	GAGT	2	8	5339984	5339991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_014931	GGC	2	6	5339993	5339998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_014931	TTC	2	6	5340106	5340111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_014931	GC	3	6	5340133	5340138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10041	NC_014931	GC	3	6	5340162	5340167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_014931	CA	3	6	5340188	5340193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_014931	TTC	3	9	5340194	5340202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_014931	GAAG	2	8	5342369	5342376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_014931	GAAC	2	8	5342381	5342388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10046	NC_014931	CGG	2	6	5352822	5352827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_014931	CTT	2	6	5354438	5354443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_014931	GGT	2	6	5355698	5355703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_014931	CG	3	6	5357384	5357389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_014931	GCG	2	6	5357409	5357414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_014931	CTC	2	6	5359652	5359657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_014931	TTGA	2	8	5359669	5359676	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_014931	AGG	2	6	5359697	5359702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_014931	CG	3	6	5360882	5360887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10055	NC_014931	AGG	2	6	5362499	5362504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_014931	CGG	2	6	5362507	5362512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_014931	TTG	2	6	5363257	5363262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_014931	TTC	2	6	5363263	5363268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_014931	AATGA	2	10	5363276	5363285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_014931	CGG	2	6	5363308	5363313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_014931	ACG	2	6	5363320	5363325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_014931	GAGC	2	8	5363338	5363345	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10063	NC_014931	AGA	2	6	5363395	5363400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_014931	AAAC	2	8	5363479	5363486	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10065	NC_014931	CAA	2	6	5363494	5363499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10067	NC_014931	CG	3	6	5364602	5364607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10068	NC_014931	GGA	2	6	5364630	5364635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_014931	AAC	3	9	5364637	5364645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10073	NC_014931	TGA	2	6	5366442	5366447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_014931	CAA	2	6	5366455	5366460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_014931	A	6	6	5366475	5366480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10077	NC_014931	ACCGC	2	10	5367052	5367061	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10078	NC_014931	CAC	2	6	5367078	5367083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10079	NC_014931	TGAA	2	8	5370342	5370349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_014931	CAA	2	6	5370413	5370418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_014931	TTG	2	6	5370639	5370644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10084	NC_014931	A	8	8	5370743	5370750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_014931	ATT	2	6	5370789	5370794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_014931	AAT	2	6	5370807	5370812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_014931	GCT	2	6	5370816	5370821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_014931	AGAA	2	8	5370829	5370836	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_014931	GC	3	6	5370846	5370851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10093	NC_014931	TTC	2	6	5372616	5372621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_014931	GAA	2	6	5372630	5372635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_014931	CGT	2	6	5372695	5372700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10097	NC_014931	GCCAAG	2	12	5372773	5372784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_014931	GATC	2	8	5372825	5372832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10099	NC_014931	GCGG	2	8	5372851	5372858	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10100	NC_014931	GC	3	6	5372913	5372918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_014931	CGGC	2	8	5375151	5375158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_014931	CG	3	6	5375180	5375185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_014931	TC	3	6	5376105	5376110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_014931	GAC	2	6	5376131	5376136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10107	NC_014931	ACGC	2	8	5378817	5378824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_014931	GC	3	6	5378823	5378828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10109	NC_014931	AAG	2	6	5378865	5378870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_014931	CGG	2	6	5378890	5378895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_014931	ACC	2	6	5378922	5378927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_014931	GCT	2	6	5378960	5378965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_014931	GC	4	8	5378999	5379006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10114	NC_014931	CGG	2	6	5379039	5379044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10116	NC_014931	CCG	2	6	5379078	5379083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10117	NC_014931	CG	3	6	5379617	5379622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10118	NC_014931	TGCGA	2	10	5379623	5379632	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10119	NC_014931	GGCGC	2	10	5379651	5379660	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10120	NC_014931	CTC	2	6	5379689	5379694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10122	NC_014931	GGA	2	6	5380613	5380618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_014931	A	6	6	5380668	5380673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_014931	TCG	2	6	5380729	5380734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_014931	CTG	2	6	5380748	5380753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_014931	GATC	2	8	5382682	5382689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10127	NC_014931	GGA	2	6	5382730	5382735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_014931	GC	3	6	5383502	5383507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10130	NC_014931	ACCG	2	8	5387100	5387107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10251	NC_014931	AGTG	2	8	5492401	5492408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10255	NC_014931	ATAG	2	8	5492579	5492586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_014931	TAG	2	6	5492658	5492663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_014931	AAG	2	6	5492703	5492708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10260	NC_014931	CGG	2	6	5492921	5492926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10261	NC_014931	GGCC	2	8	5492938	5492945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10262	NC_014931	CCGG	2	8	5492975	5492982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10263	NC_014931	CCAT	2	8	5493080	5493087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10264	NC_014931	GCG	2	6	5493095	5493100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10273	NC_014931	TTGT	2	8	5500777	5500784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10282	NC_014931	CCG	2	6	5507061	5507066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10287	NC_014931	TCCC	2	8	5507761	5507768	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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10293	NC_014931	A	6	6	5516391	5516396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10301	NC_014931	CGG	2	6	5521526	5521531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10322	NC_014931	GAC	2	6	5527973	5527978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10328	NC_014931	GCAG	2	8	5533268	5533275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10347	NC_014931	GGC	2	6	5536133	5536138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10352	NC_014931	CCT	2	6	5539246	5539251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10355	NC_014931	C	6	6	5539310	5539315	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10356	NC_014931	AC	4	8	5539320	5539327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10357	NC_014931	AACCGC	2	12	5540448	5540459	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10358	NC_014931	CCTT	2	8	5540477	5540484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10359	NC_014931	ACG	2	6	5543495	5543500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10360	NC_014931	CCG	2	6	5543506	5543511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10362	NC_014931	CG	3	6	5545051	5545056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10363	NC_014931	CCG	2	6	5545083	5545088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10369	NC_014931	TA	3	6	5548371	5548376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10370	NC_014931	AAT	2	6	5548381	5548386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10371	NC_014931	GTT	3	9	5550788	5550796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10372	NC_014931	GTC	2	6	5550798	5550803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10373	NC_014931	TGTC	3	12	5550805	5550816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10374	NC_014931	CGA	2	6	5551540	5551545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10375	NC_014931	CG	3	6	5551570	5551575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10376	NC_014931	TCCA	2	8	5551576	5551583	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10377	NC_014931	CG	3	6	5551609	5551614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10378	NC_014931	CGT	2	6	5551624	5551629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10379	NC_014931	TTC	2	6	5551708	5551713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10380	NC_014931	CTTGC	2	10	5551847	5551856	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10381	NC_014931	ATCCC	2	10	5551860	5551869	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10382	NC_014931	TCG	2	6	5551875	5551880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10383	NC_014931	GC	3	6	5551965	5551970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10384	NC_014931	CTT	2	6	5551994	5551999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10385	NC_014931	GC	3	6	5552003	5552008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10386	NC_014931	TCG	2	6	5552040	5552045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10388	NC_014931	CTGA	4	16	5553340	5553355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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