MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014931	TTCT	2	8	4471724	4471731	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8502	NC_014931	CGA	2	6	4471755	4471760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_014931	GT	3	6	4471762	4471767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_014931	C	6	6	4471819	4471824	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8505	NC_014931	GGCATG	2	12	4471877	4471888	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8506	NC_014931	CAA	2	6	4474592	4474597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_014931	GC	3	6	4474648	4474653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8508	NC_014931	GC	3	6	4475657	4475662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8509	NC_014931	CG	3	6	4475694	4475699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8510	NC_014931	TGC	2	6	4478544	4478549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_014931	CGG	2	6	4478577	4478582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_014931	AGG	2	6	4478617	4478622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_014931	CGC	2	6	4479026	4479031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8514	NC_014931	CGG	2	6	4479046	4479051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_014931	CGC	2	6	4479096	4479101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8516	NC_014931	TTC	3	9	4479103	4479111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_014931	GTT	2	6	4480700	4480705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_014931	CGG	2	6	4484020	4484025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_014931	ACTT	2	8	4484029	4484036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8520	NC_014931	CTG	2	6	4484080	4484085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_014931	CCTTCC	2	12	4487947	4487958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8522	NC_014931	GGC	2	6	4487982	4487987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8523	NC_014931	GCC	2	6	4488014	4488019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8524	NC_014931	GGGA	2	8	4488049	4488056	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_014931	GTA	2	6	4489742	4489747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_014931	TGC	2	6	4489756	4489761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_014931	GCC	2	6	4489789	4489794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8528	NC_014931	CGAT	3	12	4489795	4489806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8529	NC_014931	GCCG	2	8	4489827	4489834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8530	NC_014931	CGC	2	6	4489846	4489851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8531	NC_014931	TCG	2	6	4489863	4489868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_014931	ACC	2	6	4489953	4489958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8533	NC_014931	AGCCCC	2	12	4490487	4490498	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8534	NC_014931	CCAG	2	8	4490510	4490517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8535	NC_014931	T	6	6	4493774	4493779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_014931	TG	3	6	4494202	4494207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_014931	GAA	2	6	4494250	4494255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_014931	CAT	2	6	4496160	4496165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_014931	AATG	2	8	4496170	4496177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_014931	A	6	6	4496185	4496190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_014931	ATT	2	6	4498899	4498904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_014931	AGT	2	6	4498951	4498956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_014931	GCG	2	6	4498992	4498997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_014931	CG	3	6	4499562	4499567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8545	NC_014931	TCC	2	6	4499597	4499602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8546	NC_014931	GC	3	6	4501571	4501576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8547	NC_014931	GGCG	2	8	4502287	4502294	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8548	NC_014931	CAG	2	6	4503292	4503297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_014931	CCG	2	6	4503333	4503338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8550	NC_014931	GCG	2	6	4503341	4503346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_014931	CTTC	2	8	4504387	4504394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8552	NC_014931	GAA	2	6	4504418	4504423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_014931	CCCG	2	8	4504432	4504439	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8554	NC_014931	CTT	2	6	4505667	4505672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_014931	GC	3	6	4505784	4505789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8556	NC_014931	GCT	2	6	4505806	4505811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_014931	GC	3	6	4506853	4506858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8558	NC_014931	TGG	2	6	4508534	4508539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_014931	CGCC	2	8	4508566	4508573	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8560	NC_014931	CGT	2	6	4508577	4508582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_014931	GCC	2	6	4508626	4508631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8562	NC_014931	GCG	2	6	4508652	4508657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_014931	CACT	2	8	4508704	4508711	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8564	NC_014931	GC	5	10	4510365	4510374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8565	NC_014931	CTT	2	6	4510381	4510386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_014931	CG	3	6	4510442	4510447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8567	NC_014931	AACGA	2	10	4512716	4512725	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8568	NC_014931	GC	4	8	4516377	4516384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8569	NC_014931	GCG	3	9	4516391	4516399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_014931	CGG	2	6	4516442	4516447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_014931	GTC	2	6	4516475	4516480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_014931	ATTC	2	8	4516685	4516692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8573	NC_014931	GAT	2	6	4517193	4517198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_014931	GGGC	2	8	4517202	4517209	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8575	NC_014931	CCGG	2	8	4517215	4517222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8576	NC_014931	CGA	2	6	4517233	4517238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8577	NC_014931	GCC	2	6	4517239	4517244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8578	NC_014931	GATG	2	8	4518684	4518691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_014931	CAG	2	6	4518822	4518827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8580	NC_014931	CAA	2	6	4518833	4518838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_014931	CG	4	8	4519472	4519479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8582	NC_014931	GCG	2	6	4519548	4519553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_014931	GCG	2	6	4519557	4519562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8584	NC_014931	TCGAA	2	10	4519567	4519576	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8585	NC_014931	CCGC	2	8	4520030	4520037	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8586	NC_014931	CATC	2	8	4520128	4520135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8587	NC_014931	CAG	2	6	4520136	4520141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8588	NC_014931	TGAA	2	8	4521438	4521445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_014931	GGC	2	6	4521510	4521515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8590	NC_014931	CT	3	6	4522470	4522475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8591	NC_014931	CTG	2	6	4522479	4522484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8592	NC_014931	GCAG	2	8	4522565	4522572	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8593	NC_014931	CCA	2	6	4523068	4523073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8594	NC_014931	GTC	2	6	4523079	4523084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_014931	TGG	2	6	4523091	4523096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_014931	GACG	2	8	4523101	4523108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8597	NC_014931	ACG	2	6	4523113	4523118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_014931	TCT	2	6	4524709	4524714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8599	NC_014931	CG	3	6	4524785	4524790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8600	NC_014931	T	6	6	4524795	4524800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_014931	CTT	2	6	4525183	4525188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8602	NC_014931	CGG	2	6	4525201	4525206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_014931	GCC	2	6	4525963	4525968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8604	NC_014931	GAAA	2	8	4525998	4526005	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_014931	A	6	6	4526003	4526008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_014931	AAG	2	6	4526012	4526017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_014931	GCG	3	9	4526341	4526349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_014931	GGCA	2	8	4526361	4526368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8609	NC_014931	GCATT	2	10	4528136	4528145	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8610	NC_014931	CGCCC	2	10	4528182	4528191	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
8611	NC_014931	CCGG	2	8	4530042	4530049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8612	NC_014931	AGC	2	6	4530055	4530060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8613	NC_014931	ATT	2	6	4531696	4531701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_014931	CCG	2	6	4531734	4531739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8615	NC_014931	CA	3	6	4531765	4531770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8616	NC_014931	GA	3	6	4531784	4531789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_014931	GA	3	6	4535099	4535104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_014931	TTC	2	6	4535115	4535120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_014931	GGCG	2	8	4535605	4535612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8620	NC_014931	TGCG	2	8	4535614	4535621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8621	NC_014931	GC	3	6	4535971	4535976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8622	NC_014931	ACGACA	2	12	4535977	4535988	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8623	NC_014931	CA	3	6	4535987	4535992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8624	NC_014931	GAA	2	6	4537217	4537222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_014931	GCG	2	6	4537460	4537465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_014931	AG	3	6	4537478	4537483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_014931	GCA	2	6	4537495	4537500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_014931	CGC	2	6	4539768	4539773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8629	NC_014931	CAGA	2	8	4543054	4543061	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8630	NC_014931	AGGGG	2	10	4544212	4544221	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8631	NC_014931	TGTT	2	8	4544323	4544330	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8633	NC_014931	ACTT	2	8	4544361	4544368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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