MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014931	CGA	2	6	4218142	4218147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_014931	GCG	2	6	4218183	4218188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_014931	AGCG	2	8	4218376	4218383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8004	NC_014931	TGT	2	6	4218412	4218417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_014931	CAC	2	6	4218496	4218501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8006	NC_014931	GCA	2	6	4218587	4218592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_014931	GAGAAA	2	12	4218640	4218651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_014931	CTT	2	6	4218678	4218683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_014931	GAT	2	6	4218710	4218715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_014931	GA	3	6	4218725	4218730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_014931	CGA	2	6	4218740	4218745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_014931	TTG	2	6	4218797	4218802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_014931	CG	3	6	4218806	4218811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8014	NC_014931	CGA	2	6	4218822	4218827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_014931	TCA	2	6	4218836	4218841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_014931	TCC	2	6	4218890	4218895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_014931	CTC	3	9	4221641	4221649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_014931	CAGC	2	8	4221681	4221688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_014931	ACTA	2	8	4221708	4221715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_014931	CCG	2	6	4221732	4221737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8021	NC_014931	AGC	2	6	4221738	4221743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_014931	TGCC	2	8	4221880	4221887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8023	NC_014931	AAG	2	6	4221929	4221934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_014931	A	6	6	4222137	4222142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_014931	GA	3	6	4222162	4222167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_014931	GGA	2	6	4222194	4222199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_014931	GCG	2	6	4229737	4229742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_014931	CG	4	8	4229741	4229748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_014931	GC	3	6	4230558	4230563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_014931	CAT	2	6	4230578	4230583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_014931	TTC	2	6	4230619	4230624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_014931	TCG	2	6	4230634	4230639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_014931	CCA	2	6	4230708	4230713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_014931	GCC	2	6	4230729	4230734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8035	NC_014931	ACA	2	6	4230765	4230770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_014931	TCC	2	6	4231496	4231501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_014931	CGC	2	6	4231534	4231539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8038	NC_014931	CTT	2	6	4231557	4231562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_014931	GTTC	2	8	4233308	4233315	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8040	NC_014931	TC	3	6	4233322	4233327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_014931	TGT	2	6	4233341	4233346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_014931	TCG	2	6	4233352	4233357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_014931	GCA	2	6	4233371	4233376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_014931	CCAG	2	8	4233890	4233897	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8045	NC_014931	TCTT	2	8	4233900	4233907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8046	NC_014931	GAA	2	6	4233909	4233914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_014931	TGC	2	6	4233921	4233926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_014931	AAAGA	2	10	4234019	4234028	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_014931	A	7	7	4234046	4234052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_014931	AGA	2	6	4234064	4234069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_014931	AGAC	2	8	4234113	4234120	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8052	NC_014931	GAA	2	6	4234151	4234156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_014931	T	6	6	4234268	4234273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_014931	GCT	2	6	4244421	4244426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_014931	GC	3	6	4244461	4244466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8056	NC_014931	GC	3	6	4244491	4244496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8057	NC_014931	TTC	2	6	4244502	4244507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_014931	CAA	2	6	4244604	4244609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_014931	CGC	2	6	4244624	4244629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_014931	CGG	2	6	4244669	4244674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_014931	GCA	2	6	4244683	4244688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_014931	GA	3	6	4244707	4244712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_014931	CTT	2	6	4244731	4244736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_014931	T	6	6	4244805	4244810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_014931	GC	3	6	4244897	4244902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8066	NC_014931	CG	4	8	4244905	4244912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8067	NC_014931	AGG	2	6	4244925	4244930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_014931	GCT	2	6	4245573	4245578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_014931	CATCA	2	10	4246945	4246954	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8070	NC_014931	T	7	7	4247025	4247031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_014931	CGC	2	6	4247239	4247244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8072	NC_014931	CAA	2	6	4247262	4247267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_014931	CTA	2	6	4247313	4247318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_014931	AAGG	2	8	4247341	4247348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_014931	TTTG	2	8	4247360	4247367	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_014931	ATCG	2	8	4247414	4247421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8077	NC_014931	GC	3	6	4247422	4247427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8078	NC_014931	GCC	2	6	4247502	4247507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_014931	TGG	2	6	4247595	4247600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_014931	CCAC	2	8	4247611	4247618	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8081	NC_014931	CCT	2	6	4247641	4247646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_014931	CAGC	2	8	4247966	4247973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8083	NC_014931	ACGT	2	8	4247988	4247995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8084	NC_014931	CAC	2	6	4248095	4248100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8085	NC_014931	TCG	2	6	4248264	4248269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_014931	GCA	2	6	4248304	4248309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_014931	GCC	2	6	4248319	4248324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8088	NC_014931	G	6	6	4248798	4248803	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_014931	TCA	2	6	4248820	4248825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_014931	TGAT	2	8	4248826	4248833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_014931	CT	3	6	4248856	4248861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8092	NC_014931	TAA	2	6	4248891	4248896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_014931	CCCTGA	2	12	4248904	4248915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8094	NC_014931	TC	3	6	4248917	4248922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8095	NC_014931	AAG	2	6	4248960	4248965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_014931	GTC	2	6	4249159	4249164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_014931	TTTA	2	8	4249516	4249523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_014931	AGC	2	6	4249591	4249596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_014931	TC	4	8	4249659	4249666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_014931	T	6	6	4249718	4249723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_014931	CGC	2	6	4249733	4249738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8102	NC_014931	CGC	2	6	4249747	4249752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_014931	TCGA	2	8	4249771	4249778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8104	NC_014931	ATC	2	6	4249787	4249792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_014931	CGTC	2	8	4249894	4249901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8106	NC_014931	CCT	2	6	4249914	4249919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8107	NC_014931	GGC	2	6	4249972	4249977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_014931	GCC	2	6	4249993	4249998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8109	NC_014931	GAG	2	6	4252078	4252083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_014931	GCC	2	6	4252102	4252107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8111	NC_014931	G	6	6	4252118	4252123	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_014931	TTG	2	6	4252238	4252243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_014931	CA	3	6	4252310	4252315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8114	NC_014931	GA	3	6	4252832	4252837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_014931	CGC	3	9	4252846	4252854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_014931	TCGATC	2	12	4255688	4255699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_014931	A	6	6	4256824	4256829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_014931	GCA	2	6	4256889	4256894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_014931	CTG	2	6	4256898	4256903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_014931	TTG	2	6	4257551	4257556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_014931	CTT	2	6	4257568	4257573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_014931	CTT	2	6	4257593	4257598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_014931	GCG	2	6	4257613	4257618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_014931	CTG	2	6	4257639	4257644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_014931	GGC	2	6	4258240	4258245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_014931	A	6	6	4260306	4260311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_014931	TTGG	2	8	4260335	4260342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_014931	GAA	2	6	4260349	4260354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_014931	AGCG	2	8	4260360	4260367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8130	NC_014931	GAA	3	9	4260399	4260407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_014931	AGT	2	6	4260429	4260434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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