MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 12323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014931	AGGG	2	8	2684465	2684472	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014931	TTC	2	6	2684592	2684597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_014931	TG	3	6	2684634	2684639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_014931	CGGA	2	8	2684653	2684660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5005	NC_014931	TTC	2	6	2686363	2686368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_014931	G	6	6	2688926	2688931	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014931	CTT	2	6	2688932	2688937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_014931	GTTC	2	8	2689061	2689068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_014931	TC	3	6	2689263	2689268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_014931	GCTC	2	8	2689281	2689288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_014931	GC	3	6	2689295	2689300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_014931	TGG	2	6	2690404	2690409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014931	GTC	2	6	2690474	2690479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_014931	GCA	2	6	2690490	2690495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_014931	GC	3	6	2690516	2690521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_014931	CTG	2	6	2690547	2690552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_014931	CTG	2	6	2690584	2690589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_014931	A	6	6	2690646	2690651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_014931	GAGGG	2	10	2691694	2691703	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_014931	GCA	2	6	2691706	2691711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_014931	GAA	2	6	2692034	2692039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014931	ACG	2	6	2693788	2693793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_014931	CGC	2	6	2693846	2693851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_014931	CGG	2	6	2694793	2694798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_014931	CCGT	2	8	2694799	2694806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_014931	GAC	2	6	2694810	2694815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_014931	GCC	2	6	2694818	2694823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_014931	CCG	2	6	2694831	2694836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_014931	ATG	2	6	2694840	2694845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_014931	CGC	2	6	2694866	2694871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_014931	GC	3	6	2699165	2699170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_014931	CG	3	6	2699183	2699188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_014931	GCG	3	9	2699186	2699194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_014931	GC	3	6	2699211	2699216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_014931	TG	3	6	2699228	2699233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_014931	CAG	2	6	2699280	2699285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_014931	CA	3	6	2699302	2699307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_014931	GTCC	2	8	2699319	2699326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_014931	ACT	2	6	2699341	2699346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_014931	GAA	3	9	2702400	2702408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014931	CGCC	2	8	2704666	2704673	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5042	NC_014931	GTT	2	6	2706025	2706030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_014931	GA	3	6	2709125	2709130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014931	CGG	2	6	2709555	2709560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_014931	GGA	2	6	2710772	2710777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_014931	G	6	6	2712092	2712097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_014931	CTG	2	6	2712119	2712124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_014931	GC	3	6	2712214	2712219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_014931	AG	3	6	2712591	2712596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_014931	GAA	2	6	2719854	2719859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_014931	GCT	2	6	2719900	2719905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_014931	CGA	2	6	2719992	2719997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_014931	TGAA	2	8	2720002	2720009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_014931	GGGCA	2	10	2721958	2721967	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5055	NC_014931	CAC	2	6	2721998	2722003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_014931	AC	4	8	2722002	2722009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_014931	AG	3	6	2723368	2723373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_014931	GC	3	6	2723436	2723441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_014931	TTCAC	2	10	2723456	2723465	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5060	NC_014931	T	6	6	2724564	2724569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_014931	GC	3	6	2726229	2726234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_014931	CCCT	2	8	2728028	2728035	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5063	NC_014931	TGT	2	6	2728038	2728043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014931	CCG	2	6	2728057	2728062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_014931	T	6	6	2728089	2728094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_014931	AG	3	6	2731287	2731292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_014931	GAC	2	6	2731748	2731753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_014931	CGC	2	6	2737058	2737063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_014931	GCA	2	6	2737089	2737094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_014931	ATC	2	6	2737136	2737141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_014931	GC	3	6	2738797	2738802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_014931	GCT	2	6	2738811	2738816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_014931	TCGA	2	8	2738817	2738824	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_014931	GAC	2	6	2740976	2740981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_014931	ATTC	2	8	2741027	2741034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5076	NC_014931	ACGA	2	8	2741053	2741060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5077	NC_014931	ATC	3	9	2741066	2741074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_014931	TCACT	2	10	2742672	2742681	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5079	NC_014931	GCCC	2	8	2742682	2742689	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5080	NC_014931	TGC	2	6	2747248	2747253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_014931	CG	3	6	2747908	2747913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_014931	CATT	2	8	2747986	2747993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_014931	ACAAA	2	10	2748019	2748028	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5084	NC_014931	GTC	2	6	2748117	2748122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_014931	GAA	2	6	2749563	2749568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_014931	CCGCG	2	10	2750302	2750311	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5087	NC_014931	GGC	2	6	2750317	2750322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_014931	CCT	2	6	2750858	2750863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_014931	T	6	6	2750866	2750871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_014931	GC	3	6	2750901	2750906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_014931	CG	3	6	2750911	2750916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_014931	TCG	2	6	2752207	2752212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_014931	CGA	2	6	2752237	2752242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_014931	GCG	2	6	2752302	2752307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_014931	TTCG	2	8	2755236	2755243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_014931	GC	3	6	2755277	2755282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_014931	GTGC	2	8	2755390	2755397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_014931	ACT	2	6	2755459	2755464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_014931	CG	4	8	2756210	2756217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_014931	CGAGG	2	10	2756380	2756389	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5101	NC_014931	CGC	2	6	2756410	2756415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_014931	CG	3	6	2756496	2756501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_014931	CTTC	2	8	2757785	2757792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_014931	A	6	6	2759832	2759837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_014931	TTTC	2	8	2759857	2759864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5106	NC_014931	CAT	2	6	2760471	2760476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_014931	CTTG	2	8	2761474	2761481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_014931	TCGG	2	8	2762322	2762329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5109	NC_014931	GC	3	6	2763332	2763337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_014931	GC	3	6	2763342	2763347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_014931	CCG	2	6	2763385	2763390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_014931	CCG	2	6	2763438	2763443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_014931	CGG	2	6	2763494	2763499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_014931	A	6	6	2763587	2763592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014931	GCG	2	6	2765395	2765400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_014931	CGTG	2	8	2765457	2765464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_014931	GCG	2	6	2765472	2765477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_014931	GAG	2	6	2766034	2766039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_014931	ATTA	2	8	2766352	2766359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014931	TTTG	2	8	2767453	2767460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014931	GCT	2	6	2767534	2767539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_014931	GCT	2	6	2768442	2768447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_014931	CTA	2	6	2768452	2768457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_014931	CCCT	2	8	2768459	2768466	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5125	NC_014931	CAC	2	6	2768502	2768507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_014931	GTTT	2	8	2768533	2768540	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_014931	ACCA	2	8	2768560	2768567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_014931	GTC	2	6	2770318	2770323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_014931	C	6	6	2770328	2770333	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5130	NC_014931	GCC	2	6	2770347	2770352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_014931	CGG	2	6	2770380	2770385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_014931	GAA	2	6	2771978	2771983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_014931	T	6	6	2772013	2772018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_014931	CGC	2	6	2772048	2772053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5135	NC_014931	TTA	2	6	2772061	2772066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5138	NC_014931	TGA	2	6	2774177	2774182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5161	NC_014931	CGG	2	6	2800821	2800826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5164	NC_014931	GCC	2	6	2803148	2803153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5169	NC_014931	CCGGG	2	10	2809822	2809831	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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5174	NC_014931	CG	3	6	2810875	2810880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5175	NC_014931	GCG	2	6	2810933	2810938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5193	NC_014931	GGA	2	6	2823909	2823914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5214	NC_014931	AGACA	2	10	2832520	2832529	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5218	NC_014931	GCCG	2	8	2832739	2832746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5219	NC_014931	ACAG	2	8	2832764	2832771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5220	NC_014931	GA	3	6	2832792	2832797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5221	NC_014931	AAGG	2	8	2832811	2832818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5222	NC_014931	GGGA	2	8	2833822	2833829	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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5230	NC_014931	CAG	2	6	2834132	2834137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5231	NC_014931	AGC	2	6	2834143	2834148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5233	NC_014931	GCT	2	6	2836989	2836994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5251	NC_014931	CGC	2	6	2844523	2844528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5255	NC_014931	GGC	2	6	2845750	2845755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5259	NC_014931	GCA	3	9	2845810	2845818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5261	NC_014931	AG	3	6	2845835	2845840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_014931	GCC	2	6	2845883	2845888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5263	NC_014931	GAC	2	6	2845931	2845936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5265	NC_014931	CGC	2	6	2846014	2846019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5266	NC_014931	GTCGCC	2	12	2846024	2846035	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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5268	NC_014931	CGCC	2	8	2846093	2846100	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5269	NC_014931	ACC	2	6	2846103	2846108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5273	NC_014931	GC	3	6	2846261	2846266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5274	NC_014931	CGT	2	6	2846311	2846316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5280	NC_014931	GGT	2	6	2846562	2846567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5320	NC_014931	GTTGA	2	10	2872490	2872499	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5337	NC_014931	TGT	3	9	2889765	2889773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5347	NC_014931	TTC	2	6	2892504	2892509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5348	NC_014931	CG	3	6	2892961	2892966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5349	NC_014931	CTTC	2	8	2893042	2893049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5380	NC_014931	GAT	2	6	2903561	2903566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5383	NC_014931	GGCC	2	8	2903693	2903700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5384	NC_014931	TGCT	2	8	2903704	2903711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5385	NC_014931	CCA	2	6	2903721	2903726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5386	NC_014931	CGGCA	2	10	2903742	2903751	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5387	NC_014931	TC	3	6	2903823	2903828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5388	NC_014931	CGA	3	9	2904411	2904419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5390	NC_014931	GCC	2	6	2904459	2904464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5391	NC_014931	TCT	2	6	2904477	2904482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_014931	ATCA	2	8	2905150	2905157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5393	NC_014931	GATT	2	8	2905221	2905228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_014931	TGC	2	6	2905275	2905280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5395	NC_014931	CATC	2	8	2906309	2906316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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