MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 10452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012791	GGCCG	2	10	1802741	1802750	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3002	NC_012791	ATA	2	6	1804409	1804414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_012791	ACT	2	6	1804434	1804439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_012791	TGC	2	6	1806559	1806564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_012791	TGT	2	6	1809879	1809884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_012791	CCT	3	9	1809944	1809952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_012791	AGG	2	6	1810074	1810079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_012791	CGG	2	6	1810122	1810127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_012791	GC	3	6	1810130	1810135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_012791	ACG	2	6	1810141	1810146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_012791	ACA	2	6	1810148	1810153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_012791	AAGC	2	8	1810166	1810173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_012791	GTTC	2	8	1811507	1811514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_012791	GC	4	8	1811543	1811550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_012791	CCG	3	9	1811601	1811609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_012791	GAG	2	6	1811624	1811629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_012791	GCG	2	6	1812097	1812102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_012791	AGT	2	6	1816474	1816479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_012791	GCA	2	6	1816540	1816545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_012791	TCT	2	6	1818112	1818117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_012791	CGG	2	6	1818123	1818128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_012791	CGT	2	6	1818157	1818162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_012791	TCT	2	6	1821979	1821984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_012791	GTTT	2	8	1823406	1823413	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_012791	GTT	2	6	1823416	1823421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_012791	ATG	2	6	1823437	1823442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_012791	A	7	7	1823447	1823453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_012791	GA	3	6	1824168	1824173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_012791	CGG	2	6	1825289	1825294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_012791	CCG	2	6	1825329	1825334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_012791	GTAT	2	8	1825373	1825380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_012791	GCA	2	6	1825419	1825424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_012791	TGG	2	6	1825462	1825467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_012791	CGG	2	6	1825498	1825503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_012791	CTT	2	6	1826949	1826954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_012791	GC	4	8	1827036	1827043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_012791	CAGC	2	8	1828083	1828090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_012791	CGC	2	6	1828100	1828105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_012791	GTC	2	6	1828121	1828126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_012791	ACG	3	9	1828135	1828143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_012791	AAG	2	6	1828147	1828152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_012791	GAA	2	6	1830306	1830311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_012791	GCCG	2	8	1830835	1830842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_012791	GGCG	2	8	1832656	1832663	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_012791	TTC	2	6	1835328	1835333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_012791	CAC	2	6	1836021	1836026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_012791	GGC	2	6	1836044	1836049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_012791	GCG	2	6	1836521	1836526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_012791	TGT	2	6	1839374	1839379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_012791	CTG	2	6	1839409	1839414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_012791	CCG	2	6	1839422	1839427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_012791	CAG	2	6	1841407	1841412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_012791	GCA	2	6	1841577	1841582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_012791	GCC	2	6	1841638	1841643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_012791	CCT	2	6	1841704	1841709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_012791	CGG	2	6	1841720	1841725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_012791	AC	3	6	1841738	1841743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_012791	AT	3	6	1841789	1841794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_012791	GC	3	6	1841806	1841811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_012791	GC	3	6	1841852	1841857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_012791	CGG	2	6	1841869	1841874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_012791	GTC	2	6	1841889	1841894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_012791	GGCA	2	8	1841921	1841928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_012791	AGC	2	6	1841945	1841950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_012791	GC	3	6	1841968	1841973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_012791	TCGG	2	8	1843168	1843175	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3067	NC_012791	GGCG	2	8	1843176	1843183	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3068	NC_012791	GGT	2	6	1843227	1843232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_012791	TGT	2	6	1845224	1845229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_012791	GT	3	6	1845292	1845297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_012791	CGC	2	6	1845302	1845307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_012791	TTG	2	6	1845866	1845871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_012791	CGG	2	6	1845896	1845901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_012791	G	6	6	1845900	1845905	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_012791	AAAC	2	8	1845911	1845918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3076	NC_012791	AGCC	2	8	1845922	1845929	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_012791	A	6	6	1845960	1845965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_012791	GC	4	8	1846025	1846032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_012791	GGA	2	6	1846424	1846429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_012791	TGGA	3	12	1846437	1846448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_012791	CGGCC	2	10	1846490	1846499	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3082	NC_012791	CAT	2	6	1846975	1846980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_012791	CTC	2	6	1846981	1846986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_012791	GGGC	2	8	1846993	1847000	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3085	NC_012791	TTG	2	6	1847035	1847040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_012791	CTA	2	6	1847097	1847102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_012791	TGC	2	6	1847123	1847128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_012791	AGG	2	6	1848075	1848080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_012791	TGA	2	6	1849125	1849130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_012791	GGC	2	6	1849138	1849143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_012791	GC	3	6	1851265	1851270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_012791	TGC	2	6	1853671	1853676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_012791	TTC	2	6	1855477	1855482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_012791	TCCC	2	8	1855493	1855500	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3095	NC_012791	GCG	2	6	1855530	1855535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_012791	CATC	2	8	1855536	1855543	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_012791	CGT	2	6	1855551	1855556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_012791	GGAAGG	2	12	1855579	1855590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_012791	CAA	2	6	1855599	1855604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_012791	GTG	2	6	1856608	1856613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_012791	A	6	6	1856623	1856628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_012791	GAAA	2	8	1856629	1856636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_012791	TGT	2	6	1858386	1858391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_012791	ATT	2	6	1858409	1858414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_012791	GAA	2	6	1859246	1859251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_012791	TGAC	2	8	1859295	1859302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_012791	CAG	2	6	1859312	1859317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_012791	ACTC	2	8	1860326	1860333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_012791	GGCCG	2	10	1861260	1861269	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3110	NC_012791	ACG	2	6	1861273	1861278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_012791	ACA	2	6	1861279	1861284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_012791	AAC	3	9	1861285	1861293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_012791	TTC	2	6	1861763	1861768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_012791	CTT	2	6	1863192	1863197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_012791	AGC	2	6	1863209	1863214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_012791	GCC	2	6	1865977	1865982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_012791	AAT	2	6	1866015	1866020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_012791	GCC	2	6	1868595	1868600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_012791	CCTC	2	8	1875238	1875245	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3120	NC_012791	CCCCA	2	10	1875300	1875309	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3121	NC_012791	GGGA	2	8	1875325	1875332	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_012791	CGAT	2	8	1875347	1875354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_012791	GGGC	2	8	1876377	1876384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3124	NC_012791	ATTTGA	2	12	1876433	1876444	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_012791	T	6	6	1876449	1876454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_012791	GAT	2	6	1878546	1878551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_012791	CGC	2	6	1878569	1878574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_012791	CGT	2	6	1880399	1880404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_012791	GT	3	6	1880450	1880455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_012791	TCA	2	6	1880491	1880496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_012791	ATGC	2	8	1881335	1881342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3132	NC_012791	CGCTG	2	10	1881351	1881360	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3133	NC_012791	ATC	2	6	1881365	1881370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3135	NC_012791	GC	3	6	1881402	1881407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3136	NC_012791	CGG	2	6	1881410	1881415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_012791	CCG	2	6	1881437	1881442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3139	NC_012791	TTCG	2	8	1882695	1882702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3142	NC_012791	CCG	2	6	1882729	1882734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3143	NC_012791	GCGAA	2	10	1882747	1882756	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3149	NC_012791	CGAA	2	8	1889826	1889833	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3152	NC_012791	AG	3	6	1893022	1893027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_012791	TTC	2	6	1896768	1896773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3155	NC_012791	CGCC	2	8	1896798	1896805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3156	NC_012791	CGG	2	6	1899158	1899163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3163	NC_012791	A	8	8	1903262	1903269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_012791	TGG	3	9	1903324	1903332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3166	NC_012791	TCG	2	6	1903943	1903948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3172	NC_012791	ACGC	2	8	1906336	1906343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3174	NC_012791	CG	3	6	1907595	1907600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3175	NC_012791	GGTAC	2	10	1907604	1907613	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3193	NC_012791	GC	3	6	1926662	1926667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3203	NC_012791	GAA	2	6	1930548	1930553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3215	NC_012791	GT	3	6	1933253	1933258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3240	NC_012791	ACGTG	2	10	1942309	1942318	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3244	NC_012791	AAG	2	6	1942447	1942452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3246	NC_012791	CAGC	2	8	1942580	1942587	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3247	NC_012791	TGC	2	6	1942633	1942638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3248	NC_012791	GC	3	6	1942645	1942650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3249	NC_012791	GCG	2	6	1942682	1942687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_012791	CG	3	6	1942698	1942703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3251	NC_012791	AGC	2	6	1942705	1942710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_012791	CGCGG	2	10	1945640	1945649	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3253	NC_012791	GC	3	6	1945979	1945984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_012791	GCAA	2	8	1947098	1947105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3255	NC_012791	TGC	2	6	1947111	1947116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_012791	AAC	2	6	1947168	1947173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_012791	GCA	2	6	1947287	1947292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_012791	CG	3	6	1947877	1947882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3259	NC_012791	T	6	6	1947912	1947917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_012791	AG	3	6	1947948	1947953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_012791	GCG	2	6	1950372	1950377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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