MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 10452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012791	ACA	2	6	337539	337544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_012791	TTC	2	6	337549	337554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_012791	T	8	8	337611	337618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012791	CGC	2	6	337622	337627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_012791	CCG	2	6	337635	337640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_012791	GCCG	2	8	337652	337659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_012791	CGC	2	6	337730	337735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_012791	TCC	2	6	338509	338514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_012791	GTGC	2	8	341388	341395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
510	NC_012791	GTC	2	6	341919	341924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_012791	GCTG	2	8	341939	341946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
512	NC_012791	A	6	6	342015	342020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012791	T	7	7	342035	342041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012791	CAA	2	6	342505	342510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_012791	CAA	2	6	342537	342542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_012791	TCGA	2	8	343279	343286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
517	NC_012791	TCT	2	6	343295	343300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_012791	CCG	2	6	345428	345433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_012791	GC	3	6	345436	345441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_012791	TCT	2	6	352016	352021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_012791	CGC	3	9	352039	352047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_012791	GGCC	2	8	352057	352064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_012791	GTT	2	6	352103	352108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012791	TCT	2	6	353821	353826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_012791	CTT	2	6	353830	353835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_012791	GC	3	6	353842	353847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_012791	GAAG	2	8	353858	353865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012791	GCG	2	6	353871	353876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_012791	GC	3	6	355152	355157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_012791	AAG	2	6	356356	356361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012791	CG	3	6	356369	356374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_012791	TGGA	2	8	356424	356431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012791	CCT	2	6	361120	361125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_012791	CCT	3	9	365562	365570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_012791	CGC	2	6	365615	365620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_012791	GGA	2	6	365709	365714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012791	CGG	2	6	365739	365744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_012791	ACG	2	6	365762	365767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_012791	TCCC	2	8	368486	368493	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
540	NC_012791	GCG	2	6	368523	368528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_012791	CTGC	2	8	368543	368550	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
542	NC_012791	GGAAGG	2	12	368571	368582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012791	AGA	2	6	368591	368596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012791	TGT	2	6	369621	369626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012791	TGT	2	6	369636	369641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012791	CCT	3	9	369701	369709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_012791	AGG	2	6	369831	369836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012791	CGG	2	6	369879	369884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_012791	TCT	2	6	371401	371406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_012791	AGG	3	9	371414	371422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012791	CG	3	6	372416	372421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_012791	GAC	2	6	372443	372448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_012791	G	6	6	372451	372456	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012791	CG	3	6	372466	372471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_012791	GGTT	2	8	373367	373374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012791	CAA	2	6	373420	373425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_012791	T	6	6	373452	373457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012791	GCA	2	6	373495	373500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012791	GA	3	6	373518	373523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012791	CG	3	6	373532	373537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_012791	TGC	2	6	373543	373548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_012791	CCG	2	6	373550	373555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_012791	CCG	2	6	373561	373566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_012791	CG	3	6	373565	373570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_012791	CCCGC	2	10	373597	373606	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
566	NC_012791	GCG	2	6	373616	373621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_012791	T	6	6	376791	376796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012791	TGCAC	2	10	376823	376832	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
569	NC_012791	GCG	3	9	376858	376866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_012791	CCG	2	6	376878	376883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_012791	AGG	2	6	376899	376904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012791	GCC	2	6	377947	377952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_012791	TG	3	6	377957	377962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012791	GCGA	2	8	377987	377994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
575	NC_012791	GC	4	8	378007	378014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_012791	GCAC	2	8	378029	378036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
577	NC_012791	CCA	2	6	378958	378963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_012791	TAG	2	6	379012	379017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012791	CGG	2	6	379021	379026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_012791	CCG	2	6	379052	379057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_012791	ACG	2	6	379059	379064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_012791	CTG	3	9	379072	379080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_012791	T	6	6	380185	380190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012791	CTTT	2	8	380191	380198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_012791	TTG	2	6	380205	380210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012791	GCC	2	6	380223	380228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_012791	GC	3	6	380229	380234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_012791	CGCAG	2	10	380958	380967	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
589	NC_012791	TTTC	2	8	382271	382278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_012791	ATC	2	6	382279	382284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_012791	GACAA	2	10	382310	382319	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
592	NC_012791	CATTAC	2	12	383318	383329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_012791	T	6	6	383331	383336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012791	GCC	2	6	385697	385702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_012791	CTTC	2	8	385765	385772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_012791	TCC	2	6	385786	385791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_012791	TGC	2	6	386684	386689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_012791	GCG	2	6	386698	386703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_012791	CCG	2	6	386707	386712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_012791	CTC	2	6	386753	386758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_012791	GCG	2	6	386831	386836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_012791	AGG	3	9	386881	386889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012791	AAC	2	6	386948	386953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_012791	AGCCC	2	10	386962	386971	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
605	NC_012791	ATGAA	2	10	387012	387021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012791	ACG	2	6	393022	393027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_012791	GCGCC	2	10	393033	393042	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
608	NC_012791	GCA	2	6	393045	393050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_012791	GTT	2	6	393431	393436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012791	GTGC	2	8	393478	393485	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
611	NC_012791	CAC	2	6	393557	393562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_012791	AGG	3	9	393613	393621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012791	ACA	2	6	393681	393686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_012791	AAGC	2	8	393716	393723	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
615	NC_012791	GTT	2	6	398471	398476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012791	GC	4	8	398518	398525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_012791	TTGT	2	8	398575	398582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012791	A	6	6	399465	399470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012791	GAAGC	2	10	399471	399480	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
620	NC_012791	GTT	2	6	404123	404128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012791	GTT	2	6	404153	404158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_012791	CGC	2	6	404159	404164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_012791	GCT	2	6	404192	404197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_012791	TCT	2	6	408234	408239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_012791	GGCG	3	12	412348	412359	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
626	NC_012791	GCG	2	6	412364	412369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_012791	CGG	2	6	412390	412395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_012791	TTCTT	2	10	412443	412452	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
629	NC_012791	GGC	3	9	415537	415545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_012791	TTGTG	2	10	416272	416281	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
631	NC_012791	TG	5	10	416278	416287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012791	ACT	2	6	416310	416315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_012791	GGC	2	6	416334	416339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_012791	TTTCC	2	10	416407	416416	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
635	NC_012791	AGA	2	6	416455	416460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_012791	CGAG	2	8	416518	416525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
637	NC_012791	GCC	2	6	416529	416534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_012791	C	6	6	416533	416538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
639	NC_012791	ACCC	2	8	416551	416558	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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