MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 7996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012668	GTAC	2	8	313532	313539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_012668	GTCA	2	8	313615	313622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_012668	GGA	2	6	313638	313643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012668	C	6	6	313648	313653	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1005	NC_012668	TCGC	2	8	313795	313802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_012668	CTA	2	6	313805	313810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_012668	TCT	2	6	313829	313834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_012668	GTT	3	9	314070	314078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012668	AAC	2	6	314081	314086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_012668	TGT	2	6	314190	314195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012668	ACAA	2	8	314230	314237	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_012668	TTG	2	6	314245	314250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012668	TGA	2	6	314290	314295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_012668	TGG	2	6	314335	314340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012668	CCT	2	6	314365	314370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_012668	AGGC	2	8	314378	314385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_012668	GTG	2	6	314418	314423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012668	ACC	2	6	314441	314446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_012668	ACC	2	6	314476	314481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_012668	AATC	2	8	314519	314526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_012668	TG	3	6	314527	314532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012668	TCA	2	6	314538	314543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_012668	ATC	2	6	314549	314554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_012668	AGG	2	6	314560	314565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012668	TCC	2	6	314641	314646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_012668	CTT	2	6	314665	314670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_012668	GT	3	6	314701	314706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012668	ACG	2	6	314802	314807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_012668	GT	3	6	314870	314875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012668	ATG	2	6	314895	314900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012668	CGT	2	6	314907	314912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_012668	TCC	2	6	314921	314926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_012668	CCA	2	6	314957	314962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_012668	GAC	2	6	315035	315040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_012668	GCA	2	6	315047	315052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_012668	TTC	2	6	315123	315128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_012668	C	6	6	315430	315435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1038	NC_012668	ACC	2	6	315512	315517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_012668	GCT	2	6	315576	315581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_012668	CTT	2	6	315601	315606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_012668	TTAAC	2	10	315635	315644	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_012668	TCC	2	6	315650	315655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_012668	CTT	2	6	315685	315690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_012668	CTG	2	6	315744	315749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_012668	ATC	2	6	315794	315799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_012668	TCG	2	6	315819	315824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_012668	CCG	2	6	315993	315998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_012668	TGC	2	6	316027	316032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_012668	GCC	2	6	316058	316063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_012668	T	6	6	316105	316110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_012668	TAA	2	6	316156	316161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012668	T	6	6	316236	316241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_012668	ATC	2	6	316246	316251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_012668	CA	3	6	316262	316267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_012668	GATT	2	8	316268	316275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_012668	TTTTC	2	10	316372	316381	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1057	NC_012668	TGC	2	6	316417	316422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_012668	T	6	6	316468	316473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_012668	GC	3	6	316512	316517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_012668	TTAT	2	8	316524	316531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012668	TGA	2	6	316550	316555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012668	TCTA	2	8	316598	316605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_012668	A	6	6	316621	316626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_012668	TTG	2	6	319587	319592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012668	CTC	2	6	320590	320595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_012668	GTTC	2	8	320599	320606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_012668	CAAA	2	8	320639	320646	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_012668	ACC	2	6	320650	320655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_012668	GTG	2	6	320662	320667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_012668	TGG	2	6	321947	321952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012668	TTAG	2	8	321957	321964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_012668	GTT	2	6	321977	321982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_012668	AAG	2	6	322015	322020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012668	AAC	2	6	322023	322028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_012668	TTAA	2	8	322032	322039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012668	T	6	6	322084	322089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012668	AAAAC	2	10	322094	322103	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1078	NC_012668	TACT	2	8	325435	325442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_012668	GTT	2	6	325497	325502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_012668	A	6	6	328989	328994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_012668	GTT	2	6	329028	329033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_012668	T	6	6	329032	329037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_012668	GC	3	6	330278	330283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_012668	A	6	6	330309	330314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012668	CGG	2	6	330388	330393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_012668	ATC	2	6	330394	330399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_012668	TTG	2	6	330417	330422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012668	GTC	2	6	330439	330444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_012668	GAT	2	6	330488	330493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012668	CGG	2	6	332978	332983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_012668	TC	3	6	332989	332994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_012668	CA	3	6	333022	333027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_012668	CTGA	2	8	333076	333083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_012668	AAACG	2	10	333091	333100	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1095	NC_012668	TCC	2	6	333105	333110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_012668	TTGC	2	8	335170	335177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_012668	TC	3	6	335220	335225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_012668	TCT	2	6	335231	335236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_012668	TGC	2	6	335359	335364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_012668	TAA	2	6	335400	335405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012668	CAC	2	6	335469	335474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_012668	GCC	2	6	337828	337833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_012668	CAAT	2	8	337859	337866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_012668	ACT	2	6	337876	337881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_012668	AAGAG	2	10	340034	340043	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012668	T	6	6	340364	340369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012668	T	6	6	340391	340396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012668	CAC	2	6	340410	340415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_012668	AC	3	6	340414	340419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_012668	CTT	2	6	340442	340447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_012668	AC	3	6	341528	341533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_012668	T	6	6	341538	341543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012668	CCA	2	6	346041	346046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_012668	T	7	7	346070	346076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_012668	AAT	2	6	346151	346156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012668	ATT	2	6	346209	346214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_012668	AAT	2	6	346219	346224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012668	CGC	2	6	346290	346295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_012668	TCA	2	6	346331	346336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_012668	CAA	2	6	346342	346347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_012668	TGA	2	6	346578	346583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012668	GCG	2	6	346642	346647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_012668	GTA	2	6	346664	346669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012668	G	6	6	346672	346677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_012668	AAG	2	6	346823	346828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012668	TGCT	2	8	346871	346878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_012668	ATG	3	9	346901	346909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_012668	CGG	2	6	346970	346975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_012668	CTG	2	6	346988	346993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_012668	TGA	3	9	347040	347048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012668	CCA	2	6	347054	347059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_012668	CAA	2	6	347107	347112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_012668	CAA	2	6	347197	347202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_012668	CAA	2	6	347214	347219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_012668	ACCGAA	2	12	347233	347244	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_012668	GATTG	2	10	347473	347482	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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