MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 7996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_012668	ACA	2	6	2939812	2939817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7502	NC_012668	TTAG	2	8	2939850	2939857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_012668	AC	3	6	2939927	2939932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7504	NC_012668	CAACC	2	10	2939940	2939949	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
7505	NC_012668	T	6	6	2940013	2940018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_012668	TCA	2	6	2940046	2940051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_012668	CT	3	6	2940086	2940091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7508	NC_012668	CAA	2	6	2940109	2940114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_012668	CAT	2	6	2941310	2941315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_012668	A	7	7	2941322	2941328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_012668	TTA	2	6	2946759	2946764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_012668	A	6	6	2946776	2946781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_012668	CAA	2	6	2946811	2946816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_012668	GAA	2	6	2946868	2946873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_012668	A	7	7	2946889	2946895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_012668	CAA	2	6	2946905	2946910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_012668	AAC	2	6	2946921	2946926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7518	NC_012668	AGAA	2	8	2946928	2946935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_012668	ACA	2	6	2946938	2946943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_012668	A	6	6	2946943	2946948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_012668	AAATC	2	10	2946969	2946978	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7522	NC_012668	TCG	2	6	2947081	2947086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_012668	CAATC	2	10	2947097	2947106	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7524	NC_012668	CT	3	6	2947117	2947122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7525	NC_012668	CAA	2	6	2947164	2947169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_012668	TCA	2	6	2947189	2947194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7527	NC_012668	GCAAGC	2	12	2947242	2947253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_012668	T	6	6	2947983	2947988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_012668	A	6	6	2948020	2948025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_012668	CCA	2	6	2948108	2948113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7531	NC_012668	AGA	2	6	2949560	2949565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_012668	TAA	2	6	2949597	2949602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_012668	ATG	2	6	2949711	2949716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_012668	ATG	2	6	2949734	2949739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_012668	AAAG	2	8	2949767	2949774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_012668	AAC	2	6	2949812	2949817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_012668	TTA	2	6	2949840	2949845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_012668	A	6	6	2949856	2949861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_012668	TAC	2	6	2950018	2950023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_012668	A	6	6	2950024	2950029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_012668	ATT	2	6	2951454	2951459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_012668	CAA	2	6	2951540	2951545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_012668	ATT	2	6	2951627	2951632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_012668	A	7	7	2951645	2951651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_012668	AATC	2	8	2951675	2951682	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7546	NC_012668	TTGT	2	8	2953235	2953242	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_012668	GTT	2	6	2954222	2954227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_012668	CTT	2	6	2954243	2954248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_012668	GATT	2	8	2954337	2954344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_012668	TGA	2	6	2954406	2954411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_012668	A	6	6	2954421	2954426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_012668	A	6	6	2954475	2954480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_012668	TTAT	2	8	2955845	2955852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_012668	AATG	2	8	2955859	2955866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_012668	GCT	2	6	2955882	2955887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7557	NC_012668	GCAAA	2	10	2955953	2955962	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7558	NC_012668	A	6	6	2955960	2955965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_012668	CAA	2	6	2955968	2955973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_012668	CAA	2	6	2955987	2955992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_012668	T	6	6	2956057	2956062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_012668	ATT	2	6	2956084	2956089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_012668	AGA	2	6	2956100	2956105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_012668	ATT	2	6	2956947	2956952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7566	NC_012668	T	6	6	2958291	2958296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_012668	GC	3	6	2958327	2958332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7568	NC_012668	AC	3	6	2959970	2959975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7569	NC_012668	CT	3	6	2959987	2959992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7573	NC_012668	ATCTG	2	10	2960081	2960090	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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7583	NC_012668	CTG	2	6	2963827	2963832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7588	NC_012668	TG	3	6	2964093	2964098	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_012668	TGATT	2	10	2964157	2964166	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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7592	NC_012668	GCT	2	6	2964233	2964238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7594	NC_012668	T	7	7	2964356	2964362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7597	NC_012668	A	8	8	2964557	2964564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_012668	TCC	2	6	2964608	2964613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7599	NC_012668	A	7	7	2964624	2964630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_012668	AGCC	2	8	2964632	2964639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7601	NC_012668	AGAT	2	8	2970637	2970644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_012668	GAAT	2	8	2970645	2970652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_012668	GT	3	6	2970654	2970659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_012668	TGT	2	6	2970673	2970678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_012668	AAC	2	6	2970686	2970691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7606	NC_012668	TTTA	2	8	2970815	2970822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_012668	TTG	2	6	2971801	2971806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_012668	GT	3	6	2971815	2971820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_012668	CTT	2	6	2971829	2971834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_012668	TGA	2	6	2971844	2971849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7613	NC_012668	CTT	2	6	2971971	2971976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7614	NC_012668	TA	3	6	2972006	2972011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_012668	ATA	2	6	2972048	2972053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7619	NC_012668	GTC	2	6	2972688	2972693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7622	NC_012668	TAC	2	6	2972746	2972751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7623	NC_012668	CATC	2	8	2972786	2972793	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7624	NC_012668	T	6	6	2972845	2972850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_012668	CAAA	2	8	2972864	2972871	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7626	NC_012668	TCTG	2	8	2972913	2972920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7627	NC_012668	TTAT	2	8	2973008	2973015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_012668	TAT	3	9	2973013	2973021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_012668	TAA	2	6	2973060	2973065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_012668	TCA	2	6	2973240	2973245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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