MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 7996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012668	TCA	2	6	1945058	1945063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_012668	TCT	2	6	1945162	1945167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_012668	TGT	2	6	1945322	1945327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_012668	T	7	7	1945364	1945370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_012668	TGA	2	6	1947852	1947857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012668	AAT	2	6	1949721	1949726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_012668	AGA	2	6	1949753	1949758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_012668	ACA	2	6	1950647	1950652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_012668	TTCTT	2	10	1950673	1950682	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5010	NC_012668	A	7	7	1952615	1952621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_012668	ATG	2	6	1952629	1952634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_012668	CAC	2	6	1952748	1952753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_012668	TGG	2	6	1952761	1952766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_012668	GGT	2	6	1952772	1952777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_012668	CAC	2	6	1952846	1952851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_012668	TGG	2	6	1952859	1952864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_012668	GGT	2	6	1952870	1952875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_012668	TCA	2	6	1952954	1952959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_012668	GCT	2	6	1952975	1952980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_012668	TTG	2	6	1953000	1953005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_012668	TCTA	2	8	1953007	1953014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_012668	TGG	2	6	1953839	1953844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_012668	CTC	2	6	1953878	1953883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_012668	T	6	6	1953916	1953921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_012668	CAT	2	6	1953970	1953975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_012668	TGT	2	6	1954003	1954008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_012668	TAGA	2	8	1954053	1954060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_012668	AG	3	6	1955569	1955574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_012668	GCG	2	6	1955713	1955718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_012668	TTCAC	2	10	1955780	1955789	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5031	NC_012668	TAG	2	6	1955801	1955806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_012668	CGT	2	6	1955839	1955844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_012668	TTG	2	6	1955886	1955891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_012668	GA	3	6	1955905	1955910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_012668	TCA	2	6	1960585	1960590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_012668	TA	3	6	1960600	1960605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_012668	GTT	2	6	1961559	1961564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_012668	ATTA	2	8	1961576	1961583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_012668	T	6	6	1961592	1961597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_012668	GT	3	6	1961613	1961618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_012668	TGT	2	6	1961624	1961629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_012668	TCA	2	6	1961735	1961740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_012668	GTT	2	6	1964249	1964254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_012668	CGC	2	6	1964313	1964318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_012668	ATT	2	6	1964346	1964351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_012668	GCT	2	6	1964357	1964362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_012668	TTA	2	6	1964381	1964386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_012668	ACC	2	6	1964432	1964437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_012668	GAT	2	6	1964476	1964481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_012668	CCGT	2	8	1964505	1964512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_012668	TAA	2	6	1964520	1964525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_012668	GCT	2	6	1964622	1964627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_012668	ACC	2	6	1964633	1964638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_012668	GCT	2	6	1964661	1964666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_012668	TCAA	2	8	1964753	1964760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_012668	A	6	6	1964818	1964823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_012668	TGC	2	6	1964845	1964850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_012668	GC	3	6	1964881	1964886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_012668	TGG	2	6	1964981	1964986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_012668	TCA	2	6	1965020	1965025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_012668	CAC	2	6	1965050	1965055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_012668	AG	3	6	1965114	1965119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_012668	TG	3	6	1965153	1965158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_012668	CTT	2	6	1965173	1965178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_012668	ATAA	2	8	1965197	1965204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_012668	ATTT	2	8	1965206	1965213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_012668	AT	3	6	1965225	1965230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_012668	TGG	2	6	1966149	1966154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_012668	T	7	7	1966239	1966245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_012668	ATAG	2	8	1966246	1966253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_012668	ATTC	2	8	1966827	1966834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5073	NC_012668	A	6	6	1966896	1966901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_012668	AG	3	6	1966913	1966918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_012668	TAA	2	6	1966935	1966940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_012668	AAT	2	6	1966978	1966983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_012668	ATT	2	6	1967205	1967210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_012668	TTG	2	6	1969891	1969896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_012668	CAA	2	6	1969912	1969917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_012668	CCT	2	6	1973993	1973998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_012668	AGTA	2	8	1974050	1974057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_012668	AT	3	6	1974060	1974065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_012668	TTA	2	6	1974068	1974073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_012668	AGG	2	6	1975013	1975018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_012668	T	6	6	1976939	1976944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_012668	TTTAT	2	10	1976967	1976976	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_012668	A	6	6	1976991	1976996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_012668	GCC	2	6	1977005	1977010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5092	NC_012668	CG	3	6	1977801	1977806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5093	NC_012668	TCA	2	6	1977817	1977822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_012668	CA	3	6	1977821	1977826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_012668	GCG	2	6	1978746	1978751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_012668	ATCG	2	8	1979161	1979168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_012668	C	7	7	1981071	1981077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5098	NC_012668	TTTA	2	8	1981081	1981088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_012668	ATT	2	6	1981096	1981101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_012668	CTG	2	6	1981111	1981116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_012668	A	6	6	1981146	1981151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_012668	GCA	2	6	1981207	1981212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_012668	CGTT	2	8	1981223	1981230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_012668	GCC	2	6	1981278	1981283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_012668	AGT	2	6	1981298	1981303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_012668	TA	3	6	1981309	1981314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_012668	GATC	2	8	1981345	1981352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_012668	ATT	2	6	1981396	1981401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_012668	TC	3	6	1981425	1981430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_012668	TCA	2	6	1981439	1981444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_012668	CAAAT	2	10	1981454	1981463	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5112	NC_012668	TGCGC	2	10	1981483	1981492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5113	NC_012668	TGG	2	6	1981537	1981542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_012668	GTTT	2	8	1981564	1981571	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_012668	T	6	6	1981574	1981579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_012668	TAC	2	6	1983922	1983927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5118	NC_012668	GTTT	2	8	1983961	1983968	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_012668	GGT	2	6	1983983	1983988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_012668	A	6	6	1989573	1989578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_012668	ATTT	2	8	1989582	1989589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_012668	ATCA	2	8	1989591	1989598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_012668	GAT	2	6	1989623	1989628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5125	NC_012668	GTT	2	6	1989648	1989653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_012668	T	6	6	1989652	1989657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_012668	AGA	2	6	1989724	1989729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_012668	GTC	2	6	1989740	1989745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_012668	TC	3	6	1990877	1990882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_012668	AAAC	2	8	1990912	1990919	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_012668	ATGC	2	8	1990929	1990936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5133	NC_012668	ATT	2	6	1990969	1990974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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