MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 3627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012667	TCA	2	6	181057	181062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_012667	AG	3	6	181126	181131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012667	TCAA	2	8	182995	183002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_012667	ACA	2	6	183040	183045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_012667	ATA	2	6	184354	184359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012667	A	6	6	184388	184393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012667	A	6	6	184461	184466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012667	TG	3	6	184500	184505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012667	GCA	2	6	184509	184514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_012667	GTT	2	6	184520	184525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012667	T	6	6	184531	184536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012667	A	6	6	184548	184553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012667	A	6	6	184885	184890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012667	TC	3	6	184942	184947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_012667	ATC	2	6	184969	184974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_012667	TAAT	2	8	185002	185009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012667	T	6	6	185082	185087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012667	GTCA	2	8	185110	185117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_012667	GCC	2	6	185124	185129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_012667	AGG	2	6	186939	186944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012667	T	6	6	186946	186951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012667	TCT	2	6	186962	186967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_012667	CAG	2	6	186980	186985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_012667	CA	3	6	187026	187031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_012667	TCA	2	6	187061	187066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_012667	AATA	2	8	187083	187090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012667	A	6	6	187094	187099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012667	AATT	2	8	187124	187131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012667	AAAT	2	8	187146	187153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012667	GT	3	6	187261	187266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012667	GCA	2	6	187276	187281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_012667	AAG	2	6	188689	188694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012667	ATC	2	6	188747	188752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_012667	TTA	2	6	188757	188762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012667	ATC	2	6	188780	188785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_012667	ATG	2	6	188813	188818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012667	CAA	2	6	194224	194229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_012667	A	6	6	194228	194233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012667	TTC	2	6	194255	194260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_012667	TCA	2	6	194306	194311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_012667	TCA	2	6	194338	194343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_012667	TTA	2	6	194351	194356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012667	ATTT	2	8	194366	194373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012667	ATT	2	6	194386	194391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012667	TAA	2	6	194394	194399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012667	AGA	2	6	194405	194410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012667	A	6	6	196087	196092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012667	CAAG	2	8	196160	196167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
549	NC_012667	CAG	2	6	196175	196180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_012667	A	7	7	204787	204793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012667	TTGA	2	8	204815	204822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012667	CAG	2	6	204827	204832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_012667	TCA	2	6	206449	206454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_012667	CGAA	2	8	206490	206497	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_012667	ATT	2	6	206561	206566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012667	TAA	2	6	206574	206579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012667	AATT	2	8	206594	206601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012667	T	7	7	206624	206630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_012667	AAT	2	6	206669	206674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012667	T	7	7	207039	207045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012667	TGTAC	2	10	211233	211242	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
562	NC_012667	T	8	8	211248	211255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012667	ACCA	2	8	211276	211283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_012667	AG	3	6	211355	211360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_012667	TC	3	6	211375	211380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_012667	ATT	2	6	213768	213773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012667	T	6	6	213800	213805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012667	TCT	2	6	213830	213835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_012667	GAC	2	6	213878	213883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_012667	TCT	2	6	213907	213912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_012667	AGC	2	6	213927	213932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_012667	AGC	2	6	216943	216948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_012667	TAT	2	6	217001	217006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012667	GGC	2	6	218629	218634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_012667	AC	3	6	218662	218667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_012667	G	6	6	218675	218680	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012667	AACG	2	8	218681	218688	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_012667	T	6	6	218759	218764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012667	CAA	2	6	222070	222075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_012667	TCAC	2	8	222215	222222	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_012667	GCC	2	6	222225	222230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_012667	GTT	2	6	222246	222251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012667	GATA	2	8	222574	222581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012667	TGAAT	2	10	222605	222614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012667	CGT	2	6	222663	222668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_012667	ATC	2	6	223478	223483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_012667	TAT	2	6	224764	224769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012667	TC	3	6	224779	224784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_012667	ACA	2	6	224827	224832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_012667	TAA	2	6	224851	224856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012667	CAA	2	6	224921	224926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_012667	A	6	6	224925	224930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012667	A	7	7	224966	224972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012667	TA	3	6	225001	225006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012667	AAC	2	6	225030	225035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_012667	CTCAT	2	10	225146	225155	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
597	NC_012667	TTG	2	6	225159	225164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012667	CAA	2	6	225186	225191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_012667	AATATG	2	12	225197	225208	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012667	TTG	2	6	225216	225221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012667	CAC	2	6	226240	226245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_012667	GGT	2	6	226256	226261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012667	AG	3	6	226369	226374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012667	CAA	3	9	227907	227915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_012667	TTG	2	6	228003	228008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012667	GAC	2	6	228024	228029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_012667	CAA	2	6	228067	228072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_012667	TTAC	2	8	228074	228081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_012667	AAT	2	6	228188	228193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012667	T	6	6	228199	228204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012667	A	7	7	230328	230334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012667	TTA	2	6	230367	230372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012667	TA	3	6	230378	230383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012667	AAT	2	6	230386	230391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012667	TAG	2	6	230421	230426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012667	AAG	2	6	231319	231324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_012667	TTC	2	6	231332	231337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_012667	TAA	2	6	233416	233421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012667	TAC	2	6	233426	233431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_012667	ACG	2	6	233539	233544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_012667	TCATG	2	10	233569	233578	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
622	NC_012667	T	6	6	233594	233599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012667	ACC	3	9	233603	233611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_012667	ATCA	2	8	235970	235977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_012667	AAG	2	6	235982	235987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012667	TGG	2	6	237592	237597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012667	AGA	2	6	237635	237640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012667	TGAG	2	8	237662	237669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012667	GA	4	8	237673	237680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012667	TTTGC	2	10	237756	237765	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
631	NC_012667	GTC	2	6	237790	237795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_012667	CCA	2	6	237802	237807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_012667	ACG	2	6	237828	237833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_012667	CT	3	6	237884	237889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_012667	TC	4	8	240493	240500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_012667	AG	3	6	240577	240582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_012667	T	6	6	240585	240590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_012667	A	8	8	240598	240605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_012667	GAG	2	6	240651	240656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
640	NC_012667	ACAAA	2	10	240700	240709	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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