MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 7407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012582	A	6	6	1586317	1586322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_012582	GT	3	6	1587980	1587985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_012582	GAGTA	2	10	1587997	1588006	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_012582	CT	3	6	1588028	1588033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_012582	AGT	2	6	1589393	1589398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_012582	TTCA	2	8	1589415	1589422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_012582	AAG	2	6	1589451	1589456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_012582	A	6	6	1589457	1589462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_012582	TCTAT	2	10	1590788	1590797	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4010	NC_012582	GTACG	2	10	1591482	1591491	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4011	NC_012582	TTG	2	6	1597628	1597633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_012582	CATT	2	8	1597645	1597652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_012582	CAAG	2	8	1599339	1599346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_012582	T	6	6	1599368	1599373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_012582	TTG	2	6	1599377	1599382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_012582	TCAT	2	8	1599478	1599485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4017	NC_012582	GGC	2	6	1600073	1600078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_012582	GGAA	2	8	1600151	1600158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_012582	GAA	2	6	1603528	1603533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_012582	GGT	2	6	1607121	1607126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_012582	TAA	2	6	1607150	1607155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_012582	ATA	2	6	1607239	1607244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_012582	TAA	2	6	1608729	1608734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_012582	A	6	6	1610179	1610184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_012582	AG	3	6	1610199	1610204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_012582	CAG	2	6	1610224	1610229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_012582	A	6	6	1610248	1610253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_012582	CTC	2	6	1610265	1610270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_012582	TC	3	6	1610341	1610346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_012582	TCC	2	6	1610354	1610359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_012582	AATA	2	8	1610387	1610394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_012582	AAT	2	6	1610401	1610406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012582	CTT	2	6	1610423	1610428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_012582	CGG	2	6	1610429	1610434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_012582	AAC	2	6	1610465	1610470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_012582	GAAAA	2	10	1610537	1610546	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_012582	TGA	2	6	1610575	1610580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_012582	GAGC	2	8	1610837	1610844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4039	NC_012582	ATT	2	6	1611611	1611616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_012582	CT	3	6	1611649	1611654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_012582	A	6	6	1611680	1611685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_012582	CGT	2	6	1611691	1611696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_012582	AGAA	2	8	1612784	1612791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_012582	A	8	8	1612828	1612835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_012582	GCA	2	6	1612839	1612844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4047	NC_012582	CAT	2	6	1616812	1616817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_012582	ATCA	2	8	1616944	1616951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_012582	GAT	2	6	1616969	1616974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_012582	AGC	2	6	1616998	1617003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_012582	TTTG	2	8	1619386	1619393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_012582	A	6	6	1620435	1620440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_012582	GAG	2	6	1620466	1620471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_012582	GAG	2	6	1621441	1621446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_012582	AGA	2	6	1621495	1621500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_012582	GAA	2	6	1621509	1621514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_012582	ATG	2	6	1621517	1621522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_012582	CAT	2	6	1621540	1621545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_012582	AAC	2	6	1622304	1622309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_012582	A	6	6	1626115	1626120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_012582	AAGA	2	8	1626124	1626131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_012582	TTA	2	6	1626153	1626158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_012582	TTAA	2	8	1629407	1629414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_012582	TCG	2	6	1629441	1629446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_012582	ACC	2	6	1629451	1629456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_012582	CAA	2	6	1629465	1629470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_012582	TTG	2	6	1629498	1629503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_012582	GTA	2	6	1629570	1629575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_012582	ATC	2	6	1630006	1630011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_012582	AT	3	6	1630055	1630060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_012582	AAG	2	6	1631336	1631341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_012582	AGA	2	6	1631366	1631371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_012582	GCT	2	6	1631388	1631393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4076	NC_012582	TCT	2	6	1633036	1633041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_012582	TTG	2	6	1636657	1636662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_012582	CAA	2	6	1636677	1636682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_012582	TGA	2	6	1636691	1636696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_012582	ATG	2	6	1636703	1636708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4083	NC_012582	ACC	2	6	1636915	1636920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_012582	TCAC	2	8	1637042	1637049	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_012582	CAA	2	6	1637176	1637181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_012582	ACC	2	6	1637222	1637227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4089	NC_012582	TGGT	2	8	1637465	1637472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4091	NC_012582	T	6	6	1637562	1637567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_012582	GCA	2	6	1637568	1637573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_012582	TTA	2	6	1637597	1637602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_012582	GCT	2	6	1637604	1637609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_012582	T	6	6	1637634	1637639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_012582	AAG	2	6	1637762	1637767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_012582	TTG	2	6	1637882	1637887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_012582	AAG	2	6	1637921	1637926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_012582	CAAC	2	8	1637992	1637999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_012582	TGG	3	9	1638086	1638094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_012582	GGT	2	6	1638184	1638189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_012582	AAC	2	6	1638229	1638234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_012582	CAG	2	6	1638287	1638292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_012582	ATCA	2	8	1638349	1638356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_012582	ACC	2	6	1638362	1638367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_012582	AGTG	2	8	1638384	1638391	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_012582	GCG	2	6	1638439	1638444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4109	NC_012582	CAA	2	6	1638509	1638514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_012582	TCG	2	6	1638547	1638552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_012582	GA	3	6	1638600	1638605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_012582	GAT	2	6	1638640	1638645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_012582	GTCT	2	8	1638681	1638688	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_012582	CAG	2	6	1638698	1638703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_012582	CAA	2	6	1638883	1638888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_012582	TGG	2	6	1638957	1638962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_012582	AAT	2	6	1638985	1638990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_012582	CGA	2	6	1638992	1638997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4120	NC_012582	AGCA	2	8	1639215	1639222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_012582	GCC	2	6	1639230	1639235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_012582	TGA	2	6	1639286	1639291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_012582	GCA	2	6	1639293	1639298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_012582	GCTT	2	8	1639365	1639372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_012582	AGA	2	6	1639383	1639388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4128	NC_012582	CGAA	2	8	1639503	1639510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_012582	AAG	2	6	1639523	1639528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4131	NC_012582	ATT	2	6	1639585	1639590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_012582	CTT	2	6	1639683	1639688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_012582	GTCA	2	8	1639788	1639795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4243	NC_012582	GTTT	2	8	1652612	1652619	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_012582	AGAAC	2	10	1652700	1652709	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4245	NC_012582	ACC	2	6	1652723	1652728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4246	NC_012582	A	7	7	1654286	1654292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_012582	GC	3	6	1654710	1654715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4254	NC_012582	TA	3	6	1656837	1656842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_012582	TGCA	2	8	1656873	1656880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4256	NC_012582	GCA	2	6	1656918	1656923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_012582	GCC	2	6	1656925	1656930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4258	NC_012582	AAT	2	6	1658837	1658842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_012582	T	6	6	1658859	1658864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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