MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 7407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012582	CAA	2	6	1122155	1122160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_012582	ACT	2	6	1122171	1122176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_012582	GGC	2	6	1122191	1122196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_012582	AG	3	6	1122198	1122203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_012582	TC	3	6	1122366	1122371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_012582	TTTG	2	8	1122404	1122411	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_012582	ATTA	2	8	1122424	1122431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_012582	TCT	2	6	1123331	1123336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_012582	TACC	2	8	1123384	1123391	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_012582	A	6	6	1124364	1124369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_012582	AG	3	6	1124395	1124400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_012582	AAG	2	6	1124412	1124417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_012582	TGA	2	6	1124445	1124450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_012582	A	6	6	1124452	1124457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_012582	ATCC	2	8	1127849	1127856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_012582	CTTT	2	8	1128674	1128681	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_012582	CAAG	2	8	1128689	1128696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_012582	T	7	7	1130875	1130881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_012582	CAAA	2	8	1131558	1131565	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_012582	TTG	2	6	1133402	1133407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3022	NC_012582	TATT	2	8	1133512	1133519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_012582	TTA	2	6	1133529	1133534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_012582	GGT	2	6	1133566	1133571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_012582	AAAG	2	8	1133620	1133627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3030	NC_012582	CAA	2	6	1135185	1135190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3033	NC_012582	CAA	2	6	1136660	1136665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_012582	TAG	2	6	1136723	1136728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3038	NC_012582	TG	3	6	1136878	1136883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_012582	AAG	2	6	1140577	1140582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3041	NC_012582	TGAT	2	8	1142209	1142216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_012582	TAAT	2	8	1142267	1142274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_012582	AAT	2	6	1142276	1142281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3048	NC_012582	TTG	2	6	1143512	1143517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3054	NC_012582	GATA	2	8	1148399	1148406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_012582	TGC	2	6	1148905	1148910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3063	NC_012582	T	6	6	1150979	1150984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3067	NC_012582	CTG	2	6	1153624	1153629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3070	NC_012582	TTA	2	6	1155354	1155359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_012582	AT	4	8	1157981	1157988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_012582	AATAA	2	10	1161795	1161804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_012582	AAT	2	6	1161812	1161817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_012582	TGCAG	2	10	1161881	1161890	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3097	NC_012582	TGGT	2	8	1161916	1161923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_012582	CTT	2	6	1162039	1162044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3121	NC_012582	GAC	2	6	1163261	1163266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3123	NC_012582	CAA	2	6	1163312	1163317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_012582	CGG	2	6	1163320	1163325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_012582	CAT	2	6	1163380	1163385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_012582	TGA	3	9	1163464	1163472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_012582	GAA	2	6	1163505	1163510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_012582	CGT	2	6	1163517	1163522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_012582	TCA	2	6	1163547	1163552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_012582	CTG	2	6	1163559	1163564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_012582	CAT	2	6	1163612	1163617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_012582	TGA	2	6	1163675	1163680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_012582	CAC	2	6	1163766	1163771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3134	NC_012582	TTC	2	6	1163772	1163777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_012582	TAC	2	6	1163820	1163825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_012582	TGGC	2	8	1163831	1163838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3137	NC_012582	GCG	3	9	1163848	1163856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_012582	CAC	2	6	1163912	1163917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3139	NC_012582	ATG	2	6	1163959	1163964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_012582	AAC	2	6	1164093	1164098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_012582	GT	3	6	1164130	1164135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_012582	A	6	6	1164177	1164182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_012582	TCG	2	6	1164235	1164240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3144	NC_012582	GGC	2	6	1164252	1164257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3145	NC_012582	ATG	2	6	1164258	1164263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_012582	ACT	2	6	1164283	1164288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3147	NC_012582	ATG	2	6	1164292	1164297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_012582	CTT	2	6	1164334	1164339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3149	NC_012582	ACCA	2	8	1164489	1164496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3150	NC_012582	GGT	2	6	1164516	1164521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_012582	GCA	2	6	1164616	1164621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3152	NC_012582	GAA	2	6	1164641	1164646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_012582	GCGG	2	8	1164696	1164703	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3154	NC_012582	TAC	2	6	1164726	1164731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3155	NC_012582	GAA	2	6	1164794	1164799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_012582	GGC	2	6	1164840	1164845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3157	NC_012582	TGG	2	6	1164993	1164998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_012582	CAT	2	6	1165027	1165032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3159	NC_012582	TATT	2	8	1165986	1165993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3160	NC_012582	T	6	6	1166118	1166123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_012582	T	6	6	1166181	1166186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3162	NC_012582	TTG	2	6	1166195	1166200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_012582	GAA	2	6	1166215	1166220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_012582	ATT	2	6	1166226	1166231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_012582	GAG	2	6	1166246	1166251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3166	NC_012582	TGGAT	2	10	1167633	1167642	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_012582	ATTA	2	8	1168178	1168185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_012582	TCT	2	6	1168374	1168379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3171	NC_012582	GAGT	2	8	1171167	1171174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3173	NC_012582	TGT	2	6	1180442	1180447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3174	NC_012582	GTG	2	6	1180613	1180618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3177	NC_012582	TG	3	6	1180705	1180710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3178	NC_012582	GTT	2	6	1180733	1180738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3185	NC_012582	A	6	6	1187567	1187572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3186	NC_012582	TAA	2	6	1191124	1191129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3187	NC_012582	A	7	7	1191141	1191147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3188	NC_012582	GTC	2	6	1191247	1191252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3190	NC_012582	A	8	8	1191357	1191364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3191	NC_012582	TTG	2	6	1191404	1191409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3198	NC_012582	ACTTC	2	10	1192693	1192702	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3200	NC_012582	TAA	2	6	1192785	1192790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3201	NC_012582	TGT	2	6	1192791	1192796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3202	NC_012582	AAC	2	6	1192820	1192825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3203	NC_012582	CA	4	8	1192841	1192848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3204	NC_012582	CAT	2	6	1192850	1192855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3208	NC_012582	CGC	2	6	1195775	1195780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3210	NC_012582	TGG	2	6	1195820	1195825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3211	NC_012582	GTT	2	6	1197346	1197351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3213	NC_012582	ACGT	2	8	1197442	1197449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3220	NC_012582	CAAT	2	8	1197736	1197743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3221	NC_012582	GC	3	6	1197821	1197826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3222	NC_012582	ACC	2	6	1197963	1197968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3223	NC_012582	TGC	2	6	1197987	1197992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3231	NC_012582	CTT	2	6	1198439	1198444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3232	NC_012582	TA	3	6	1198455	1198460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_012582	GCG	2	6	1198463	1198468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3237	NC_012582	T	6	6	1202665	1202670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3240	NC_012582	ATTA	2	8	1204005	1204012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_012582	TTG	2	6	1204044	1204049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_012582	GCT	2	6	1207816	1207821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3243	NC_012582	AGC	2	6	1207830	1207835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3244	NC_012582	GCT	2	6	1208152	1208157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3245	NC_012582	TAC	2	6	1208200	1208205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3247	NC_012582	TGT	2	6	1208236	1208241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_012582	TG	3	6	1208258	1208263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_012582	TTGA	2	8	1209215	1209222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_012582	TCT	2	6	1209226	1209231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_012582	A	6	6	1209308	1209313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_012582	GTC	2	6	1215462	1215467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_012582	TC	3	6	1215509	1215514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_012582	TTC	2	6	1216896	1216901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_012582	TCA	2	6	1216945	1216950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_012582	AGAA	2	8	1218749	1218756	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_012582	AAGAG	2	10	1218849	1218858	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_012582	T	7	7	1218893	1218899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_012582	TGC	2	6	1218907	1218912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_012582	AAAG	2	8	1220323	1220330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3264	NC_012582	TATT	2	8	1221316	1221323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3386	NC_012582	TGA	2	6	1294117	1294122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3388	NC_012582	TCT	2	6	1296013	1296018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3389	NC_012582	T	7	7	1296671	1296677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3390	NC_012582	ATGA	2	8	1296678	1296685	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3391	NC_012582	GCC	2	6	1296724	1296729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3394	NC_012582	AG	3	6	1296864	1296869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3395	NC_012582	CCA	2	6	1296878	1296883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3398	NC_012582	CCA	2	6	1297004	1297009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3402	NC_012582	TGAA	2	8	1297183	1297190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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