MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 7407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012582	GTC	2	6	521127	521132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_012582	CTTT	2	8	527716	527723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_012582	GATA	2	8	527759	527766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_012582	AAAAC	2	10	527782	527791	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1505	NC_012582	CTC	2	6	527821	527826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_012582	CTG	2	6	527827	527832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_012582	AGG	2	6	527887	527892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_012582	ATT	2	6	527894	527899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_012582	CTAC	2	8	527962	527969	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_012582	GCAAG	2	10	527994	528003	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1511	NC_012582	CTC	2	6	528015	528020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_012582	CTG	2	6	528021	528026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_012582	AGG	2	6	528081	528086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_012582	ATT	2	6	528088	528093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_012582	T	6	6	528095	528100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_012582	CTAC	2	8	528157	528164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_012582	CAA	2	6	528205	528210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_012582	ACC	2	6	528242	528247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_012582	GTC	2	6	528327	528332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_012582	A	8	8	528346	528353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_012582	TGT	2	6	528361	528366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_012582	AG	3	6	528454	528459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_012582	GTAG	2	8	528584	528591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_012582	GAC	2	6	528616	528621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_012582	AAG	2	6	528632	528637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_012582	ACG	2	6	528651	528656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_012582	TCAGT	2	10	528666	528675	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1528	NC_012582	ACTGA	2	10	528692	528701	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1529	NC_012582	GCTT	2	8	530410	530417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_012582	AAGT	2	8	530431	530438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012582	A	6	6	530477	530482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_012582	GAA	2	6	530483	530488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_012582	CTC	2	6	530596	530601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_012582	CTG	2	6	530602	530607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_012582	AGG	2	6	530662	530667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_012582	GTG	2	6	530705	530710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_012582	ACC	2	6	530728	530733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_012582	GTG	2	6	530791	530796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_012582	CTAC	2	8	530846	530853	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_012582	CAA	2	6	530899	530904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_012582	GTG	2	6	530915	530920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_012582	ACC	2	6	530938	530943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_012582	TTTCCC	2	12	531014	531025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_012582	T	6	6	531036	531041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_012582	CGG	2	6	531087	531092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_012582	T	6	6	532299	532304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_012582	ATT	3	9	533687	533695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_012582	CAC	2	6	533720	533725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_012582	TGG	2	6	533730	533735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_012582	GGC	2	6	533800	533805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_012582	TAA	2	6	533845	533850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_012582	TTCA	2	8	534678	534685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_012582	GTCT	2	8	534699	534706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_012582	GCC	2	6	534731	534736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_012582	AGT	2	6	534751	534756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_012582	T	6	6	534800	534805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_012582	GCA	2	6	535830	535835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_012582	GCC	2	6	535944	535949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_012582	CTGCAA	2	12	535953	535964	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_012582	CGT	2	6	537825	537830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_012582	A	6	6	538304	538309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_012582	TTA	2	6	540824	540829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_012582	GCTTT	2	10	543016	543025	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1564	NC_012582	TC	3	6	543918	543923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_012582	TCA	2	6	543933	543938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_012582	TAA	2	6	545776	545781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_012582	A	6	6	545780	545785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_012582	A	6	6	545794	545799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_012582	T	6	6	548998	549003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_012582	T	7	7	549052	549058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012582	A	7	7	549626	549632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_012582	AAT	2	6	549698	549703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_012582	A	6	6	551061	551066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_012582	ATTT	2	8	553235	553242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_012582	GAT	2	6	553265	553270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_012582	A	6	6	553271	553276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_012582	GCG	2	6	553284	553289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_012582	AAT	2	6	554213	554218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_012582	ATCT	2	8	554263	554270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1580	NC_012582	AT	3	6	554281	554286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_012582	AAT	2	6	554288	554293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_012582	AAT	2	6	554311	554316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_012582	G	6	6	558801	558806	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_012582	TGC	2	6	558827	558832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_012582	TTTG	2	8	558843	558850	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_012582	T	6	6	558908	558913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_012582	TGAA	2	8	560037	560044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_012582	T	6	6	560068	560073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_012582	AG	3	6	560099	560104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_012582	ATT	2	6	560141	560146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_012582	ATT	2	6	560167	560172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_012582	ACTTTG	2	12	560179	560190	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1593	NC_012582	TA	3	6	561186	561191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_012582	T	6	6	561222	561227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_012582	ATA	2	6	561961	561966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_012582	TAAT	2	8	561985	561992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_012582	ATG	2	6	563000	563005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_012582	ATG	2	6	563752	563757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_012582	CGA	2	6	563769	563774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_012582	TATT	2	8	563858	563865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_012582	T	6	6	563886	563891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_012582	TAA	2	6	563944	563949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_012582	ACT	2	6	563954	563959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_012582	TCA	2	6	563967	563972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_012582	ATTG	2	8	563982	563989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_012582	AAAG	2	8	563990	563997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_012582	AC	3	6	564038	564043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_012582	A	6	6	564198	564203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_012582	TGG	3	9	565718	565726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_012582	CGG	2	6	565741	565746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_012582	TGAC	2	8	565837	565844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_012582	T	8	8	565929	565936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_012582	T	6	6	566025	566030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012582	AAAT	2	8	566037	566044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_012582	TTA	2	6	566896	566901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_012582	A	6	6	566921	566926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_012582	A	6	6	569962	569967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_012582	ATC	2	6	569974	569979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_012582	GAG	2	6	569996	570001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_012582	ATTTT	2	10	570105	570114	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_012582	TGA	2	6	571996	572001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_012582	TTG	2	6	572007	572012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_012582	GTTT	2	8	572157	572164	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_012582	ACA	2	6	572191	572196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_012582	TGG	2	6	572268	572273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_012582	A	6	6	572356	572361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_012582	CTA	2	6	572380	572385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_012582	TGG	2	6	572399	572404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_012582	A	6	6	572566	572571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_012582	AGCTC	2	10	572581	572590	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1631	NC_012582	TGCA	2	8	576354	576361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_012582	ACAA	2	8	576381	576388	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_012582	TTGGG	2	10	576425	576434	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_012582	TGA	2	6	577167	577172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_012582	AGC	2	6	577177	577182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1771	NC_012582	TGCT	2	8	662199	662206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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