MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 7407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012582	GCA	2	6	2692362	2692367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_012582	ACA	2	6	2692389	2692394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_012582	AGTC	2	8	2692397	2692404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6504	NC_012582	CCT	2	6	2694927	2694932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6505	NC_012582	TGA	2	6	2694935	2694940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_012582	TA	3	6	2694995	2695000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_012582	T	6	6	2695013	2695018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_012582	A	6	6	2695062	2695067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_012582	AAAT	2	8	2696492	2696499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_012582	TA	3	6	2696525	2696530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_012582	GCC	2	6	2698047	2698052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_012582	A	8	8	2700967	2700974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_012582	AAT	2	6	2701005	2701010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_012582	T	6	6	2701010	2701015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_012582	TAT	2	6	2702354	2702359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_012582	ATA	2	6	2702382	2702387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_012582	TCA	2	6	2702436	2702441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_012582	AGAC	2	8	2702522	2702529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6519	NC_012582	ACC	2	6	2702559	2702564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6520	NC_012582	TCA	2	6	2702606	2702611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_012582	GCAT	2	8	2702679	2702686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6522	NC_012582	AAAAG	2	10	2702720	2702729	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_012582	TTAT	2	8	2702747	2702754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_012582	AG	3	6	2704352	2704357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_012582	GC	3	6	2704417	2704422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6526	NC_012582	TTA	2	6	2704483	2704488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_012582	GAC	2	6	2705222	2705227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_012582	ATT	2	6	2706618	2706623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_012582	CTT	2	6	2706658	2706663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_012582	ATCT	2	8	2706726	2706733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6531	NC_012582	GTTTT	2	10	2707402	2707411	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_012582	CT	3	6	2707414	2707419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6533	NC_012582	TCG	2	6	2707424	2707429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_012582	TTG	2	6	2709815	2709820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_012582	T	6	6	2709888	2709893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_012582	T	6	6	2711165	2711170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_012582	TCT	2	6	2714273	2714278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_012582	GGACG	2	10	2714279	2714288	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6539	NC_012582	GATT	2	8	2714484	2714491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_012582	TTCAC	2	10	2715394	2715403	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6541	NC_012582	TAA	2	6	2717653	2717658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_012582	CCACA	2	10	2719175	2719184	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6543	NC_012582	TGA	2	6	2725050	2725055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_012582	TTC	2	6	2725138	2725143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_012582	CGC	2	6	2725217	2725222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_012582	A	6	6	2729719	2729724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_012582	ATA	2	6	2731614	2731619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_012582	GGC	2	6	2731641	2731646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_012582	ATTC	2	8	2731648	2731655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6550	NC_012582	CAT	2	6	2731692	2731697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_012582	ACT	2	6	2734418	2734423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_012582	ATT	2	6	2734466	2734471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_012582	GCA	2	6	2734504	2734509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_012582	TA	3	6	2734572	2734577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_012582	GTG	2	6	2734578	2734583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_012582	GAT	2	6	2734653	2734658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_012582	CT	3	6	2736455	2736460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6558	NC_012582	TTTG	2	8	2737154	2737161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_012582	CAGA	2	8	2737183	2737190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6560	NC_012582	A	6	6	2737229	2737234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_012582	T	6	6	2737261	2737266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_012582	GTG	2	6	2737272	2737277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_012582	AAC	2	6	2737278	2737283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_012582	TCAT	2	8	2738259	2738266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6565	NC_012582	TCA	2	6	2738311	2738316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_012582	AC	3	6	2738341	2738346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6567	NC_012582	CAAA	2	8	2738379	2738386	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6568	NC_012582	TTAT	2	8	2738394	2738401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_012582	ATTAA	2	10	2738411	2738420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_012582	CAAAAC	2	12	2738434	2738445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_012582	GAG	2	6	2738469	2738474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_012582	CT	3	6	2738500	2738505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6573	NC_012582	CGCC	2	8	2738575	2738582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6574	NC_012582	T	7	7	2738595	2738601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_012582	ATT	2	6	2738605	2738610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_012582	GGCT	2	8	2738668	2738675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6577	NC_012582	TCA	2	6	2738689	2738694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_012582	AGA	2	6	2738713	2738718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_012582	ATTC	2	8	2738766	2738773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6580	NC_012582	AGTA	2	8	2738796	2738803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_012582	CCA	2	6	2738813	2738818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6582	NC_012582	TTG	2	6	2739176	2739181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_012582	CGCGC	2	10	2743641	2743650	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6584	NC_012582	C	6	6	2744354	2744359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6585	NC_012582	T	6	6	2744401	2744406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_012582	A	7	7	2744460	2744466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_012582	TGG	2	6	2745830	2745835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_012582	AAC	2	6	2745870	2745875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_012582	T	6	6	2745891	2745896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_012582	TGCTT	2	10	2745902	2745911	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6591	NC_012582	GGC	2	6	2745955	2745960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_012582	GAAC	2	8	2746007	2746014	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6593	NC_012582	TCGG	2	8	2748302	2748309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6594	NC_012582	GGTT	2	8	2748316	2748323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_012582	CAA	2	6	2748415	2748420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_012582	CAG	2	6	2748470	2748475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_012582	A	8	8	2748554	2748561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_012582	ATT	2	6	2748566	2748571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_012582	TTG	2	6	2748647	2748652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_012582	ATA	2	6	2748741	2748746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_012582	T	6	6	2750595	2750600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_012582	A	6	6	2750680	2750685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_012582	GTC	2	6	2751716	2751721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_012582	A	6	6	2751879	2751884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_012582	TAA	2	6	2751889	2751894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_012582	AATT	2	8	2751902	2751909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_012582	ATTA	2	8	2751950	2751957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_012582	TCCT	2	8	2753630	2753637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6609	NC_012582	GGTGA	2	10	2753641	2753650	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_012582	GCA	2	6	2753667	2753672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_012582	TTGT	2	8	2753692	2753699	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_012582	AGCG	2	8	2753713	2753720	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6613	NC_012582	TCA	2	6	2754402	2754407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_012582	TTC	2	6	2754438	2754443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_012582	A	6	6	2754508	2754513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_012582	TG	3	6	2754569	2754574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_012582	TC	3	6	2754601	2754606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6618	NC_012582	CTA	2	6	2754616	2754621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_012582	CA	3	6	2754667	2754672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6620	NC_012582	A	6	6	2754677	2754682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_012582	T	7	7	2754700	2754706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_012582	ACA	2	6	2754720	2754725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_012582	ACACAA	2	12	2756394	2756405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_012582	CTC	2	6	2757547	2757552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_012582	CT	3	6	2757558	2757563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6626	NC_012582	GAA	2	6	2757573	2757578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_012582	T	6	6	2759631	2759636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_012582	GAAA	2	8	2759642	2759649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_012582	CAAA	2	8	2760666	2760673	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6630	NC_012582	CA	3	6	2760787	2760792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6631	NC_012582	TTAAA	2	10	2760826	2760835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6632	NC_012582	GTTTC	2	10	2760889	2760898	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6633	NC_012582	CAA	2	6	2760995	2761000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6634	NC_012582	CA	4	8	2761024	2761031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6635	NC_012582	AC	3	6	2761136	2761141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6763	NC_012582	ATGA	2	8	2786958	2786965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6793	NC_012582	TTTG	2	8	2817967	2817974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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