MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 7407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012582	CG	3	6	2197600	2197605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_012582	CCAT	2	8	2198205	2198212	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_012582	T	6	6	2198221	2198226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_012582	ATCT	2	8	2199632	2199639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_012582	GTT	2	6	2199761	2199766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_012582	ATT	2	6	2199768	2199773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_012582	CTT	2	6	2202268	2202273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_012582	TAT	2	6	2202278	2202283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_012582	ATG	2	6	2202286	2202291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_012582	ATT	2	6	2202338	2202343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_012582	TCC	2	6	2202346	2202351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_012582	CAG	2	6	2206346	2206351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_012582	AAAGAG	2	12	2208822	2208833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_012582	CGC	2	6	2208842	2208847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_012582	GAA	2	6	2208853	2208858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_012582	GA	3	6	2213564	2213569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_012582	GA	3	6	2213595	2213600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_012582	TCT	2	6	2213661	2213666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_012582	A	6	6	2213702	2213707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_012582	ATT	2	6	2213741	2213746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_012582	GCA	2	6	2214984	2214989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_012582	AAAAC	2	10	2215742	2215751	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5523	NC_012582	TGA	2	6	2220182	2220187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_012582	CTT	2	6	2220199	2220204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_012582	AGA	2	6	2220214	2220219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_012582	TAT	2	6	2220233	2220238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_012582	TGC	2	6	2220246	2220251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_012582	AGA	2	6	2221529	2221534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_012582	GA	3	6	2221533	2221538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_012582	CTT	2	6	2221539	2221544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_012582	GAAA	2	8	2221547	2221554	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_012582	A	6	6	2221587	2221592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_012582	CTC	2	6	2223321	2223326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5534	NC_012582	TGGC	2	8	2223332	2223339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_012582	TTG	3	9	2223347	2223355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_012582	TCA	2	6	2223356	2223361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_012582	AGT	2	6	2223365	2223370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_012582	ACAGC	2	10	2223393	2223402	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5539	NC_012582	GAGT	2	8	2225188	2225195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_012582	TCT	2	6	2225205	2225210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_012582	ATTA	2	8	2228276	2228283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_012582	GGCT	2	8	2228300	2228307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_012582	GCC	3	9	2228317	2228325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_012582	T	6	6	2228332	2228337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_012582	A	6	6	2228344	2228349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_012582	A	6	6	2228379	2228384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_012582	ATTTTT	2	12	2228413	2228424	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_012582	GTT	2	6	2228433	2228438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_012582	CAG	2	6	2229285	2229290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_012582	CAA	2	6	2229343	2229348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_012582	CTT	2	6	2231366	2231371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_012582	TTG	2	6	2231470	2231475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_012582	AAG	2	6	2233471	2233476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_012582	CGC	2	6	2233511	2233516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_012582	AGA	2	6	2234571	2234576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_012582	ATT	2	6	2234638	2234643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_012582	TAAA	2	8	2235013	2235020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_012582	GCG	2	6	2235890	2235895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_012582	CGG	2	6	2235945	2235950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_012582	CACC	2	8	2236000	2236007	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5561	NC_012582	GTC	2	6	2236019	2236024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_012582	A	7	7	2236649	2236655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_012582	T	8	8	2236663	2236670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_012582	TAC	2	6	2236730	2236735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_012582	GAA	2	6	2237786	2237791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_012582	AGC	2	6	2238824	2238829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_012582	AAC	2	6	2238842	2238847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_012582	GGC	2	6	2238863	2238868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_012582	TGC	2	6	2238985	2238990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_012582	AT	3	6	2239087	2239092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_012582	AGTG	2	8	2239126	2239133	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_012582	GAAC	2	8	2239171	2239178	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5573	NC_012582	CG	3	6	2240353	2240358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_012582	TCC	2	6	2242225	2242230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_012582	TTGC	2	8	2242263	2242270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5576	NC_012582	CA	3	6	2242279	2242284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_012582	T	6	6	2242307	2242312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_012582	TGA	2	6	2242339	2242344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_012582	GA	3	6	2242350	2242355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_012582	TAAATG	2	12	2243783	2243794	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_012582	CTT	2	6	2243816	2243821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_012582	GCG	2	6	2245056	2245061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_012582	T	7	7	2245086	2245092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_012582	TGC	2	6	2245193	2245198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_012582	AACA	2	8	2245231	2245238	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5586	NC_012582	CAG	2	6	2245243	2245248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_012582	AACAG	2	10	2245254	2245263	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5588	NC_012582	ATA	2	6	2245275	2245280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_012582	ACT	2	6	2245311	2245316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_012582	GGC	2	6	2245331	2245336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_012582	GCC	2	6	2245348	2245353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_012582	TTC	2	6	2245384	2245389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_012582	GCA	2	6	2245444	2245449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_012582	AAG	3	9	2246953	2246961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_012582	CTT	2	6	2246972	2246977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_012582	GTC	2	6	2248359	2248364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_012582	T	6	6	2249046	2249051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_012582	AGAC	2	8	2249052	2249059	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_012582	CTTT	2	8	2249063	2249070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5600	NC_012582	ACCCAA	2	12	2249161	2249172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_012582	TA	3	6	2249206	2249211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_012582	ATT	2	6	2249264	2249269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_012582	AC	3	6	2249283	2249288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5604	NC_012582	AT	4	8	2249334	2249341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_012582	AACT	2	8	2249342	2249349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_012582	ATG	2	6	2250966	2250971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_012582	AAAG	2	8	2251016	2251023	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_012582	ACG	2	6	2251068	2251073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_012582	A	6	6	2251111	2251116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_012582	GAA	2	6	2251147	2251152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_012582	AT	3	6	2252707	2252712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_012582	CGA	2	6	2252741	2252746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_012582	ATT	2	6	2252839	2252844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_012582	TAAA	2	8	2252866	2252873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_012582	CAA	2	6	2252935	2252940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_012582	TTAT	2	8	2252972	2252979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_012582	A	6	6	2252989	2252994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_012582	CGCT	2	8	2253004	2253011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5619	NC_012582	T	6	6	2253011	2253016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_012582	TGA	2	6	2257275	2257280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_012582	ATA	2	6	2258532	2258537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_012582	AATTGA	2	12	2258546	2258557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_012582	GA	3	6	2258561	2258566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_012582	GGC	2	6	2258591	2258596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_012582	GCC	2	6	2258603	2258608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_012582	GAG	2	6	2258610	2258615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_012582	TTAC	2	8	2259019	2259026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5628	NC_012582	CA	3	6	2259033	2259038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_012582	A	6	6	2263615	2263620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_012582	T	8	8	2263626	2263633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_012582	AG	3	6	2263644	2263649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_012582	TGC	2	6	2263679	2263684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_012582	GAT	2	6	2263697	2263702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_012582	GTAAA	2	10	2263704	2263713	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5635	NC_012582	CAA	2	6	2263759	2263764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5636	NC_012582	CGA	2	6	2263812	2263817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5637	NC_012582	ATC	2	6	2265504	2265509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5639	NC_012582	TTG	2	6	2265536	2265541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5640	NC_012582	T	6	6	2265543	2265548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5641	NC_012582	AAT	2	6	2265562	2265567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5645	NC_012582	TTG	2	6	2265743	2265748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5649	NC_012582	CTTT	2	8	2269151	2269158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5650	NC_012582	CAT	2	6	2269192	2269197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5662	NC_012582	A	7	7	2274831	2274837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5663	NC_012582	TGC	2	6	2274861	2274866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5664	NC_012582	ACTTA	2	10	2274892	2274901	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5665	NC_012582	A	7	7	2274954	2274960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5667	NC_012582	ACC	2	6	2275205	2275210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5673	NC_012582	ACGC	2	8	2275396	2275403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5681	NC_012582	CTCAC	2	10	2277509	2277518	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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5749	NC_012582	TCAC	2	8	2321246	2321253	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5753	NC_012582	A	7	7	2325022	2325028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5754	NC_012582	TTA	2	6	2327684	2327689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5756	NC_012582	TGT	2	6	2329754	2329759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5757	NC_012582	TTC	2	6	2329775	2329780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5758	NC_012582	AGT	2	6	2333988	2333993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5761	NC_012582	TTTC	2	8	2337429	2337436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5762	NC_012582	TC	3	6	2337456	2337461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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