MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 7407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012582	GAA	2	6	1753129	1753134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_012582	GCG	2	6	1754281	1754286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_012582	GCC	2	6	1754295	1754300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_012582	CT	3	6	1755753	1755758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_012582	CTG	2	6	1755794	1755799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_012582	T	6	6	1755816	1755821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_012582	ACAAA	2	10	1755850	1755859	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4508	NC_012582	TGA	2	6	1756005	1756010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_012582	TCA	2	6	1756014	1756019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_012582	TCA	2	6	1759328	1759333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_012582	TAA	2	6	1759336	1759341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_012582	ATAC	2	8	1759359	1759366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4513	NC_012582	GCAT	2	8	1759375	1759382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_012582	GAC	2	6	1760566	1760571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_012582	TCT	2	6	1760582	1760587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_012582	A	6	6	1760654	1760659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_012582	T	7	7	1760665	1760671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_012582	ATC	2	6	1760683	1760688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_012582	A	6	6	1768732	1768737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_012582	AAAC	2	8	1768740	1768747	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_012582	ATTTG	2	10	1768848	1768857	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_012582	TGA	2	6	1768867	1768872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_012582	AAT	2	6	1768910	1768915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_012582	GATAAG	2	12	1768931	1768942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_012582	ACT	2	6	1769008	1769013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_012582	GGC	2	6	1769028	1769033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_012582	GAAC	2	8	1769080	1769087	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4528	NC_012582	T	6	6	1769160	1769165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_012582	ATC	2	6	1769193	1769198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_012582	ATA	2	6	1769208	1769213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_012582	GAA	2	6	1769228	1769233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_012582	G	7	7	1769234	1769240	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_012582	CGAT	2	8	1771129	1771136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_012582	G	6	6	1772417	1772422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_012582	TG	3	6	1772471	1772476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_012582	CG	3	6	1772491	1772496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_012582	ATC	2	6	1772506	1772511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_012582	CTT	2	6	1772520	1772525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_012582	CAAT	2	8	1773392	1773399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4540	NC_012582	TGAC	2	8	1773408	1773415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_012582	CCT	2	6	1775230	1775235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_012582	TACT	2	8	1776191	1776198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_012582	AGG	2	6	1776250	1776255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_012582	TTG	2	6	1780331	1780336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_012582	CAA	2	6	1780352	1780357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_012582	ATT	2	6	1783265	1783270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_012582	TTA	2	6	1783308	1783313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_012582	CT	3	6	1783330	1783335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_012582	T	6	6	1783347	1783352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_012582	TGAA	2	8	1783412	1783419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_012582	CTAT	2	8	1783994	1784001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4552	NC_012582	A	7	7	1784002	1784008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_012582	CCA	2	6	1784093	1784098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_012582	GAT	2	6	1784112	1784117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_012582	AAAT	2	8	1784121	1784128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_012582	ACC	2	6	1785023	1785028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_012582	AT	3	6	1785030	1785035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_012582	AT	3	6	1785049	1785054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_012582	TTAT	2	8	1785056	1785063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_012582	AAG	2	6	1785082	1785087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_012582	AC	3	6	1785101	1785106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_012582	GGC	2	6	1785942	1785947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4564	NC_012582	AAC	2	6	1786007	1786012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_012582	TGA	2	6	1788521	1788526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_012582	ACA	2	6	1788632	1788637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_012582	CA	3	6	1788642	1788647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4568	NC_012582	A	6	6	1788664	1788669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_012582	ATTA	2	8	1788676	1788683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_012582	CAA	2	6	1788696	1788701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_012582	TA	3	6	1789656	1789661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_012582	TGA	2	6	1789671	1789676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_012582	ACG	2	6	1794417	1794422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_012582	CTA	2	6	1794455	1794460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4577	NC_012582	ACA	2	6	1796253	1796258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_012582	ATG	2	6	1796286	1796291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_012582	A	6	6	1796340	1796345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_012582	ATAG	2	8	1797246	1797253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_012582	CAA	2	6	1797256	1797261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_012582	CAG	2	6	1797280	1797285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4585	NC_012582	CCA	2	6	1797397	1797402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4586	NC_012582	GGT	2	6	1797409	1797414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_012582	ACC	2	6	1797484	1797489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4588	NC_012582	CCA	2	6	1797495	1797500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_012582	GGT	2	6	1797507	1797512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_012582	TCA	2	6	1797626	1797631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_012582	T	7	7	1797640	1797646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_012582	TATT	2	8	1797980	1797987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_012582	CGT	2	6	1797999	1798004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4597	NC_012582	ATT	2	6	1798197	1798202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_012582	GCA	2	6	1798214	1798219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_012582	CT	3	6	1798233	1798238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_012582	GGT	2	6	1798278	1798283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_012582	CA	3	6	1798364	1798369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_012582	TCAC	2	8	1798378	1798385	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_012582	CAT	2	6	1798388	1798393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_012582	T	6	6	1798455	1798460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_012582	ACA	2	6	1798547	1798552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_012582	CAGC	2	8	1798650	1798657	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_012582	AG	3	6	1798672	1798677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_012582	GT	4	8	1798706	1798713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_012582	GAA	2	6	1798790	1798795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_012582	CTA	2	6	1798832	1798837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_012582	CAA	2	6	1798846	1798851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_012582	AAAGA	2	10	1799573	1799582	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_012582	TGT	2	6	1799604	1799609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4615	NC_012582	ATT	2	6	1800530	1800535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_012582	TCT	2	6	1801596	1801601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4619	NC_012582	CAA	2	6	1804930	1804935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_012582	ATG	2	6	1805192	1805197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_012582	GAC	2	6	1805247	1805252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_012582	AGTT	2	8	1805270	1805277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_012582	CCT	2	6	1805300	1805305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_012582	AAC	2	6	1805371	1805376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_012582	T	6	6	1805398	1805403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_012582	TTTG	2	8	1805423	1805430	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_012582	TCA	2	6	1805434	1805439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_012582	A	6	6	1805443	1805448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_012582	ATTC	2	8	1805466	1805473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4630	NC_012582	GCC	2	6	1811684	1811689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4632	NC_012582	GGGA	2	8	1811873	1811880	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_012582	CCT	2	6	1812832	1812837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4634	NC_012582	TTTA	2	8	1812843	1812850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_012582	TGCC	2	8	1812907	1812914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4665	NC_012582	AT	3	6	1816450	1816455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4675	NC_012582	GCGT	2	8	1825519	1825526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4676	NC_012582	TTG	2	6	1825531	1825536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4751	NC_012582	AAGA	2	8	1860645	1860652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4753	NC_012582	TCA	2	6	1860679	1860684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4754	NC_012582	CAA	2	6	1860709	1860714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4755	NC_012582	GCGT	2	8	1860742	1860749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4756	NC_012582	TCTT	2	8	1860759	1860766	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4757	NC_012582	CTC	2	6	1860768	1860773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4759	NC_012582	CG	4	8	1860813	1860820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4760	NC_012582	GCA	2	6	1860975	1860980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4762	NC_012582	ATCG	2	8	1861089	1861096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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