MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 2967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012580	TAA	2	6	432321	432326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_012580	GGA	2	6	432342	432347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_012580	GAA	2	6	432377	432382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_012580	A	6	6	432394	432399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_012580	TGC	2	6	433399	433404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_012580	TAT	2	6	433475	433480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_012580	CTTTA	2	10	433490	433499	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1508	NC_012580	TGA	2	6	434935	434940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_012580	AT	3	6	435018	435023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012580	GATT	2	8	435024	435031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_012580	A	6	6	435047	435052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_012580	A	6	6	435067	435072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_012580	GGA	2	6	435146	435151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_012580	TGGA	2	8	435173	435180	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_012580	AT	3	6	435223	435228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_012580	GC	3	6	435277	435282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_012580	CTTT	2	8	436385	436392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_012580	GA	3	6	437422	437427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_012580	ATG	2	6	437433	437438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_012580	CAG	2	6	437452	437457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_012580	GAA	2	6	437523	437528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_012580	TA	3	6	437598	437603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_012580	CTT	2	6	437637	437642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_012580	TAGT	2	8	437653	437660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_012580	T	7	7	439603	439609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_012580	GGA	2	6	442940	442945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_012580	AAG	2	6	443000	443005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_012580	TAAAA	2	10	445189	445198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_012580	AC	3	6	445355	445360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_012580	T	6	6	445668	445673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012580	TC	3	6	445695	445700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_012580	TTAG	2	8	445742	445749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_012580	CGT	2	6	446572	446577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_012580	ACA	2	6	446579	446584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_012580	CAA	2	6	446637	446642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_012580	TTAC	2	8	447150	447157	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_012580	CCT	2	6	447166	447171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_012580	ACGC	2	8	448042	448049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_012580	TCAA	2	8	448149	448156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_012580	GATG	2	8	448202	448209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_012580	TCG	2	6	448364	448369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_012580	GAT	2	6	448747	448752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_012580	ATG	2	6	448796	448801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_012580	TGT	2	6	449017	449022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_012580	CTT	2	6	449087	449092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_012580	TGG	2	6	449110	449115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_012580	AGTC	2	8	449174	449181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_012580	CTT	2	6	449188	449193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_012580	TGT	2	6	449240	449245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_012580	GTTC	2	8	449261	449268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_012580	T	6	6	449272	449277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_012580	CTT	2	6	449284	449289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_012580	AAT	2	6	449340	449345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_012580	TCAT	2	8	450531	450538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_012580	GCTT	2	8	450576	450583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_012580	ACA	2	6	452116	452121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_012580	TGAA	2	8	452264	452271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_012580	ATAGG	2	10	452276	452285	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_012580	AATG	2	8	453241	453248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_012580	TAT	2	6	453262	453267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_012580	TTC	2	6	453304	453309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_012580	A	6	6	453941	453946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_012580	CA	3	6	454013	454018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_012580	TG	3	6	454023	454028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_012580	T	6	6	454031	454036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_012580	GAA	2	6	455877	455882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_012580	AG	3	6	455919	455924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_012580	CGG	2	6	455955	455960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_012580	TAGGA	2	10	455963	455972	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_012580	AG	3	6	455980	455985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012580	GCTT	2	8	457828	457835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_012580	GGGA	2	8	457873	457880	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_012580	TAGTGG	2	12	457913	457924	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_012580	TGGG	2	8	457927	457934	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_012580	TATC	2	8	457950	457957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_012580	T	7	7	458046	458052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_012580	AGT	2	6	458101	458106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_012580	GTC	2	6	458123	458128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_012580	CGA	2	6	458188	458193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_012580	TTG	2	6	458217	458222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_012580	CGA	2	6	458260	458265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_012580	GGA	2	6	458285	458290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_012580	GTT	2	6	459279	459284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_012580	GTT	2	6	459326	459331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_012580	T	6	6	459336	459341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_012580	A	6	6	459349	459354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_012580	CAA	2	6	459520	459525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_012580	AG	3	6	459543	459548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_012580	T	6	6	459780	459785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_012580	TAT	2	6	459855	459860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_012580	ATC	2	6	459885	459890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_012580	TAAA	2	8	460473	460480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_012580	TAT	2	6	460491	460496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_012580	CTT	2	6	460594	460599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_012580	GCA	2	6	460620	460625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_012580	T	6	6	460629	460634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_012580	GAC	2	6	460635	460640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_012580	CCT	2	6	461765	461770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_012580	ACA	2	6	462023	462028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_012580	AAT	2	6	462030	462035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_012580	T	6	6	462160	462165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_012580	GAA	2	6	462174	462179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_012580	CAG	2	6	464511	464516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_012580	AAG	2	6	464557	464562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_012580	GCTT	2	8	464626	464633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_012580	AGTG	2	8	464684	464691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_012580	GAAC	2	8	464799	464806	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_012580	TA	3	6	464879	464884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_012580	CAA	2	6	466210	466215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_012580	GC	3	6	466226	466231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_012580	A	6	6	466281	466286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_012580	TCA	2	6	466302	466307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_012580	TGT	2	6	466309	466314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012580	GAA	2	6	466321	466326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_012580	TGG	2	6	466330	466335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_012580	TGA	2	6	466366	466371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_012580	ATC	2	6	466372	466377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_012580	CTT	2	6	466405	466410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_012580	TTA	2	6	466427	466432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_012580	TAA	2	6	466444	466449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_012580	TTC	2	6	466484	466489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_012580	A	6	6	466505	466510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_012580	CTA	2	6	466515	466520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_012580	TGGTT	2	10	467113	467122	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_012580	ATG	2	6	467170	467175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1627	NC_012580	CTG	2	6	467296	467301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_012580	AAT	2	6	467360	467365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_012580	TTTTC	2	10	468852	468861	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1630	NC_012580	TAG	2	6	468876	468881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_012580	TGA	2	6	468939	468944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_012580	ATT	3	9	470673	470681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_012580	TGA	2	6	473037	473042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_012580	CGT	2	6	473132	473137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_012580	TG	3	6	474081	474086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_012580	AAG	2	6	477182	477187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_012580	GA	4	8	662100	662107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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