MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 2967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012580	ACGG	2	8	203670	203677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_012580	AAT	2	6	203683	203688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012580	CCAA	2	8	203689	203696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_012580	T	6	6	204324	204329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012580	TTG	2	6	204347	204352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012580	T	6	6	204458	204463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012580	T	6	6	204477	204482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012580	AATG	2	8	204518	204525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012580	AGGT	2	8	204547	204554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012580	TTAA	2	8	204949	204956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012580	TGGCT	2	10	205073	205082	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
512	NC_012580	ACA	2	6	205150	205155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_012580	CAC	2	6	205461	205466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_012580	GGT	2	6	205528	205533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012580	CAA	2	6	209581	209586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_012580	A	6	6	211906	211911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012580	TCC	2	6	212514	212519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_012580	GA	3	6	212982	212987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012580	A	8	8	212987	212994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012580	T	7	7	213040	213046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012580	TAC	2	6	213081	213086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_012580	TCT	2	6	214252	214257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_012580	GCTT	2	8	214266	214273	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
524	NC_012580	TGC	2	6	214312	214317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_012580	GTA	2	6	214481	214486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012580	TAA	2	6	215744	215749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012580	CTT	2	6	219700	219705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_012580	ACG	2	6	219744	219749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_012580	CTTA	2	8	220205	220212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_012580	TCT	2	6	220230	220235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_012580	CAC	2	6	220276	220281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_012580	GGT	2	6	220292	220297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012580	CTTT	2	8	220332	220339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_012580	AAG	2	6	220488	220493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012580	ACT	2	6	220657	220662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_012580	CTT	2	6	220673	220678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_012580	TAG	2	6	222124	222129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012580	GA	4	8	222162	222169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012580	GTC	2	6	222182	222187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_012580	T	6	6	223726	223731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012580	TTG	2	6	223741	223746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012580	CAAGC	2	10	223774	223783	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
543	NC_012580	GGCTT	2	10	223788	223797	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
544	NC_012580	TTCCT	2	10	224652	224661	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
545	NC_012580	GCAA	2	8	224662	224669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
546	NC_012580	ATG	2	6	225422	225427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012580	CA	4	8	225435	225442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_012580	AAG	2	6	225511	225516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012580	CCTT	2	8	229145	229152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_012580	GGA	2	6	229328	229333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012580	GT	3	6	230342	230347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012580	CAG	2	6	232007	232012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_012580	A	6	6	232016	232021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012580	CTT	2	6	232042	232047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_012580	ACA	2	6	232072	232077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_012580	TGA	2	6	232123	232128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012580	TCA	2	6	232165	232170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_012580	GC	3	6	232205	232210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_012580	AC	3	6	232262	232267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_012580	GAC	2	6	232293	232298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_012580	TCATC	2	10	235177	235186	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
562	NC_012580	T	6	6	235188	235193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012580	GGAT	2	8	235255	235262	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012580	CTT	2	6	236554	236559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_012580	TGA	2	6	236680	236685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_012580	TCT	3	9	236697	236705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_012580	AACTT	2	10	236844	236853	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
568	NC_012580	T	7	7	236852	236858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012580	ATT	2	6	236861	236866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012580	AATT	2	8	236893	236900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012580	AAATT	2	10	236917	236926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012580	ATA	2	6	236938	236943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012580	ATT	2	6	236974	236979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012580	AGTA	2	8	237078	237085	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_012580	TGG	2	6	237088	237093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_012580	AT	3	6	237100	237105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012580	GGC	2	6	237132	237137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_012580	AG	3	6	237139	237144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012580	TG	3	6	237170	237175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_012580	GAAC	2	8	237184	237191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_012580	AAG	2	6	237219	237224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012580	ACTCA	2	10	237363	237372	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
583	NC_012580	AGA	2	6	237380	237385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012580	TTA	2	6	237390	237395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012580	AT	3	6	237419	237424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012580	T	6	6	237431	237436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012580	AGT	2	6	237438	237443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012580	TTTG	2	8	237459	237466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012580	TC	3	6	237471	237476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_012580	TAA	2	6	237480	237485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012580	TTTA	2	8	239820	239827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012580	AAT	2	6	239859	239864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012580	TAC	2	6	239872	239877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_012580	CAG	2	6	240005	240010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_012580	T	6	6	240015	240020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_012580	AAGC	2	8	241702	241709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
597	NC_012580	TGA	2	6	241725	241730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012580	T	6	6	241773	241778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_012580	T	6	6	241792	241797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012580	TTA	2	6	241849	241854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012580	CTTCT	2	10	241905	241914	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
602	NC_012580	TTAA	2	8	241918	241925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012580	A	6	6	243863	243868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012580	GAAGGA	2	12	243897	243908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012580	TGGC	2	8	247064	247071	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
606	NC_012580	ATT	2	6	247093	247098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012580	ATC	2	6	247144	247149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_012580	TAA	2	6	247165	247170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012580	GTTA	2	8	247238	247245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012580	TAAA	2	8	247253	247260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012580	AATA	2	8	247274	247281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012580	AT	3	6	247307	247312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012580	ATAAA	2	10	247338	247347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012580	AAT	2	6	247352	247357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012580	GTG	2	6	247399	247404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012580	CGC	2	6	247443	247448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_012580	CGA	2	6	247483	247488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_012580	T	6	6	247600	247605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012580	TCTA	2	8	248442	248449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_012580	TCAC	2	8	248533	248540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_012580	GCC	2	6	248543	248548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_012580	CA	3	6	248673	248678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_012580	CT	3	6	248715	248720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_012580	GGAA	2	8	248772	248779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012580	GGA	2	6	249703	249708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012580	CTC	2	6	249718	249723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_012580	GCA	2	6	252394	252399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_012580	CAT	2	6	255907	255912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_012580	TGA	2	6	255979	255984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012580	TCT	2	6	256018	256023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_012580	CAA	2	6	256034	256039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_012580	A	7	7	256038	256044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012580	A	6	6	256059	256064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012580	ATT	2	6	256091	256096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_012580	AAT	2	6	256098	256103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_012580	ACG	2	6	257367	257372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_012580	TCAA	2	8	257786	257793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
638	NC_012580	CCTT	2	8	258432	258439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_012580	GT	3	6	258613	258618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_012580	GATGGA	2	12	258626	258637	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
641	NC_012580	TGG	2	6	261065	261070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
642	NC_012580	CGC	2	6	261099	261104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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