MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 6657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012578	CTT	2	6	1677797	1677802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_012578	AT	3	6	1678709	1678714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_012578	ATCAC	2	10	1678745	1678754	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4004	NC_012578	GAA	2	6	1680038	1680043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_012578	TC	3	6	1680659	1680664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_012578	TTA	2	6	1680698	1680703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_012578	CTTC	2	8	1688544	1688551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_012578	CAA	2	6	1688645	1688650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_012578	TCACA	2	10	1688670	1688679	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4010	NC_012578	ATC	2	6	1688710	1688715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_012578	TTTA	2	8	1688773	1688780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_012578	GCGT	2	8	1688804	1688811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_012578	TTG	2	6	1688816	1688821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_012578	TCAT	2	8	1688878	1688885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_012578	CA	3	6	1690880	1690885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_012578	T	6	6	1690911	1690916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_012578	GTT	2	6	1690917	1690922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_012578	T	6	6	1690921	1690926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_012578	TCA	2	6	1690938	1690943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_012578	ACT	2	6	1692250	1692255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_012578	GAAC	2	8	1692322	1692329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_012578	T	6	6	1696549	1696554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_012578	GAT	2	6	1696563	1696568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_012578	GTC	2	6	1696653	1696658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_012578	TAAGT	2	10	1696758	1696767	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_012578	GCA	2	6	1696805	1696810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_012578	TACC	2	8	1696846	1696853	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_012578	GTG	2	6	1696858	1696863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_012578	CAC	2	6	1696884	1696889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_012578	AAAG	2	8	1696939	1696946	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_012578	TAA	2	6	1696964	1696969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_012578	A	6	6	1697092	1697097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012578	TGA	2	6	1697134	1697139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_012578	TAA	2	6	1698315	1698320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_012578	T	6	6	1698401	1698406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_012578	A	6	6	1698518	1698523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_012578	ATC	2	6	1698558	1698563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_012578	GTTAAG	2	12	1704335	1704346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_012578	A	6	6	1704361	1704366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_012578	TAT	2	6	1704374	1704379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_012578	CACG	2	8	1704383	1704390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_012578	CAA	2	6	1704399	1704404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_012578	TGA	2	6	1707861	1707866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_012578	GGA	2	6	1707881	1707886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_012578	CGTT	2	8	1707960	1707967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4046	NC_012578	TC	3	6	1707984	1707989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_012578	GCC	2	6	1708011	1708016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_012578	GTT	2	6	1708032	1708037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_012578	TAA	2	6	1708052	1708057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_012578	CGC	2	6	1708059	1708064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_012578	CT	3	6	1710794	1710799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_012578	GCC	2	6	1710801	1710806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_012578	AGT	2	6	1710821	1710826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_012578	AG	3	6	1710854	1710859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_012578	TCA	2	6	1710897	1710902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_012578	GA	3	6	1713463	1713468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_012578	AATG	2	8	1713471	1713478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_012578	CCT	2	6	1713503	1713508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_012578	T	6	6	1713562	1713567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_012578	ATAA	2	8	1713910	1713917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_012578	ATC	2	6	1713919	1713924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_012578	TCA	2	6	1714870	1714875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_012578	TTA	2	6	1715297	1715302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_012578	TC	3	6	1715307	1715312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_012578	TGA	2	6	1715330	1715335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_012578	ATC	2	6	1715436	1715441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_012578	CGAAA	2	10	1717293	1717302	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4068	NC_012578	TCA	2	6	1717316	1717321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_012578	AGA	2	6	1717425	1717430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_012578	TGC	2	6	1717497	1717502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_012578	CTG	2	6	1717552	1717557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_012578	TC	3	6	1717565	1717570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_012578	ACAA	2	8	1718848	1718855	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4074	NC_012578	ATTC	2	8	1719577	1719584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_012578	ATT	2	6	1719619	1719624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_012578	GTA	2	6	1719656	1719661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_012578	AAG	2	6	1719662	1719667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_012578	TGC	2	6	1719717	1719722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_012578	A	6	6	1719955	1719960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_012578	CCCA	2	8	1723638	1723645	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4081	NC_012578	A	6	6	1723676	1723681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_012578	TCTA	2	8	1723712	1723719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_012578	ATT	2	6	1723759	1723764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_012578	AAGA	2	8	1723893	1723900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_012578	AT	3	6	1723921	1723926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_012578	TCA	2	6	1723927	1723932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_012578	GCA	2	6	1733390	1733395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_012578	AAT	2	6	1733402	1733407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_012578	ATAA	2	8	1733484	1733491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_012578	TAA	2	6	1733497	1733502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_012578	TTA	2	6	1733520	1733525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_012578	TAAA	2	8	1733538	1733545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_012578	TCC	2	6	1733546	1733551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_012578	TGT	3	9	1733557	1733565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_012578	GA	3	6	1733575	1733580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_012578	AGA	2	6	1733591	1733596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_012578	ATT	2	6	1733614	1733619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_012578	CAC	2	6	1733691	1733696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_012578	CGC	2	6	1733738	1733743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_012578	TGA	2	6	1733771	1733776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_012578	T	6	6	1733800	1733805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_012578	CTG	2	6	1734038	1734043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_012578	TTTGC	2	10	1735522	1735531	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4104	NC_012578	AAG	2	6	1736419	1736424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_012578	TAA	2	6	1736589	1736594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_012578	ATT	3	9	1736709	1736717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_012578	TGA	2	6	1738047	1738052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_012578	AAT	2	6	1738086	1738091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_012578	CAA	2	6	1738097	1738102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_012578	CAA	2	6	1741282	1741287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_012578	AAT	2	6	1741930	1741935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_012578	GCAA	2	8	1742485	1742492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_012578	T	6	6	1742508	1742513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_012578	GCG	2	6	1747473	1747478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_012578	TA	3	6	1747483	1747488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_012578	CCAAAA	2	12	1747490	1747501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_012578	TGTT	2	8	1748909	1748916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_012578	AAAAT	2	10	1748937	1748946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_012578	ATC	2	6	1748960	1748965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_012578	GTTT	3	12	1749061	1749072	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_012578	TAA	2	6	1749113	1749118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_012578	CAA	2	6	1749119	1749124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_012578	CCTA	2	8	1749128	1749135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_012578	GGC	2	6	1749163	1749168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_012578	AGTG	2	8	1749170	1749177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_012578	AACG	2	8	1749284	1749291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_012578	GAC	2	6	1749336	1749341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_012578	CTTC	2	8	1749394	1749401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_012578	CGGCA	2	10	1750938	1750947	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4130	NC_012578	CAG	2	6	1750986	1750991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4132	NC_012578	AAT	2	6	1758260	1758265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4230	NC_012578	TTCTT	2	10	1805496	1805505	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4231	NC_012578	CA	3	6	1805562	1805567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4232	NC_012578	AGCC	2	8	1806268	1806275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4233	NC_012578	TATC	2	8	1806281	1806288	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4234	NC_012578	AATT	2	8	1806349	1806356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_012578	TGG	2	6	1807988	1807993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_012578	ATC	2	6	1808641	1808646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4254	NC_012578	T	7	7	1808698	1808704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_012578	GAAA	2	8	1808705	1808712	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_012578	CT	3	6	1808743	1808748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4257	NC_012578	CGG	2	6	1808826	1808831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4258	NC_012578	TG	3	6	1808836	1808841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_012578	GAA	2	6	1808878	1808883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_012578	C	6	6	1810877	1810882	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4262	NC_012578	A	6	6	1810911	1810916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_012578	CTG	2	6	1810979	1810984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4394	NC_012578	CTAA	2	8	1885868	1885875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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