MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 6657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012578	CTTAG	2	10	1158452	1158461	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3002	NC_012578	ACAG	2	8	1158484	1158491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_012578	TCA	2	6	1158527	1158532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_012578	CAT	3	9	1158534	1158542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_012578	ATT	2	6	1158680	1158685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_012578	CAA	2	6	1158691	1158696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_012578	CAG	2	6	1161966	1161971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_012578	GCT	2	6	1161984	1161989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_012578	CCAA	2	8	1165874	1165881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_012578	ATT	2	6	1165895	1165900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_012578	GCC	2	6	1166001	1166006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_012578	AGT	2	6	1166021	1166026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_012578	TA	3	6	1166032	1166037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_012578	GGC	2	6	1166947	1166952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_012578	CA	3	6	1167038	1167043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_012578	CAAAA	2	10	1169330	1169339	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3017	NC_012578	CAAT	2	8	1169403	1169410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_012578	GAT	2	6	1169773	1169778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_012578	CA	3	6	1169811	1169816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_012578	TGCAAT	2	12	1169839	1169850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3021	NC_012578	TA	3	6	1169851	1169856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_012578	TGC	2	6	1169978	1169983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_012578	TAAG	2	8	1169993	1170000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_012578	AAG	2	6	1170082	1170087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_012578	GTT	2	6	1170446	1170451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_012578	AGG	2	6	1170457	1170462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_012578	T	6	6	1172774	1172779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_012578	ATA	2	6	1174517	1174522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_012578	ATT	2	6	1174584	1174589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_012578	A	6	6	1174605	1174610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_012578	A	6	6	1174639	1174644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_012578	TTTG	2	8	1174963	1174970	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_012578	T	7	7	1175063	1175069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_012578	CAC	2	6	1175070	1175075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_012578	TCT	2	6	1175076	1175081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_012578	T	6	6	1175153	1175158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_012578	CAAA	2	8	1175188	1175195	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3038	NC_012578	TCC	2	6	1176510	1176515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_012578	CAT	2	6	1176527	1176532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_012578	TG	4	8	1176584	1176591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_012578	AAC	2	6	1177469	1177474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_012578	CCA	2	6	1177534	1177539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_012578	GAAAC	2	10	1177581	1177590	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3044	NC_012578	GGTGT	2	10	1177654	1177663	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_012578	CGT	2	6	1179407	1179412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_012578	TAT	2	6	1179413	1179418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_012578	TGAT	2	8	1179421	1179428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_012578	GT	3	6	1179504	1179509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_012578	CTAAA	2	10	1182099	1182108	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3050	NC_012578	T	6	6	1182147	1182152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_012578	CAA	2	6	1182201	1182206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_012578	A	6	6	1182205	1182210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_012578	CAAG	2	8	1182316	1182323	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_012578	ACGA	2	8	1182329	1182336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_012578	ATT	2	6	1182362	1182367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_012578	TGC	2	6	1182378	1182383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_012578	A	6	6	1183051	1183056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_012578	T	6	6	1183085	1183090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_012578	CGA	2	6	1183100	1183105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_012578	TCT	2	6	1183684	1183689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_012578	CAT	2	6	1183764	1183769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_012578	CTA	2	6	1183789	1183794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_012578	A	6	6	1183797	1183802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_012578	TGA	2	6	1186356	1186361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_012578	TGATT	2	10	1186415	1186424	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_012578	GTT	2	6	1186437	1186442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_012578	ATT	2	6	1186459	1186464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_012578	CG	3	6	1187799	1187804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_012578	TCGT	2	8	1187806	1187813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_012578	TAAA	2	8	1189075	1189082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_012578	TTA	2	6	1192342	1192347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_012578	CT	3	6	1193447	1193452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_012578	AG	3	6	1193482	1193487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_012578	ATC	3	9	1195290	1195298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3076	NC_012578	ATT	2	6	1195387	1195392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_012578	TGA	2	6	1195533	1195538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_012578	T	8	8	1197372	1197379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_012578	TCT	2	6	1197429	1197434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_012578	T	7	7	1198087	1198093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_012578	ATGA	2	8	1198094	1198101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_012578	TTGA	2	8	1199598	1199605	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_012578	GTT	2	6	1199627	1199632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_012578	GCG	2	6	1206629	1206634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_012578	A	6	6	1206666	1206671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_012578	TAC	2	6	1208229	1208234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3093	NC_012578	A	7	7	1209299	1209305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_012578	CTGCG	2	10	1209389	1209398	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3095	NC_012578	AG	3	6	1209418	1209423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_012578	AAT	2	6	1214084	1214089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_012578	ATGG	2	8	1214110	1214117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_012578	ACG	2	6	1214166	1214171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_012578	AGCT	2	8	1214175	1214182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_012578	ATG	2	6	1214223	1214228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_012578	TTGA	2	8	1214383	1214390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_012578	A	6	6	1214394	1214399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_012578	AAT	2	6	1214414	1214419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_012578	TAAA	2	8	1214436	1214443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_012578	TGG	2	6	1214456	1214461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_012578	T	6	6	1216544	1216549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_012578	TC	3	6	1216558	1216563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_012578	AG	4	8	1216585	1216592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_012578	ATG	2	6	1216600	1216605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_012578	TCTA	2	8	1217978	1217985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_012578	GAA	2	6	1218002	1218007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3118	NC_012578	GCA	2	6	1221089	1221094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_012578	TTTG	2	8	1221099	1221106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_012578	CAA	2	6	1221124	1221129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_012578	TA	3	6	1221179	1221184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_012578	CAT	2	6	1221204	1221209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_012578	T	7	7	1221219	1221225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_012578	TA	3	6	1221238	1221243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_012578	AGA	2	6	1221697	1221702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_012578	AGC	2	6	1221841	1221846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_012578	GTT	2	6	1223135	1223140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_012578	TC	3	6	1223553	1223558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_012578	TGTA	2	8	1223568	1223575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_012578	TAT	2	6	1223583	1223588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_012578	A	7	7	1223709	1223715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3133	NC_012578	CG	3	6	1224054	1224059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3402	NC_012578	TCG	2	6	1325999	1326004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3404	NC_012578	AAT	2	6	1328534	1328539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3405	NC_012578	GT	3	6	1328542	1328547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3432	NC_012578	AG	3	6	1334923	1334928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_012578	CGTT	2	8	1336788	1336795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3434	NC_012578	TCTA	2	8	1336812	1336819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3435	NC_012578	ACTC	2	8	1336831	1336838	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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