MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 6657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012578	AGG	2	6	335020	335025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_012578	GTAA	2	8	335028	335035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_012578	TAA	2	6	335151	335156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012578	AAG	2	6	335223	335228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012578	CCAG	2	8	337115	337122	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_012578	A	6	6	339267	339272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012578	A	6	6	339365	339370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012578	TCA	3	9	339391	339399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_012578	TCAAAA	2	12	340956	340967	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1010	NC_012578	TAC	2	6	340996	341001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_012578	TC	3	6	341038	341043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_012578	TGA	2	6	342087	342092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012578	GGA	2	6	342109	342114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_012578	TG	3	6	343646	343651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012578	ACA	2	6	343666	343671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_012578	AGC	2	6	343710	343715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_012578	GTG	2	6	344623	344628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012578	TACT	2	8	345769	345776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_012578	CT	3	6	345775	345780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_012578	A	10	10	346495	346504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012578	T	7	7	346508	346514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012578	ACG	2	6	346567	346572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_012578	GTT	2	6	346579	346584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_012578	GT	3	6	346651	346656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012578	GT	3	6	346761	346766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012578	TGA	2	6	346824	346829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012578	TAAGGT	2	12	346841	346852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012578	AAG	2	6	346870	346875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012578	GT	3	6	346884	346889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012578	CAC	2	6	346892	346897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_012578	GT	3	6	346993	346998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_012578	AC	3	6	347036	347041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_012578	AGC	2	6	347055	347060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_012578	TCG	2	6	347069	347074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_012578	GTC	2	6	347091	347096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_012578	GT	3	6	347219	347224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012578	TGA	2	6	347283	347288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_012578	AAG	2	6	347330	347335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012578	GT	3	6	347344	347349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_012578	CTA	2	6	347366	347371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_012578	GAA	2	6	347381	347386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_012578	TA	3	6	347408	347413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_012578	AGC	2	6	347428	347433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_012578	TCG	2	6	347442	347447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_012578	AGC	2	6	347547	347552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_012578	TCG	2	6	347561	347566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_012578	GTC	2	6	347583	347588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_012578	AGC	2	6	347666	347671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_012578	TCG	2	6	347680	347685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_012578	AG	3	6	347742	347747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_012578	T	6	6	347772	347777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012578	CAT	2	6	347824	347829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_012578	TCAT	2	8	347839	347846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_012578	AAT	2	6	347860	347865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012578	AGC	2	6	347898	347903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_012578	A	8	8	347969	347976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012578	TGCT	2	8	348043	348050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_012578	GGCTT	2	10	348056	348065	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_012578	T	6	6	348074	348079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012578	T	6	6	348092	348097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012578	A	6	6	348125	348130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012578	T	7	7	348196	348202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_012578	TGT	2	6	348232	348237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_012578	CTG	2	6	354821	354826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_012578	GCTA	2	8	354831	354838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_012578	AAT	2	6	354839	354844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_012578	ATT	2	6	355151	355156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_012578	ATG	2	6	356491	356496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_012578	TTA	2	6	358691	358696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_012578	TGT	2	6	360196	360201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012578	TGT	2	6	360246	360251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_012578	GTTG	2	8	360258	360265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_012578	AAT	2	6	361099	361104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012578	AGA	2	6	361137	361142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_012578	TAA	2	6	361183	361188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012578	TTG	2	6	361207	361212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012578	TTG	2	6	361263	361268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_012578	AAC	2	6	363076	363081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_012578	CA	3	6	363085	363090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_012578	A	6	6	363099	363104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_012578	AC	3	6	363122	363127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_012578	CTG	2	6	363134	363139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_012578	CTT	3	9	363611	363619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_012578	GA	3	6	363622	363627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012578	TAAG	2	8	363633	363640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012578	AAATT	2	10	363652	363661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012578	A	6	6	363671	363676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012578	GAA	2	6	363698	363703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_012578	TGC	2	6	364202	364207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_012578	GCA	2	6	364219	364224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1093	NC_012578	TAA	2	6	366377	366382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012578	GC	3	6	366431	366436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_012578	AGGA	2	8	366471	366478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_012578	TGC	2	6	367694	367699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_012578	TCT	2	6	367764	367769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_012578	ATGA	2	8	367952	367959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012578	CTT	2	6	368169	368174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_012578	CTC	2	6	368182	368187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_012578	AGG	2	6	368218	368223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012578	GCT	2	6	368801	368806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_012578	AAT	2	6	368898	368903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012578	AAGA	2	8	369857	369864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012578	T	7	7	370368	370374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012578	GGC	2	6	371233	371238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_012578	TGT	2	6	373836	373841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012578	ACC	2	6	373851	373856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_012578	CATG	2	8	373872	373879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_012578	CT	3	6	373883	373888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_012578	CGGT	2	8	374412	374419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_012578	ATG	2	6	374466	374471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012578	ATTA	2	8	374480	374487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_012578	GCA	2	6	376417	376422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_012578	AAAAC	2	10	377678	377687	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_012578	CTT	2	6	378228	378233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_012578	TAA	2	6	378715	378720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012578	AAAAT	2	10	378754	378763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_012578	TTA	2	6	378849	378854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_012578	CTG	2	6	378914	378919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_012578	T	6	6	379003	379008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012578	GGT	2	6	379020	379025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012578	T	6	6	380072	380077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012578	T	7	7	380111	380117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_012578	CTT	2	6	380139	380144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_012578	AATG	2	8	380176	380183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_012578	CAT	2	6	380453	380458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_012578	ATTGA	2	10	380471	380480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_012578	TTCT	2	8	381559	381566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_012578	TTA	2	6	381569	381574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012578	ATA	2	6	385958	385963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_012578	AG	3	6	385965	385970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012578	TCA	2	6	386035	386040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_012578	ATAA	2	8	386059	386066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_012578	GCA	2	6	386168	386173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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