MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 6657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012578	TCC	2	6	2617004	2617009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_012578	CTT	2	6	2617028	2617033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_012578	GT	3	6	2617064	2617069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_012578	ACG	2	6	2617165	2617170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_012578	GT	3	6	2617233	2617238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_012578	ATG	2	6	2617258	2617263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_012578	CGT	2	6	2617270	2617275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_012578	TCC	2	6	2617284	2617289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_012578	CCA	2	6	2617320	2617325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_012578	GAC	2	6	2617398	2617403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_012578	GCA	2	6	2617410	2617415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_012578	TTC	2	6	2617486	2617491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_012578	GCC	2	6	2617729	2617734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_012578	C	6	6	2617793	2617798	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6015	NC_012578	ACC	2	6	2617875	2617880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_012578	GCT	2	6	2617939	2617944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_012578	CTT	2	6	2617964	2617969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_012578	ACC	2	6	2618006	2618011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_012578	TCC	2	6	2618013	2618018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_012578	CTT	2	6	2618048	2618053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_012578	CTG	2	6	2618107	2618112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_012578	ATC	2	6	2618157	2618162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_012578	TCG	2	6	2618182	2618187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_012578	CCG	2	6	2618356	2618361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_012578	TGC	2	6	2618390	2618395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_012578	GCC	2	6	2618421	2618426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_012578	T	6	6	2618580	2618585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_012578	ATC	2	6	2618590	2618595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_012578	CA	3	6	2618606	2618611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_012578	GATT	2	8	2618612	2618619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_012578	GCT	2	6	2618801	2618806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_012578	T	7	7	2618806	2618812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_012578	TTTA	2	8	2618878	2618885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_012578	TC	3	6	2618894	2618899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_012578	AGA	2	6	2620250	2620255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_012578	TAA	3	9	2620259	2620267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_012578	GTT	2	6	2620293	2620298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_012578	AATATG	2	12	2620319	2620330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_012578	CTT	2	6	2620363	2620368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_012578	GGAC	2	8	2620386	2620393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_012578	CGT	2	6	2620431	2620436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_012578	CAC	2	6	2620449	2620454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_012578	AAG	2	6	2620499	2620504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_012578	AAAAT	2	10	2620531	2620540	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_012578	ATT	2	6	2620550	2620555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_012578	CAC	2	6	2620557	2620562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_012578	CT	3	6	2620585	2620590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_012578	TTTTGA	2	12	2621172	2621183	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_012578	T	6	6	2621209	2621214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_012578	T	7	7	2623430	2623436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_012578	T	6	6	2623472	2623477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_012578	AAT	2	6	2623479	2623484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_012578	GTG	2	6	2625167	2625172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_012578	CT	3	6	2625664	2625669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_012578	A	6	6	2628625	2628630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_012578	GCA	2	6	2628632	2628637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_012578	GAT	2	6	2628662	2628667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_012578	A	6	6	2630449	2630454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_012578	TA	3	6	2630463	2630468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_012578	TCA	2	6	2633448	2633453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_012578	ACTTC	2	10	2633478	2633487	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6062	NC_012578	TAT	2	6	2633499	2633504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_012578	CCG	2	6	2633580	2633585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_012578	T	8	8	2633594	2633601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_012578	GAT	2	6	2633656	2633661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_012578	A	7	7	2633697	2633703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_012578	AG	3	6	2633732	2633737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_012578	GCA	2	6	2633753	2633758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_012578	TCC	2	6	2635279	2635284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_012578	TTTA	2	8	2635296	2635303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_012578	TACC	2	8	2638087	2638094	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_012578	CTTT	2	8	2638587	2638594	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_012578	ATGA	2	8	2639408	2639415	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_012578	AAC	2	6	2644404	2644409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_012578	GGC	2	6	2644425	2644430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_012578	AGTG	2	8	2644432	2644439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_012578	ATAG	2	8	2644453	2644460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_012578	GAAC	2	8	2644477	2644484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6079	NC_012578	AGAGT	2	10	2648900	2648909	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_012578	TAACAA	2	12	2648921	2648932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6081	NC_012578	CTC	2	6	2652335	2652340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_012578	AGA	2	6	2652388	2652393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_012578	TTA	2	6	2652424	2652429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_012578	ATT	2	6	2652463	2652468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_012578	TTCA	2	8	2653906	2653913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6086	NC_012578	TTCA	2	8	2655272	2655279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6087	NC_012578	TTA	2	6	2655297	2655302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_012578	A	6	6	2655991	2655996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_012578	CAA	2	6	2661894	2661899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_012578	CGC	2	6	2662959	2662964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_012578	GCG	2	6	2662970	2662975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_012578	AAT	3	9	2663066	2663074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_012578	A	6	6	2663667	2663672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_012578	CAGCT	2	10	2663675	2663684	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6095	NC_012578	T	6	6	2663688	2663693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_012578	TC	4	8	2664058	2664065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6097	NC_012578	CAT	2	6	2669591	2669596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_012578	TGC	2	6	2669669	2669674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_012578	CCA	2	6	2669698	2669703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_012578	TG	3	6	2670399	2670404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_012578	TTTG	2	8	2670412	2670419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_012578	CATC	2	8	2671059	2671066	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_012578	GA	3	6	2671111	2671116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_012578	TCA	2	6	2671132	2671137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_012578	ATC	2	6	2671140	2671145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_012578	TTATA	2	10	2671167	2671176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_012578	T	7	7	2671539	2671545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_012578	TTA	2	6	2671549	2671554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_012578	CA	3	6	2672357	2672362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_012578	GAG	2	6	2672364	2672369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_012578	TGAC	2	8	2674360	2674367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6112	NC_012578	AG	3	6	2674926	2674931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_012578	CCCT	2	8	2674943	2674950	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6114	NC_012578	GATA	2	8	2674984	2674991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_012578	ATAA	2	8	2675014	2675021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_012578	AAC	2	6	2675094	2675099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_012578	TAT	2	6	2675110	2675115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_012578	AG	3	6	2675149	2675154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_012578	GCT	2	6	2675163	2675168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_012578	GCG	2	6	2675171	2675176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_012578	CAG	2	6	2675193	2675198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_012578	GCA	2	6	2675208	2675213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_012578	A	6	6	2676156	2676161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_012578	CGG	2	6	2679247	2679252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_012578	AGC	2	6	2679266	2679271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_012578	AGT	2	6	2679291	2679296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_012578	AAG	2	6	2679301	2679306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_012578	TGC	2	6	2679312	2679317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_012578	TTA	2	6	2680236	2680241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_012578	T	6	6	2680262	2680267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_012578	CAG	2	6	2680318	2680323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_012578	ACA	2	6	2680343	2680348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_012578	GCA	2	6	2680349	2680354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6135	NC_012578	TTTTC	2	10	2682564	2682573	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6146	NC_012578	CT	3	6	2689647	2689652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6154	NC_012578	TCGGG	2	10	2696837	2696846	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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6398	NC_012578	ACC	2	6	2805525	2805530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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