MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 6657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012578	AAG	2	6	2141579	2141584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_012578	T	6	6	2141629	2141634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_012578	GAT	2	6	2143244	2143249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_012578	TAT	2	6	2143269	2143274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_012578	ATT	2	6	2148948	2148953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012578	GTT	2	6	2148967	2148972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_012578	CTA	2	6	2150311	2150316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_012578	TAAG	2	8	2150391	2150398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_012578	ATCC	2	8	2150457	2150464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_012578	GAA	2	6	2150543	2150548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_012578	A	7	7	2150550	2150556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_012578	CTTC	2	8	2150568	2150575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_012578	GCA	2	6	2157775	2157780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_012578	A	6	6	2161334	2161339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_012578	GCC	2	6	2163534	2163539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_012578	ACTC	2	8	2163564	2163571	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_012578	A	6	6	2163702	2163707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_012578	AAC	2	6	2163720	2163725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_012578	GCT	2	6	2163730	2163735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_012578	ATG	2	6	2163760	2163765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_012578	CAA	2	6	2163926	2163931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_012578	TCAA	2	8	2163951	2163958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5023	NC_012578	GTAA	2	8	2164075	2164082	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_012578	TTGA	2	8	2164122	2164129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_012578	GC	4	8	2164135	2164142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_012578	TCGG	2	8	2164167	2164174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_012578	CTG	2	6	2164206	2164211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_012578	ATA	2	6	2164228	2164233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_012578	AAT	3	9	2164369	2164377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_012578	TAC	2	6	2167839	2167844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_012578	GGT	2	6	2167889	2167894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_012578	ATT	2	6	2167934	2167939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_012578	TCA	2	6	2170282	2170287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_012578	GCT	2	6	2170324	2170329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_012578	A	7	7	2170358	2170364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_012578	T	6	6	2170379	2170384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5039	NC_012578	TAA	2	6	2173291	2173296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_012578	TATTAA	2	12	2173307	2173318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_012578	A	6	6	2173467	2173472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_012578	TTACAT	2	12	2173480	2173491	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5043	NC_012578	GCT	2	6	2173524	2173529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5045	NC_012578	GGT	2	6	2173637	2173642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5048	NC_012578	T	7	7	2173724	2173730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_012578	TCAC	2	8	2173755	2173762	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_012578	TCA	2	6	2173832	2173837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_012578	AAC	2	6	2174007	2174012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_012578	T	6	6	2177512	2177517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_012578	A	7	7	2177531	2177537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_012578	TTA	2	6	2180193	2180198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5059	NC_012578	TGC	2	6	2186512	2186517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_012578	AGGC	2	8	2186540	2186547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_012578	TTTC	2	8	2189938	2189945	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_012578	TC	3	6	2189965	2189970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_012578	ACAGA	2	10	2190039	2190048	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5064	NC_012578	A	6	6	2190068	2190073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_012578	AGTG	2	8	2190078	2190085	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_012578	CA	3	6	2190086	2190091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_012578	AAT	2	6	2190101	2190106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_012578	CA	4	8	2190138	2190145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_012578	ATA	2	6	2190166	2190171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_012578	CAAAAG	2	12	2191487	2191498	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5072	NC_012578	A	6	6	2193133	2193138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_012578	TTCAT	2	10	2193161	2193170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5074	NC_012578	CTTT	2	8	2194831	2194838	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5075	NC_012578	ATAAA	2	10	2194848	2194857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_012578	ATA	2	6	2194863	2194868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_012578	TAA	2	6	2195544	2195549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_012578	A	6	6	2197239	2197244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_012578	CAG	2	6	2197254	2197259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_012578	T	6	6	2197264	2197269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_012578	GCA	2	6	2199958	2199963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_012578	CAT	2	6	2199974	2199979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5085	NC_012578	TAA	2	6	2199990	2199995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_012578	GTT	2	6	2200006	2200011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_012578	AGTG	2	8	2200182	2200189	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_012578	TGG	2	6	2200799	2200804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_012578	TGA	2	6	2200818	2200823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_012578	TAT	2	6	2204397	2204402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_012578	A	6	6	2206550	2206555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_012578	T	6	6	2206600	2206605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_012578	CAA	2	6	2207187	2207192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_012578	T	7	7	2207199	2207205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_012578	GTT	2	6	2207211	2207216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_012578	AAC	2	6	2207228	2207233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_012578	T	6	6	2208215	2208220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5106	NC_012578	TA	3	6	2208506	2208511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5120	NC_012578	ATTCC	2	10	2225688	2225697	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5121	NC_012578	ATGCC	2	10	2225719	2225728	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5122	NC_012578	CT	3	6	2228225	2228230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_012578	CAA	2	6	2228242	2228247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_012578	TTAA	2	8	2228300	2228307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_012578	AT	3	6	2228313	2228318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_012578	ATT	2	6	2229798	2229803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_012578	TAT	2	6	2229810	2229815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_012578	AAG	2	6	2229816	2229821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_012578	CAT	2	6	2229842	2229847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_012578	CAA	2	6	2229909	2229914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5132	NC_012578	TAGT	2	8	2229930	2229937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_012578	TTAC	2	8	2233277	2233284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5142	NC_012578	T	7	7	2234653	2234659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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