MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 6657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012578	CTAC	2	8	1927812	1927819	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_012578	ACA	3	9	1929033	1929041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_012578	A	6	6	1929069	1929074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_012578	GCA	2	6	1929080	1929085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_012578	TTTG	2	8	1930228	1930235	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_012578	CAC	2	6	1930238	1930243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_012578	A	10	10	1930300	1930309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_012578	A	7	7	1930315	1930321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_012578	ATTT	2	8	1930350	1930357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_012578	T	7	7	1930363	1930369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_012578	TAA	2	6	1930475	1930480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_012578	TA	3	6	1930504	1930509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_012578	T	6	6	1930510	1930515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_012578	AAAT	2	8	1930524	1930531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_012578	CAC	2	6	1932754	1932759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_012578	ACA	2	6	1936461	1936466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_012578	ACA	2	6	1936537	1936542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_012578	TTG	2	6	1936565	1936570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_012578	AAT	2	6	1936586	1936591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_012578	CTTA	2	8	1937481	1937488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_012578	T	6	6	1937515	1937520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_012578	CAA	2	6	1938999	1939004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_012578	AAG	2	6	1939080	1939085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_012578	TTGT	2	8	1939884	1939891	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_012578	TGT	2	6	1939897	1939902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_012578	T	7	7	1939911	1939917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_012578	ACC	2	6	1939987	1939992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_012578	CGA	2	6	1940007	1940012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_012578	CAA	2	6	1940901	1940906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_012578	ATT	2	6	1940907	1940912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_012578	CA	3	6	1940949	1940954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_012578	TAA	2	6	1941115	1941120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_012578	AAT	2	6	1941137	1941142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_012578	TAA	2	6	1941148	1941153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_012578	TAA	2	6	1941245	1941250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_012578	A	6	6	1941264	1941269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_012578	TTTC	2	8	1941322	1941329	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4538	NC_012578	GATCAA	2	12	1941347	1941358	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4539	NC_012578	TCA	2	6	1941403	1941408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_012578	CTTT	2	8	1941469	1941476	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_012578	CAC	2	6	1941499	1941504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_012578	TTAC	2	8	1941509	1941516	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_012578	T	6	6	1943137	1943142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_012578	ATTT	2	8	1945688	1945695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_012578	TTC	2	6	1945719	1945724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_012578	CTA	2	6	1945726	1945731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_012578	CACTG	2	10	1948716	1948725	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4548	NC_012578	ACA	2	6	1948750	1948755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_012578	ATTG	2	8	1948823	1948830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_012578	AG	3	6	1948841	1948846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_012578	GAA	2	6	1948880	1948885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_012578	CCA	2	6	1948907	1948912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_012578	TAA	2	6	1948980	1948985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_012578	A	6	6	1949783	1949788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_012578	T	7	7	1949808	1949814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_012578	T	7	7	1950497	1950503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_012578	ATA	2	6	1950578	1950583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_012578	CGC	2	6	1951195	1951200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_012578	GTC	2	6	1951318	1951323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_012578	AAC	2	6	1951343	1951348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_012578	CGG	2	6	1953305	1953310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_012578	TACC	2	8	1953338	1953345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_012578	CAA	2	6	1953381	1953386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_012578	ACA	2	6	1956280	1956285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_012578	TAA	2	6	1956297	1956302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_012578	CTT	2	6	1956311	1956316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_012578	CTTA	2	8	1956816	1956823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4568	NC_012578	TCT	2	6	1956841	1956846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_012578	CAC	2	6	1956887	1956892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4570	NC_012578	GGT	2	6	1956903	1956908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_012578	A	6	6	1956923	1956928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_012578	T	6	6	1956945	1956950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_012578	AAG	2	6	1960648	1960653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_012578	ATTC	2	8	1971031	1971038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4575	NC_012578	A	6	6	1971052	1971057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_012578	AG	3	6	1971924	1971929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_012578	GTT	2	6	1971934	1971939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_012578	CT	3	6	1971974	1971979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_012578	CCA	2	6	1972102	1972107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_012578	GA	3	6	1972139	1972144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_012578	AG	3	6	1972182	1972187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_012578	T	6	6	1974312	1974317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_012578	TCT	2	6	1974333	1974338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_012578	GAT	2	6	1974416	1974421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_012578	CCT	2	6	1974510	1974515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4586	NC_012578	ACTG	2	8	1975122	1975129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4587	NC_012578	C	6	6	1975142	1975147	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4588	NC_012578	TCTA	2	8	1975197	1975204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4589	NC_012578	AAT	2	6	1976525	1976530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_012578	TAT	2	6	1976531	1976536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_012578	ATG	2	6	1976576	1976581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_012578	CAG	2	6	1976593	1976598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_012578	TCA	2	6	1976750	1976755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_012578	T	6	6	1976787	1976792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_012578	ATCGC	2	10	1976839	1976848	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4596	NC_012578	TAG	2	6	1977458	1977463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_012578	GCA	2	6	1977536	1977541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_012578	TCA	2	6	1977547	1977552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_012578	ATCG	2	8	1979083	1979090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_012578	A	6	6	1981354	1981359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_012578	T	8	8	1981404	1981411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_012578	CAATA	2	10	1981445	1981454	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4603	NC_012578	T	6	6	1981471	1981476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_012578	TGA	2	6	1981493	1981498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_012578	TAA	2	6	1981503	1981508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_012578	TCA	2	6	1983596	1983601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_012578	T	6	6	1983614	1983619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_012578	GCAA	2	8	1983675	1983682	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4609	NC_012578	AAC	2	6	1984868	1984873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_012578	GGC	2	6	1984889	1984894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_012578	AG	3	6	1984919	1984924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_012578	GAAC	2	8	1984941	1984948	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4613	NC_012578	CAT	2	6	1984990	1984995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_012578	GGGATT	2	12	1985008	1985019	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_012578	CTT	2	6	1985056	1985061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_012578	AACGAA	2	12	1985063	1985074	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4617	NC_012578	TCA	2	6	1985968	1985973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_012578	CTTTT	2	10	1986104	1986113	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4619	NC_012578	T	6	6	1986307	1986312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_012578	ATC	2	6	1986335	1986340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_012578	TGT	2	6	1986349	1986354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_012578	AAC	2	6	1986445	1986450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_012578	AC	3	6	1986491	1986496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_012578	TCTA	2	8	1986536	1986543	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_012578	AAC	2	6	1986545	1986550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_012578	ATC	2	6	1986563	1986568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_012578	TGAAAC	2	12	1988170	1988181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4628	NC_012578	CTTTT	2	10	1988215	1988224	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4629	NC_012578	ATCT	2	8	1988233	1988240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4630	NC_012578	ATCGC	2	10	1988767	1988776	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4631	NC_012578	A	6	6	1988791	1988796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4633	NC_012578	TGT	2	6	1988823	1988828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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