MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome II

Total Repeats: 4206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011186	ATT	2	6	1334049	1334054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_011186	T	6	6	1339559	1339564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011186	TTTA	2	8	1339581	1339588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_011186	TTAG	2	8	1339593	1339600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011186	TAAA	2	8	1339602	1339609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011186	ATG	2	6	1339650	1339655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011186	GA	3	6	1339684	1339689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011186	ACC	2	6	1339799	1339804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_011186	CTT	2	6	1340042	1340047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_011186	GCTTGA	2	12	1340081	1340092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4011	NC_011186	ATT	2	6	1340093	1340098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011186	AAC	2	6	1340135	1340140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_011186	GAA	2	6	1340147	1340152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011186	TTACTT	2	12	1340164	1340175	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4015	NC_011186	AAC	2	6	1340186	1340191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_011186	T	6	6	1340255	1340260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011186	A	6	6	1340261	1340266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011186	AGT	2	6	1340281	1340286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_011186	TCA	2	6	1340302	1340307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_011186	TAAA	2	8	1340318	1340325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011186	A	7	7	1340327	1340333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_011186	GCC	2	6	1340334	1340339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_011186	CAAT	2	8	1340365	1340372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_011186	AT	3	6	1341304	1341309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_011186	TTA	2	6	1343525	1343530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_011186	ATATTT	2	12	1345364	1345375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_011186	TATT	2	8	1345381	1345388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_011186	TAA	2	6	1345408	1345413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_011186	TAT	3	9	1345423	1345431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011186	TAT	2	6	1346675	1346680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_011186	AAT	2	6	1346733	1346738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011186	TA	3	6	1346752	1346757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_011186	TTTTAT	2	12	1349653	1349664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011186	ACTTT	2	10	1349699	1349708	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4035	NC_011186	TAATAT	2	12	1350084	1350095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011186	T	6	6	1350095	1350100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_011186	AT	3	6	1350101	1350106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_011186	TTTA	2	8	1350120	1350127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_011186	A	7	7	1350146	1350152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011186	TCT	2	6	1350172	1350177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_011186	GTAG	2	8	1350211	1350218	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_011186	ATA	2	6	1350231	1350236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011186	TGT	2	6	1350295	1350300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011186	AAGT	2	8	1350340	1350347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011186	CTC	2	6	1351307	1351312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_011186	TAT	2	6	1351313	1351318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011186	TAA	2	6	1351375	1351380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_011186	AAT	2	6	1351382	1351387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011186	TAAA	2	8	1351475	1351482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_011186	GTA	2	6	1351525	1351530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011186	A	7	7	1351567	1351573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_011186	T	6	6	1351603	1351608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_011186	TAA	2	6	1351656	1351661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011186	GGCTT	2	10	1354041	1354050	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4055	NC_011186	TAA	3	9	1354055	1354063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_011186	AATC	2	8	1354069	1354076	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_011186	A	6	6	1354089	1354094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_011186	AAT	2	6	1354123	1354128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_011186	GTT	2	6	1354135	1354140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_011186	TCT	2	6	1354145	1354150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_011186	ATT	2	6	1355095	1355100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011186	ACG	2	6	1355112	1355117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_011186	TGTTT	2	10	1355181	1355190	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_011186	ATG	2	6	1355196	1355201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_011186	A	7	7	1355466	1355472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011186	T	7	7	1355493	1355499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_011186	A	6	6	1357116	1357121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011186	TA	3	6	1357127	1357132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_011186	ATA	2	6	1357145	1357150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_011186	AGT	2	6	1357907	1357912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_011186	TGCTC	2	10	1357916	1357925	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4072	NC_011186	ATTC	2	8	1357967	1357974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_011186	ATT	2	6	1358008	1358013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_011186	TAA	2	6	1358027	1358032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_011186	GCA	2	6	1359859	1359864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_011186	AAATT	2	10	1360491	1360500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_011186	AAT	2	6	1360560	1360565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_011186	TCC	2	6	1361712	1361717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_011186	T	6	6	1361736	1361741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_011186	ATC	2	6	1361752	1361757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_011186	TCAG	2	8	1361785	1361792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4082	NC_011186	TCG	2	6	1361804	1361809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_011186	TTTC	2	8	1362736	1362743	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_011186	GCA	2	6	1362817	1362822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_011186	A	6	6	1363472	1363477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_011186	G	6	6	1363478	1363483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_011186	T	6	6	1363505	1363510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_011186	ACT	2	6	1363523	1363528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_011186	TTC	2	6	1363533	1363538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_011186	AGG	2	6	1365261	1365266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_011186	CAATCT	2	12	1365297	1365308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_011186	CGTT	2	8	1365351	1365358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_011186	TCA	2	6	1365392	1365397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_011186	TTA	2	6	1365483	1365488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_011186	TA	3	6	1365498	1365503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_011186	GTAAT	2	10	1365577	1365586	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011186	TC	3	6	1366036	1366041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_011186	TGTC	2	8	1366050	1366057	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_011186	TTACA	2	10	1366079	1366088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4100	NC_011186	TGT	2	6	1366106	1366111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_011186	ATT	2	6	1366119	1366124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_011186	ATTA	2	8	1366146	1366153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_011186	TAA	2	6	1367252	1367257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_011186	ATC	2	6	1367267	1367272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_011186	ACC	2	6	1367294	1367299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_011186	TATT	2	8	1367355	1367362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_011186	T	6	6	1367420	1367425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_011186	ATA	2	6	1367463	1367468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_011186	AAT	2	6	1369785	1369790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_011186	A	6	6	1369817	1369822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_011186	TA	3	6	1371270	1371275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_011186	AAGT	2	8	1372212	1372219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_011186	ACTC	2	8	1372274	1372281	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_011186	CTT	2	6	1372294	1372299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_011186	T	6	6	1372318	1372323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_011186	GATAT	2	10	1372787	1372796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_011186	GAAG	2	8	1372829	1372836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_011186	ATA	2	6	1372837	1372842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_011186	TCG	2	6	1375038	1375043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_011186	AAT	2	6	1375065	1375070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_011186	TTA	2	6	1375083	1375088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011186	TCA	2	6	1375099	1375104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_011186	ACA	2	6	1375205	1375210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_011186	AAC	2	6	1375232	1375237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_011186	GTT	2	6	1375252	1375257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_011186	T	6	6	1375260	1375265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_011186	TTC	2	6	1375577	1375582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_011186	CCAG	2	8	1375597	1375604	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_011186	ATG	2	6	1375619	1375624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_011186	ATT	2	6	1375670	1375675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_011186	GA	3	6	1375678	1375683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_011186	GTA	2	6	1375686	1375691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_011186	TTAA	2	8	1375697	1375704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4136	NC_011186	ACA	2	6	1376444	1376449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4141	NC_011186	TAAG	2	8	1376650	1376657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4143	NC_011186	AAG	2	6	1377813	1377818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4164	NC_011186	TTC	2	6	1391192	1391197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.