MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 7045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009457	CAC	2	6	56	61	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009457	TGA	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009457	AGATC	2	10	136	145	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009457	GA	3	6	164	169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009457	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009457	GC	3	6	315	320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009457	CTG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009457	GAG	2	6	402	407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009457	ATC	2	6	428	433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009457	TGA	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009457	CTA	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009457	T	6	6	576	581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009457	GCG	2	6	657	662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009457	AAT	2	6	774	779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009457	CCT	2	6	815	820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009457	CAT	2	6	856	861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009457	ATG	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009457	T	6	6	882	887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009457	ATT	3	9	2270	2278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009457	TTCA	2	8	3261	3268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009457	GTCT	2	8	3282	3289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009457	GCC	2	6	3314	3319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009457	AGT	2	6	3334	3339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009457	T	6	6	3383	3388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009457	GCA	2	6	4413	4418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009457	GCC	2	6	4527	4532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_009457	CTGCAA	2	12	4536	4547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009457	CGT	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009457	A	6	6	6887	6892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009457	TTA	2	6	9407	9412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009457	GCTTT	2	10	11599	11608	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009457	TC	3	6	12501	12506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009457	TCA	2	6	12516	12521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009457	TAA	2	6	14359	14364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009457	A	6	6	14363	14368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009457	A	6	6	14377	14382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009457	T	6	6	17581	17586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009457	T	7	7	17635	17641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009457	A	7	7	18209	18215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009457	AAT	2	6	18281	18286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009457	ATTT	2	8	21818	21825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009457	GAT	2	6	21848	21853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009457	A	6	6	21854	21859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009457	GCG	2	6	21867	21872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009457	AAT	2	6	22796	22801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009457	ATCT	2	8	22846	22853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009457	AT	3	6	22864	22869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009457	AAT	2	6	22871	22876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009457	AAT	2	6	22894	22899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009457	GGC	2	6	24901	24906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009457	TGTT	2	8	24920	24927	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009457	CGG	2	6	24935	24940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009457	CCAA	2	8	24999	25006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009457	G	6	6	27384	27389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009457	TGC	2	6	27410	27415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009457	TTTG	2	8	27426	27433	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009457	T	6	6	27491	27496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009457	TGAA	2	8	28620	28627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009457	T	6	6	28651	28656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009457	AG	3	6	28682	28687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009457	ATT	2	6	28724	28729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009457	ATT	2	6	28750	28755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009457	ACTTTG	2	12	28762	28773	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009457	TGG	2	6	28816	28821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009457	ATT	2	6	28852	28857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009457	T	6	6	28866	28871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009457	TA	3	6	29769	29774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009457	T	6	6	29805	29810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009457	ATA	2	6	30544	30549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009457	TAAT	2	8	30568	30575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009457	ATG	2	6	31583	31588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009457	ATG	2	6	32335	32340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009457	CGA	2	6	32352	32357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009457	TATT	2	8	32441	32448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009457	T	6	6	32469	32474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009457	TAA	2	6	32527	32532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009457	ACT	2	6	32537	32542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009457	TCA	2	6	32550	32555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009457	ATTG	2	8	32565	32572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009457	AAAG	2	8	32573	32580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009457	AC	3	6	32621	32626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009457	A	6	6	32781	32786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009457	TGG	3	9	34301	34309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009457	CGG	2	6	34324	34329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009457	TGAC	2	8	34420	34427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009457	T	8	8	34512	34519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009457	T	6	6	34608	34613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009457	AAAT	2	8	34620	34627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009457	TTA	2	6	35479	35484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009457	A	6	6	35504	35509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009457	A	6	6	38545	38550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009457	ATC	2	6	38557	38562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009457	GAG	2	6	38579	38584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009457	TGA	2	6	40579	40584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009457	TTG	2	6	40590	40595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009457	GTTT	2	8	40740	40747	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009457	ACA	2	6	40774	40779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009457	TGG	2	6	40851	40856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009457	A	6	6	40939	40944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009457	CTA	2	6	40963	40968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009457	TGG	2	6	40982	40987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009457	A	6	6	41149	41154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009457	AGCTC	2	10	41164	41173	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_009457	TTGGG	2	10	45008	45017	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009457	ACG	2	6	46970	46975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009457	T	6	6	47008	47013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009457	GAAT	2	8	47024	47031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009457	ATAA	2	8	47108	47115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009457	TGA	2	6	47946	47951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009457	A	6	6	48676	48681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009457	T	6	6	48748	48753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009457	GCA	2	6	50499	50504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009457	GAAA	2	8	50548	50555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009457	A	6	6	52031	52036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009457	TTG	2	6	56568	56573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009457	GCT	2	6	59217	59222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009457	ATC	3	9	59224	59232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009457	TCA	2	6	59253	59258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009457	TGA	2	6	59345	59350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009457	TCA	2	6	59360	59365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009457	CGC	2	6	59372	59377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009457	TTCTA	2	10	60371	60380	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009457	TCTA	2	8	60457	60464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009457	ACTC	2	8	60476	60483	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009457	GCC	2	6	60488	60493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009457	GTT	2	6	60509	60514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009457	TTGA	2	8	60532	60539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009457	GAC	2	6	60554	60559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009457	GCG	2	6	60569	60574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009457	CAG	2	6	60587	60592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009457	ATT	2	6	60636	60641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009457	T	6	6	60664	60669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009457	AGC	2	6	60693	60698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009457	AAC	2	6	60738	60743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009457	ATGG	2	8	61775	61782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009457	T	6	6	65356	65361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009457	GA	3	6	65473	65478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009457	TGAA	2	8	66591	66598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009457	CTT	2	6	66615	66620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009457	GCT	2	6	66625	66630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009457	TGAG	2	8	66634	66641	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009457	TTA	2	6	67162	67167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009457	GCT	3	9	67200	67208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009457	AC	3	6	67211	67216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009457	GAAGA	2	10	67229	67238	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009457	TCAA	2	8	69913	69920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009457	ATA	2	6	71326	71331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009457	GAA	2	6	71578	71583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_009457	GGT	2	6	148989	148994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_009457	TTC	2	6	207717	207722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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425	NC_009457	A	7	7	213236	213242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_009457	T	7	7	213262	213268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_009457	A	6	6	214572	214577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_009457	TGG	2	6	214637	214642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_009457	A	6	6	215965	215970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_009457	TCA	2	6	226274	226279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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