MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 7045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009457	AATT	2	8	2101024	2101031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_009457	AGC	2	6	2101078	2101083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_009457	GCT	2	6	2101103	2101108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_009457	GCAA	2	8	2101171	2101178	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_009457	CAC	2	6	2101196	2101201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_009457	CA	3	6	2101206	2101211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_009457	TGA	2	6	2101310	2101315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_009457	GCAC	2	8	2101346	2101353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_009457	TGC	2	6	2101414	2101419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_009457	ACAA	2	8	2101420	2101427	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_009457	GATGGA	2	12	2101442	2101453	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_009457	CGG	2	6	2101465	2101470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_009457	CGG	2	6	2101484	2101489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_009457	GAC	2	6	2102484	2102489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_009457	ACC	2	6	2102538	2102543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_009457	GGC	2	6	2102552	2102557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_009457	TTG	2	6	2102668	2102673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_009457	TAGTC	2	10	2102702	2102711	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4519	NC_009457	TC	3	6	2102771	2102776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_009457	GAGAG	2	10	2102799	2102808	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_009457	CAA	2	6	2102846	2102851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_009457	AGG	2	6	2104647	2104652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_009457	TAT	2	6	2104665	2104670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_009457	A	8	8	2104724	2104731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_009457	ACA	2	6	2104737	2104742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_009457	ACA	2	6	2104771	2104776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_009457	CA	3	6	2105493	2105498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4528	NC_009457	ATA	2	6	2105499	2105504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_009457	AC	3	6	2105614	2105619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_009457	A	8	8	2105649	2105656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_009457	TGA	2	6	2105665	2105670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_009457	GAA	2	6	2105703	2105708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_009457	A	7	7	2105793	2105799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_009457	TATT	2	8	2105814	2105821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_009457	CAT	2	6	2105835	2105840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_009457	AGAAA	2	10	2105900	2105909	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_009457	TAAA	2	8	2105946	2105953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_009457	AGAA	2	8	2105968	2105975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_009457	A	7	7	2105974	2105980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_009457	CAA	2	6	2106012	2106017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_009457	AT	3	6	2106070	2106075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_009457	TAG	2	6	2106125	2106130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_009457	AT	3	6	2106168	2106173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_009457	AGC	2	6	2106180	2106185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_009457	TAGTG	2	10	2106367	2106376	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_009457	GCA	2	6	2106430	2106435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_009457	AGCA	2	8	2106470	2106477	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4548	NC_009457	C	11	11	2106575	2106585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4549	NC_009457	TTC	2	6	2106590	2106595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_009457	GAA	2	6	2106598	2106603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_009457	CCAA	2	8	2106645	2106652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_009457	ATG	2	6	2106665	2106670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_009457	CAC	2	6	2106683	2106688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_009457	A	6	6	2107210	2107215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_009457	AG	3	6	2107246	2107251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_009457	CT	3	6	2107261	2107266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_009457	TGT	2	6	2107267	2107272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_009457	CTA	2	6	2110515	2110520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_009457	ATT	2	6	2111702	2111707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_009457	CTA	2	6	2111724	2111729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_009457	ATTTA	2	10	2111815	2111824	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_009457	TGA	2	6	2111839	2111844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_009457	TCA	2	6	2111851	2111856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_009457	A	7	7	2111865	2111871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_009457	A	8	8	2112110	2112117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_009457	CAG	2	6	2112121	2112126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_009457	A	6	6	2113064	2113069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_009457	GTT	2	6	2113561	2113566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_009457	TAA	2	6	2113604	2113609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_009457	TGT	2	6	2116335	2116340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_009457	TC	3	6	2116344	2116349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_009457	TG	3	6	2116431	2116436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_009457	TGA	2	6	2116445	2116450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_009457	TTAA	2	8	2116476	2116483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_009457	TGC	2	6	2116485	2116490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_009457	CAA	2	6	2116513	2116518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_009457	TTG	2	6	2116536	2116541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_009457	AAG	2	6	2116642	2116647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_009457	A	6	6	2117209	2117214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_009457	TCTG	2	8	2117227	2117234	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_009457	TAT	2	6	2117239	2117244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_009457	TTCT	2	8	2117250	2117257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_009457	ATTT	2	8	2118195	2118202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_009457	CGGC	2	8	2118215	2118222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4585	NC_009457	ACCG	2	8	2118228	2118235	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_009457	TC	3	6	2119498	2119503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_009457	A	6	6	2133908	2133913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_009457	CCA	2	6	2133915	2133920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_009457	ATG	2	6	2133933	2133938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_009457	GTA	2	6	2133992	2133997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_009457	TCAC	2	8	2134019	2134026	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_009457	CCT	2	6	2134047	2134052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_009457	ATCCC	2	10	2134170	2134179	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4594	NC_009457	CGG	2	6	2134194	2134199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_009457	CT	3	6	2134204	2134209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_009457	C	6	6	2134233	2134238	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4597	NC_009457	TCC	2	6	2134278	2134283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_009457	CGG	2	6	2134352	2134357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_009457	A	7	7	2134457	2134463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_009457	AGC	2	6	2134472	2134477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_009457	TCAA	2	8	2134485	2134492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4602	NC_009457	AACCA	2	10	2134502	2134511	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4603	NC_009457	TCTA	2	8	2135995	2136002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4604	NC_009457	GTT	2	6	2136003	2136008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_009457	ACA	2	6	2136134	2136139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_009457	GTTG	2	8	2140810	2140817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_009457	TTC	2	6	2141623	2141628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_009457	TTC	2	6	2141637	2141642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_009457	CAA	2	6	2141761	2141766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_009457	CTG	2	6	2141854	2141859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_009457	GAA	2	6	2141865	2141870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_009457	T	6	6	2141880	2141885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_009457	T	6	6	2141906	2141911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_009457	AGG	2	6	2141937	2141942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_009457	ATC	2	6	2141950	2141955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_009457	TCG	2	6	2141957	2141962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_009457	TTA	2	6	2142043	2142048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_009457	TTAG	2	8	2142054	2142061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_009457	TGAC	2	8	2142088	2142095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_009457	GA	3	6	2144025	2144030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_009457	GTT	2	6	2144035	2144040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_009457	AGCTCT	2	12	2147531	2147542	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_009457	ACCAA	2	10	2148242	2148251	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4624	NC_009457	CCCCT	2	10	2148300	2148309	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4625	NC_009457	GGGA	2	8	2148315	2148322	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_009457	CCCT	2	8	2148348	2148355	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4627	NC_009457	AGGG	2	8	2148371	2148378	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_009457	GGC	2	6	2149021	2149026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_009457	AAGT	2	8	2149027	2149034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_009457	GAAC	2	8	2149069	2149076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4631	NC_009457	GCCA	2	8	2149178	2149185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4632	NC_009457	GGTTT	2	10	2149198	2149207	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_009457	AGG	2	6	2150169	2150174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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