MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 2897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009456	ACA	2	6	657572	657577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_009456	TTGC	2	8	657591	657598	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_009456	CATT	2	8	657629	657636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_009456	T	6	6	658246	658251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_009456	ATT	2	6	658971	658976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_009456	CTG	2	6	658986	658991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_009456	TCT	2	6	660870	660875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_009456	TG	3	6	660883	660888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_009456	CATA	2	8	660900	660907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_009456	CTT	2	6	660933	660938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_009456	ATCC	2	8	660983	660990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_009456	CAT	2	6	661000	661005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_009456	CAA	2	6	661037	661042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_009456	AATT	2	8	661163	661170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_009456	ACAT	2	8	661186	661193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_009456	CTTTT	2	10	662646	662655	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1517	NC_009456	TCA	2	6	665644	665649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_009456	AAT	2	6	665680	665685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_009456	TCA	2	6	665723	665728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_009456	CAT	2	6	665745	665750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_009456	AC	3	6	665789	665794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_009456	CATT	2	8	665807	665814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_009456	TTC	3	9	665860	665868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_009456	AG	3	6	667338	667343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_009456	CT	3	6	668387	668392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_009456	TCT	2	6	668457	668462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_009456	AAT	2	6	668506	668511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_009456	AATTG	2	10	668556	668565	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_009456	G	6	6	669645	669650	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_009456	TTG	3	9	669677	669685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_009456	AC	3	6	672077	672082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_009456	CCA	2	6	672123	672128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_009456	CCT	2	6	672138	672143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_009456	GA	4	8	676816	676823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_009456	ATA	2	6	678158	678163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_009456	GTA	2	6	678169	678174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_009456	ACC	2	6	678176	678181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_009456	CTGAC	2	10	681962	681971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1539	NC_009456	TC	3	6	683083	683088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_009456	TC	4	8	686340	686347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_009456	ACA	2	6	686365	686370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_009456	A	6	6	688198	688203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_009456	GCC	2	6	688206	688211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_009456	GGC	2	6	688216	688221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_009456	TGAA	2	8	688597	688604	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_009456	TCC	2	6	689821	689826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_009456	A	6	6	690673	690678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_009456	TTA	2	6	690682	690687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_009456	AGT	2	6	690691	690696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_009456	ATT	2	6	690708	690713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_009456	AAT	2	6	690719	690724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_009456	TTAC	2	8	690746	690753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_009456	AAATG	2	10	690836	690845	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_009456	ATA	2	6	690846	690851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_009456	TAAA	3	12	690858	690869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_009456	AAATAA	2	12	690913	690924	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_009456	GATA	2	8	691003	691010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_009456	TTA	3	9	691099	691107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_009456	ATA	2	6	691168	691173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_009456	CAAATA	2	12	691187	691198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1561	NC_009456	CAA	2	6	694015	694020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_009456	A	6	6	694037	694042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_009456	A	6	6	694577	694582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_009456	CGA	2	6	695312	695317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_009456	TCT	2	6	695371	695376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_009456	T	6	6	695387	695392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_009456	AC	3	6	695402	695407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_009456	TGC	2	6	695412	695417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_009456	ATC	2	6	695429	695434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_009456	AATG	2	8	695464	695471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_009456	GGCA	2	8	695493	695500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_009456	CT	3	6	695513	695518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_009456	CTG	2	6	695531	695536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_009456	AACA	2	8	695562	695569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_009456	GCA	2	6	697564	697569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_009456	ATT	2	6	697573	697578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_009456	TAC	2	6	697662	697667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_009456	GGTT	2	8	697676	697683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_009456	TAC	2	6	697685	697690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_009456	AC	3	6	697693	697698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_009456	GGC	2	6	697723	697728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_009456	TGAA	2	8	697774	697781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_009456	AGG	2	6	697807	697812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_009456	AAC	2	6	699102	699107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_009456	GGC	2	6	699123	699128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_009456	AGTG	2	8	699130	699137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_009456	GAAC	2	8	699175	699182	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_009456	TA	3	6	699218	699223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_009456	AT	3	6	699231	699236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_009456	AAG	2	6	699290	699295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_009456	TTC	2	6	702500	702505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_009456	TTA	2	6	702513	702518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_009456	TAAA	2	8	702529	702536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_009456	AAC	2	6	702573	702578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_009456	A	6	6	702607	702612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_009456	AAT	2	6	702833	702838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_009456	AAC	2	6	702874	702879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_009456	GCA	2	6	702896	702901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_009456	AGTG	2	8	702902	702909	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_009456	GAAC	2	8	702947	702954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_009456	GCT	2	6	703109	703114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_009456	AGC	2	6	704325	704330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_009456	GCA	2	6	704366	704371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_009456	ATG	2	6	710245	710250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_009456	GAC	2	6	711717	711722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_009456	T	6	6	711759	711764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_009456	TTG	2	6	711771	711776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_009456	CGT	2	6	711779	711784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_009456	CTT	2	6	716343	716348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_009456	CTT	2	6	716354	716359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_009456	GTAT	2	8	718640	718647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_009456	ACT	2	6	718678	718683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_009456	GCC	2	6	718716	718721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_009456	TA	3	6	718872	718877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_009456	T	6	6	719315	719320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_009456	CTGA	2	8	719332	719339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_009456	CCT	2	6	719353	719358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_009456	TC	3	6	720288	720293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_009456	ATT	2	6	720302	720307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_009456	CAA	2	6	722485	722490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_009456	TGA	2	6	722559	722564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_009456	TGC	2	6	726352	726357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_009456	TGT	2	6	726367	726372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_009456	T	6	6	727072	727077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_009456	AAAG	2	8	728495	728502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_009456	ATG	2	6	732566	732571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_009456	AAAT	2	8	732791	732798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_009456	CCCCCT	2	12	732825	732836	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1629	NC_009456	GGA	2	6	732843	732848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_009456	AAAT	2	8	732889	732896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_009456	CTC	2	6	732924	732929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_009456	AAAT	2	8	732988	732995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_009456	CAA	2	6	733000	733005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_009456	GGGA	2	8	733140	733147	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_009456	AAG	2	6	736063	736068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_009456	ATG	2	6	736113	736118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1915	NC_009456	AATC	2	8	820738	820745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2000	NC_009456	CAA	2	6	836664	836669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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