MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri ES114 plasmid pES100

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006842	TTA	2	6	347	352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006842	ATA	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006842	TAC	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006842	TA	3	6	407	412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006842	TAAA	2	8	420	427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006842	AGT	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006842	A	6	6	436	441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006842	GAG	2	6	509	514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006842	GAA	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006842	CG	3	6	613	618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006842	A	9	9	620	628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006842	TCA	2	6	649	654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006842	TCG	3	9	1674	1682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006842	TA	3	6	1736	1741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006842	AAT	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006842	AGG	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006842	ACG	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006842	GAT	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006842	CACTAC	2	12	2166	2177	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006842	AAAT	2	8	2196	2203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006842	CAG	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006842	AT	3	6	2262	2267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006842	TTCC	2	8	2729	2736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006842	T	6	6	3283	3288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006842	AGC	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006842	TTTTA	2	10	4298	4307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006842	T	6	6	4338	4343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006842	GCGTTC	2	12	4379	4390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006842	T	6	6	4452	4457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006842	AAAAT	2	10	4459	4468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006842	TTC	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006842	GCG	2	6	5014	5019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006842	AAT	2	6	5103	5108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006842	AGG	2	6	5252	5257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006842	ACG	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006842	TTGC	2	8	5315	5322	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006842	ATT	3	9	5333	5341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006842	TAAC	2	8	5466	5473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006842	CAA	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006842	A	6	6	5544	5549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006842	CGG	2	6	5551	5556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006842	TAA	2	6	5590	5595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006842	TG	3	6	5620	5625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006842	ATCA	2	8	5635	5642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_006842	ATA	2	6	5652	5657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006842	TGA	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006842	GGC	2	6	7401	7406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006842	TTTA	2	8	7421	7428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006842	GAATT	2	10	7431	7440	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006842	GTTT	2	8	8682	8689	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006842	AAAT	2	8	8739	8746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006842	AAC	2	6	8764	8769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006842	TTTTC	2	10	9469	9478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_006842	AG	3	6	9859	9864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006842	GAT	2	6	9883	9888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006842	GAAA	2	8	9948	9955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006842	GTGA	2	8	10028	10035	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006842	AAAG	2	8	10054	10061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006842	CTGG	2	8	10113	10120	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_006842	TCT	2	6	10135	10140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006842	ATTT	2	8	10145	10152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006842	GAG	2	6	10159	10164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006842	ATTT	2	8	10223	10230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006842	ATT	2	6	10232	10237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006842	TA	3	6	10238	10243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006842	GCA	2	6	10278	10283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006842	T	6	6	10298	10303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006842	T	8	8	10308	10315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006842	ACT	2	6	10332	10337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006842	CAA	2	6	10380	10385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006842	A	6	6	10384	10389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006842	ATG	2	6	10409	10414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006842	ATT	2	6	10429	10434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006842	A	6	6	10497	10502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006842	TCA	2	6	11344	11349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006842	CAA	2	6	11526	11531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006842	A	7	7	11543	11549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006842	GTA	2	6	11653	11658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006842	TCAAG	2	10	11723	11732	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_006842	TAT	2	6	12353	12358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006842	AAT	2	6	12378	12383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006842	T	7	7	12680	12686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006842	TAAT	2	8	12691	12698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006842	GCT	2	6	12739	12744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006842	TTA	2	6	12795	12800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006842	CAG	2	6	12824	12829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006842	TGCC	2	8	12844	12851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_006842	TTA	2	6	12886	12891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006842	ATC	2	6	12924	12929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006842	ACTC	2	8	13173	13180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_006842	GT	3	6	13202	13207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006842	TTGG	2	8	13286	13293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006842	AGCA	2	8	13349	13356	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_006842	AT	3	6	13367	13372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006842	TATC	2	8	13385	13392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006842	TGAG	2	8	13395	13402	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006842	TTTTC	2	10	13403	13412	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_006842	T	7	7	14220	14226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006842	A	6	6	14233	14238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006842	AGG	2	6	23485	23490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006842	CTC	2	6	23496	23501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_006842	TA	3	6	23510	23515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006842	ATTTA	2	10	23558	23567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006842	A	6	6	23571	23576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006842	ACA	2	6	24849	24854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006842	T	7	7	24891	24897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006842	CAA	2	6	25614	25619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_006842	AGCGA	2	10	25620	25629	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_006842	TAAAG	2	10	25652	25661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006842	TAT	2	6	32643	32648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006842	ATC	2	6	32693	32698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006842	GAA	2	6	34540	34545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006842	TTC	2	6	36956	36961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006842	CCT	2	6	36962	36967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_006842	ACG	2	6	37552	37557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006842	AGT	2	6	41773	41778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006842	GTA	2	6	41832	41837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006842	CGT	2	6	41855	41860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006842	A	6	6	41936	41941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006842	AGAA	2	8	41946	41953	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006842	A	6	6	41960	41965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006842	A	6	6	41968	41973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006842	T	7	7	43877	43883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006842	TCC	2	6	43886	43891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_006842	A	6	6	43911	43916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006842	GCC	2	6	43994	43999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_006842	TTG	2	6	44030	44035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.