MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 plasmid pYJ016

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005128	A	8	8	1	8	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005128	AAAC	2	8	81	88	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005128	TAA	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005128	GAA	2	6	120	125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005128	A	6	6	132	137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005128	ACT	2	6	141	146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_005128	T	7	7	163	169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005128	TAC	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_005128	GTA	2	6	210	215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005128	GATT	2	8	227	234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005128	T	6	6	243	248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005128	TAT	2	6	259	264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005128	TAA	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005128	A	7	7	523	529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005128	A	7	7	542	548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005128	TTG	2	6	598	603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005128	T	6	6	686	691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005128	T	7	7	709	715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005128	CAT	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_005128	AAT	2	6	775	780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005128	AAT	2	6	836	841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005128	TGA	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005128	TAT	2	6	886	891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005128	TCA	2	6	892	897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_005128	GCC	2	6	992	997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_005128	AGG	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005128	AC	3	6	1937	1942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_005128	CGA	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_005128	ATCA	2	8	2153	2160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_005128	AGG	2	6	13887	13892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005128	TAT	2	6	18577	18582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005128	AATT	2	8	27881	27888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005128	CAATT	2	10	27959	27968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_005128	ATTC	2	8	28032	28039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_005128	TA	4	8	28040	28047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005128	TTAG	2	8	28077	28084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005128	TC	3	6	28114	28119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005128	ACC	2	6	28858	28863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_005128	GAG	2	6	30320	30325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005128	AGC	2	6	30407	30412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_005128	TTG	2	6	30423	30428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005128	GA	3	6	30474	30479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005128	A	6	6	30538	30543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005128	GAG	2	6	30587	30592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005128	ACG	2	6	30595	30600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_005128	ATG	2	6	30854	30859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005128	A	6	6	30865	30870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005128	CTTT	2	8	30886	30893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_005128	CGC	2	6	31844	31849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_005128	CTT	2	6	32420	32425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_005128	GAG	2	6	33243	33248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005128	AGC	2	6	33330	33335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_005128	TTG	2	6	33346	33351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005128	GA	3	6	33397	33402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005128	A	6	6	33461	33466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005128	GAG	2	6	33510	33515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005128	ACG	2	6	33518	33523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_005128	GCTC	2	8	33588	33595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_005128	A	8	8	33719	33726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005128	GAA	2	6	34477	34482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005128	TTG	2	6	34508	34513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005128	A	6	6	34636	34641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005128	CAT	2	6	34642	34647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005128	A	7	7	34751	34757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005128	CAA	3	9	34762	34770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005128	ATA	2	6	34799	34804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005128	AAAT	2	8	34846	34853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005128	GTAA	2	8	34914	34921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005128	CTA	2	6	34943	34948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_005128	CAA	2	6	35331	35336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_005128	T	6	6	36240	36245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005128	AAG	2	6	36360	36365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005128	GCA	2	6	36386	36391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_005128	AT	3	6	36424	36429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005128	TCT	2	6	36440	36445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_005128	CAG	2	6	36488	36493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_005128	T	7	7	36551	36557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005128	ACCA	2	8	36568	36575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_005128	CCCAAC	2	12	36579	36590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_005128	CCTT	2	8	37873	37880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_005128	A	6	6	38192	38197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005128	TGT	2	6	38228	38233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005128	CTGT	2	8	38361	38368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_005128	CAAA	2	8	38419	38426	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_005128	GTTTTA	2	12	38455	38466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005128	ATT	2	6	38493	38498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005128	TTG	2	6	38552	38557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005128	CAA	2	6	39669	39674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_005128	ATA	2	6	39951	39956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005128	AC	4	8	40689	40696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_005128	A	6	6	40829	40834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005128	GTA	2	6	42015	42020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005128	TGT	2	6	42048	42053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005128	GGT	2	6	42054	42059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005128	GGT	2	6	42076	42081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005128	GCA	2	6	42114	42119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_005128	CAA	2	6	42172	42177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_005128	ATC	2	6	42381	42386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_005128	TTG	2	6	42390	42395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005128	GATA	2	8	42403	42410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005128	CCCA	2	8	42434	42441	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_005128	TGG	2	6	42476	42481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005128	ATA	2	6	42538	42543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005128	A	6	6	42606	42611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005128	GTAA	2	8	42614	42621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005128	ATT	2	6	42703	42708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005128	A	8	8	42773	42780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005128	CT	3	6	42822	42827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_005128	AAC	2	6	42917	42922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_005128	GCA	2	6	42968	42973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_005128	GTT	2	6	42984	42989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005128	T	6	6	43563	43568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005128	AAGA	2	8	43600	43607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005128	TTCT	2	8	43626	43633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_005128	GA	4	8	43701	43708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005128	TAA	2	6	44050	44055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005128	A	6	6	44090	44095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005128	CAT	2	6	44157	44162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_005128	CAC	3	9	44182	44190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_005128	TA	3	6	44203	44208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005128	AAAT	2	8	45589	45596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005128	AC	3	6	45635	45640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_005128	GT	3	6	45643	45648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005128	ATG	2	6	46323	46328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005128	T	6	6	46353	46358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005128	CGA	2	6	46408	46413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_005128	CG	3	6	46423	46428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_005128	AAG	2	6	46441	46446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005128	TTG	2	6	46473	46478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005128	AAG	2	6	46482	46487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005128	GCTG	2	8	46692	46699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_005128	AGCGA	2	10	46712	46721	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_005128	TTCTT	2	10	46730	46739	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_005128	ATTT	2	8	46743	46750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005128	T	6	6	46806	46811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005128	TG	3	6	46860	46865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005128	CAC	2	6	46968	46973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_005128	TCC	2	6	46994	46999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_005128	GTT	2	6	48011	48016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005128	A	6	6	48094	48099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005128	AC	3	6	48160	48165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_005128	GTA	2	6	48202	48207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005128	TAT	2	6	48249	48254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005128	A	7	7	48261	48267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005128	TATT	2	8	48283	48290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005128	TCCA	2	8	48330	48337	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_005128	AAT	2	6	48348	48353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005128	TAA	2	6	48373	48378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005128	AGCA	2	8	48469	48476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_005128	GCT	2	6	48482	48487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.