MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 4970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004605	GTCAG	2	10	1451924	1451933	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4002	NC_004605	GATG	2	8	1451948	1451955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_004605	ACTG	2	8	1452103	1452110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_004605	TAA	2	6	1452227	1452232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_004605	CA	3	6	1452243	1452248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_004605	CGA	2	6	1452416	1452421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_004605	TTG	2	6	1452707	1452712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_004605	GTT	3	9	1452717	1452725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_004605	T	6	6	1452724	1452729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_004605	TGA	2	6	1452776	1452781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_004605	ATC	2	6	1452793	1452798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_004605	T	6	6	1452829	1452834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_004605	AAAC	2	8	1452842	1452849	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_004605	CCT	2	6	1452852	1452857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_004605	TAA	2	6	1452895	1452900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_004605	AAAT	2	8	1452917	1452924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_004605	ATA	2	6	1453002	1453007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_004605	ACA	2	6	1453011	1453016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_004605	AAAC	2	8	1453017	1453024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_004605	ATT	2	6	1453043	1453048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_004605	TAA	2	6	1453078	1453083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_004605	AAG	2	6	1454019	1454024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_004605	TTTA	2	8	1454057	1454064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_004605	TGC	3	9	1454078	1454086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_004605	TAT	2	6	1454128	1454133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_004605	TTC	2	6	1454134	1454139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_004605	ATTT	2	8	1454209	1454216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_004605	TTG	2	6	1454485	1454490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_004605	G	6	6	1454490	1454495	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4031	NC_004605	TGAT	2	8	1454544	1454551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_004605	TTA	2	6	1454573	1454578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_004605	CAAC	2	8	1454616	1454623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_004605	T	6	6	1454636	1454641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_004605	CTAT	2	8	1454751	1454758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_004605	ATA	2	6	1454804	1454809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_004605	ACA	2	6	1454815	1454820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4039	NC_004605	TAAT	2	8	1454903	1454910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_004605	A	6	6	1454948	1454953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_004605	AGA	2	6	1454961	1454966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_004605	CT	3	6	1454972	1454977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_004605	TCAAA	2	10	1456397	1456406	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4044	NC_004605	GATTA	2	10	1456411	1456420	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_004605	CTAA	2	8	1456557	1456564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4048	NC_004605	TAAC	2	8	1461510	1461517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_004605	TAT	2	6	1461532	1461537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_004605	ATA	2	6	1461634	1461639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_004605	GTT	2	6	1461659	1461664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4053	NC_004605	A	6	6	1461703	1461708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_004605	TAC	2	6	1461786	1461791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4057	NC_004605	ATTT	2	8	1462177	1462184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_004605	AAG	2	6	1462783	1462788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4062	NC_004605	A	7	7	1468866	1468872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_004605	CAGC	2	8	1468940	1468947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_004605	CGG	2	6	1468984	1468989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_004605	CCAAA	2	10	1468990	1468999	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4066	NC_004605	TC	3	6	1469979	1469984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_004605	AATA	2	8	1471584	1471591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4085	NC_004605	GA	3	6	1473313	1473318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_004605	AAT	2	6	1473461	1473466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_004605	A	7	7	1473467	1473473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4093	NC_004605	CTCG	2	8	1474692	1474699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4096	NC_004605	ACA	2	6	1474917	1474922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4099	NC_004605	TAC	2	6	1480105	1480110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_004605	CTG	2	6	1480111	1480116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_004605	ACCCA	2	10	1480127	1480136	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4102	NC_004605	GCT	2	6	1480142	1480147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4109	NC_004605	TGT	2	6	1487095	1487100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_004605	TA	3	6	1487128	1487133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_004605	AG	3	6	1487158	1487163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_004605	A	6	6	1487497	1487502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_004605	GAC	2	6	1487506	1487511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_004605	AC	3	6	1488204	1488209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_004605	GAAC	2	8	1488243	1488250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_004605	GAC	2	6	1488255	1488260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_004605	AAGG	2	8	1489333	1489340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_004605	CGT	2	6	1490006	1490011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_004605	T	6	6	1490033	1490038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4121	NC_004605	TTG	2	6	1490114	1490119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_004605	TAA	2	6	1490121	1490126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_004605	CAA	2	6	1490141	1490146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_004605	CAC	2	6	1490193	1490198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_004605	ATTGA	2	10	1490201	1490210	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_004605	TAA	2	6	1490245	1490250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_004605	TGA	2	6	1490275	1490280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_004605	TTC	2	6	1491855	1491860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_004605	CTGA	2	8	1492766	1492773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_004605	CTA	2	6	1492790	1492795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4132	NC_004605	TTA	2	6	1492892	1492897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_004605	T	6	6	1567466	1567471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4398	NC_004605	A	6	6	1629099	1629104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_004605	CTTT	2	8	1629122	1629129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4400	NC_004605	TCAT	2	8	1629133	1629140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4401	NC_004605	CGG	2	6	1630530	1630535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4403	NC_004605	TC	3	6	1631048	1631053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4421	NC_004605	T	6	6	1649753	1649758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4430	NC_004605	CTG	2	6	1657927	1657932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4433	NC_004605	ATTTT	2	10	1659052	1659061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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