MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 4970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004605	GTT	2	6	366171	366176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_004605	GAT	2	6	367054	367059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_004605	CAA	2	6	367119	367124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_004605	A	6	6	367123	367128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_004605	TAG	2	6	369600	369605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_004605	CAAA	2	8	369623	369630	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_004605	A	7	7	369678	369684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_004605	TTA	2	6	369736	369741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_004605	GAG	2	6	370640	370645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_004605	CCT	2	6	370657	370662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_004605	GTT	2	6	370701	370706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_004605	GTTG	2	8	371800	371807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_004605	AAC	2	6	371811	371816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_004605	CAA	2	6	371860	371865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_004605	ATCAA	2	10	371907	371916	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1016	NC_004605	CTT	2	6	371938	371943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_004605	GTAA	2	8	372004	372011	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_004605	AGG	2	6	372049	372054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_004605	AGA	2	6	372072	372077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_004605	A	8	8	372102	372109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_004605	ATG	2	6	372145	372150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_004605	ATA	2	6	373488	373493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_004605	ATTA	2	8	373500	373507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_004605	A	6	6	375537	375542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_004605	AAC	2	6	377281	377286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_004605	AT	3	6	377299	377304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_004605	AGTG	2	8	377328	377335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_004605	AAC	3	9	377366	377374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_004605	AGCT	2	8	379786	379793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_004605	AGC	2	6	379829	379834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_004605	T	7	7	379846	379852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_004605	GTT	2	6	381659	381664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_004605	ATT	2	6	381789	381794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_004605	TTTC	2	8	383624	383631	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_004605	TTGA	2	8	383695	383702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_004605	GCTC	2	8	383765	383772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1038	NC_004605	A	6	6	386748	386753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_004605	TGT	2	6	386798	386803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1042	NC_004605	GGCA	2	8	388543	388550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_004605	AAC	2	6	388599	388604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_004605	A	6	6	388605	388610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_004605	ATTT	2	8	389111	389118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_004605	AT	3	6	389159	389164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_004605	ACTG	2	8	389185	389192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_004605	TCG	2	6	389283	389288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_004605	GCTT	2	8	389296	389303	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_004605	ACA	2	6	389328	389333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_004605	TGAA	2	8	389366	389373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_004605	TAGT	2	8	389403	389410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_004605	TGGT	2	8	389483	389490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_004605	AG	3	6	389496	389501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_004605	TGA	2	6	389596	389601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_004605	TG	3	6	394102	394107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_004605	CG	3	6	394232	394237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_004605	TTG	2	6	394249	394254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_004605	T	6	6	394296	394301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_004605	TGCT	2	8	394646	394653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_004605	CAA	2	6	394697	394702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_004605	TC	4	8	394724	394731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_004605	TGC	2	6	395949	395954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_004605	AG	3	6	396070	396075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_004605	T	6	6	396099	396104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_004605	T	6	6	396112	396117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_004605	TGC	2	6	396120	396125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_004605	T	6	6	396135	396140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_004605	CG	3	6	396164	396169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_004605	T	7	7	397350	397356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_004605	GT	3	6	397392	397397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_004605	GGT	2	6	398421	398426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1080	NC_004605	TCTTA	2	10	402757	402766	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1084	NC_004605	GTA	2	6	405346	405351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_004605	TG	3	6	409504	409509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_004605	TG	3	6	409615	409620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_004605	CTAAAC	2	12	410290	410301	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1102	NC_004605	TGC	2	6	411565	411570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_004605	ACT	2	6	411594	411599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_004605	T	7	7	411650	411656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_004605	A	6	6	412284	412289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1108	NC_004605	GGA	2	6	412366	412371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_004605	ACA	2	6	413175	413180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_004605	TGT	2	6	413184	413189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_004605	AAT	2	6	413227	413232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_004605	TTGA	2	8	413337	413344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_004605	AAT	2	6	413391	413396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_004605	ACGTT	2	10	413515	413524	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1115	NC_004605	GAT	2	6	413551	413556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_004605	AGTG	2	8	414146	414153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004605	CTT	2	6	414191	414196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_004605	T	7	7	418902	418908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1129	NC_004605	TCA	2	6	422171	422176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1131	NC_004605	TAT	2	6	422244	422249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_004605	CAA	2	6	423753	423758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_004605	TAA	2	6	423767	423772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_004605	C	6	6	425576	425581	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1135	NC_004605	C	6	6	425584	425589	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1136	NC_004605	GTT	2	6	426651	426656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_004605	CACT	2	8	427457	427464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1413	NC_004605	TGA	2	6	514210	514215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_004605	TCA	2	6	514259	514264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_004605	ATTC	2	8	514294	514301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1416	NC_004605	ACC	2	6	514318	514323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1417	NC_004605	TGC	2	6	514327	514332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1418	NC_004605	AG	3	6	514375	514380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_004605	TGC	2	6	514412	514417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1420	NC_004605	CAG	2	6	514419	514424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1421	NC_004605	GA	3	6	514427	514432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_004605	GCC	2	6	515642	515647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1423	NC_004605	T	6	6	515666	515671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_004605	GA	3	6	515695	515700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1428	NC_004605	T	6	6	518130	518135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1430	NC_004605	GTC	2	6	518222	518227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_004605	TGT	2	6	518343	518348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_004605	CCA	2	6	521042	521047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1445	NC_004605	TTA	2	6	521590	521595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_004605	TA	3	6	521702	521707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_004605	T	8	8	522382	522389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_004605	TTA	2	6	525678	525683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_004605	ACG	2	6	525715	525720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_004605	TCC	2	6	526799	526804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1453	NC_004605	AAT	2	6	526810	526815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_004605	ATC	2	6	526837	526842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1456	NC_004605	GAAA	2	8	528686	528693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_004605	ACA	2	6	528749	528754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1459	NC_004605	ATA	2	6	530588	530593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1472	NC_004605	ATTG	2	8	532325	532332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1473	NC_004605	ATGA	2	8	532334	532341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1477	NC_004605	TAA	2	6	532575	532580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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