MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 8197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002505	AG	3	6	510558	510563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_002505	ATT	2	6	510600	510605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_002505	ATT	2	6	510626	510631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_002505	ACTTTG	2	12	510638	510649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1505	NC_002505	TA	3	6	511644	511649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_002505	T	6	6	511680	511685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_002505	ATA	2	6	512419	512424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_002505	TAAT	2	8	512443	512450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_002505	TAA	2	6	512476	512481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_002505	ATG	2	6	513458	513463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_002505	ATG	2	6	514210	514215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_002505	CGA	2	6	514227	514232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_002505	TATT	2	8	514316	514323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_002505	T	6	6	514344	514349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_002505	TAA	2	6	514402	514407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_002505	ACT	2	6	514412	514417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_002505	TCA	2	6	514425	514430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_002505	ATTG	2	8	514440	514447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_002505	AAAG	2	8	514448	514455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_002505	AC	3	6	514496	514501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_002505	ATC	2	6	514530	514535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_002505	TGTT	2	8	514559	514566	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_002505	TCA	2	6	514627	514632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_002505	TAA	2	6	514652	514657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_002505	A	6	6	514656	514661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_002505	TGG	3	9	516176	516184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_002505	CGG	2	6	516199	516204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_002505	TGAC	2	8	516295	516302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_002505	T	8	8	516387	516394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_002505	T	6	6	516483	516488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_002505	AAAT	2	8	516495	516502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_002505	TTA	2	6	517354	517359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_002505	A	6	6	517379	517384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_002505	A	6	6	520420	520425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_002505	ATC	2	6	520432	520437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_002505	GAG	2	6	520454	520459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_002505	ATTTT	2	10	520563	520572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_002505	TGA	2	6	522454	522459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_002505	TTG	2	6	522465	522470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_002505	GTTT	2	8	522615	522622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_002505	ACA	2	6	522649	522654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_002505	TGG	2	6	522726	522731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_002505	A	6	6	522814	522819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_002505	CTA	2	6	522838	522843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_002505	AAT	2	6	522900	522905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_002505	TTGGTT	2	12	522913	522924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_002505	TA	3	6	522962	522967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_002505	GAAAA	2	10	522970	522979	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_002505	AT	4	8	523000	523007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_002505	T	6	6	523011	523016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_002505	TTTTG	2	10	523024	523033	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_002505	TAG	2	6	523040	523045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_002505	T	6	6	523062	523067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_002505	TAT	2	6	523108	523113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_002505	CAA	2	6	526846	526851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_002505	TAGA	2	8	526902	526909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_002505	TTG	2	6	526932	526937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_002505	TTA	2	6	526939	526944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_002505	TACC	2	8	526992	526999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_002505	ACC	2	6	527006	527011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_002505	GAT	2	6	527953	527958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_002505	AT	3	6	527957	527962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_002505	T	7	7	527980	527986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_002505	A	7	7	528043	528049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_002505	ATC	2	6	528093	528098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_002505	A	6	6	528099	528104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_002505	TAAT	2	8	528134	528141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_002505	AT	4	8	528143	528150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_002505	CAAC	2	8	528179	528186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_002505	TCA	2	6	528191	528196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_002505	AG	3	6	528234	528239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_002505	TAT	2	6	528295	528300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_002505	GTA	2	6	528958	528963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_002505	CAA	2	6	528983	528988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_002505	T	6	6	530344	530349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_002505	TA	3	6	530372	530377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_002505	CAT	2	6	530613	530618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_002505	AG	3	6	530664	530669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_002505	A	7	7	530672	530678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_002505	T	6	6	531168	531173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_002505	GTTG	2	8	531185	531192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_002505	GTT	2	6	531240	531245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_002505	ACC	2	6	531265	531270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_002505	AT	3	6	531311	531316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_002505	CT	3	6	531328	531333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_002505	GAA	2	6	531391	531396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_002505	TTGAT	2	10	531449	531458	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_002505	CAG	2	6	531466	531471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_002505	AG	3	6	531559	531564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_002505	CCAA	2	8	531607	531614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_002505	ACA	2	6	531641	531646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_002505	TTGG	2	8	531703	531710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_002505	GAT	2	6	531783	531788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_002505	TAA	2	6	531814	531819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_002505	CAG	2	6	531897	531902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_002505	TTGC	2	8	531908	531915	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1598	NC_002505	CTT	2	6	531924	531929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_002505	CTG	2	6	531998	532003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_002505	GTT	2	6	532074	532079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_002505	AG	3	6	532081	532086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_002505	AG	3	6	532097	532102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_002505	T	6	6	532111	532116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_002505	TTC	2	6	532131	532136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_002505	TCT	2	6	532151	532156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_002505	TTTC	2	8	532216	532223	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_002505	TGC	2	6	532295	532300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_002505	GCT	2	6	532338	532343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_002505	ATG	2	6	532470	532475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_002505	GGT	2	6	532549	532554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_002505	TAT	2	6	532579	532584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_002505	AGTG	2	8	532673	532680	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_002505	GATG	2	8	532709	532716	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_002505	AAGG	2	8	532721	532728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_002505	TCA	2	6	532804	532809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_002505	AGG	2	6	532833	532838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_002505	TTG	2	6	532843	532848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_002505	ATC	2	6	532951	532956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1620	NC_002505	TGC	2	6	533151	533156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_002505	TGC	2	6	533202	533207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_002505	GCA	2	6	533285	533290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_002505	AAT	2	6	533331	533336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_002505	GT	3	6	533340	533345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_002505	T	6	6	533406	533411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_002505	CTCACC	2	12	533421	533432	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_002505	GTTTT	2	10	533476	533485	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_002505	CGA	2	6	533511	533516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_002505	AGT	2	6	533633	533638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_002505	CACT	2	8	533697	533704	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_002505	TGAT	2	8	533742	533749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_002505	ATTGT	2	10	533759	533768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_002505	GTT	2	6	533774	533779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_002505	TGAA	2	8	533816	533823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_002505	CAA	2	6	533872	533877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1637	NC_002505	AGT	2	6	533901	533906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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