MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 8197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_002505	AG	3	6	2553989	2553994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_002505	CT	3	6	2554004	2554009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7003	NC_002505	TGT	2	6	2554010	2554015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_002505	ATT	2	6	2558445	2558450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_002505	CTA	2	6	2558467	2558472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_002505	ATTTA	2	10	2558558	2558567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_002505	TGA	2	6	2558582	2558587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_002505	TCA	2	6	2558594	2558599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_002505	A	7	7	2558608	2558614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_002505	A	7	7	2558692	2558698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_002505	CA	3	6	2558703	2558708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7012	NC_002505	AAG	2	6	2558774	2558779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_002505	AAC	2	6	2558787	2558792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_002505	AGCTT	2	10	2558799	2558808	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7015	NC_002505	A	8	8	2558853	2558860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_002505	CAG	2	6	2558864	2558869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_002505	A	6	6	2559807	2559812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_002505	GTT	2	6	2560304	2560309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_002505	TAA	2	6	2560347	2560352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_002505	TG	3	6	2563174	2563179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_002505	TGA	2	6	2563188	2563193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_002505	TTAA	2	8	2563219	2563226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_002505	TGC	2	6	2563228	2563233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_002505	CAA	2	6	2563256	2563261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_002505	TTG	2	6	2563279	2563284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_002505	AAG	2	6	2563385	2563390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_002505	A	6	6	2563952	2563957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_002505	TCTG	2	8	2563970	2563977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7029	NC_002505	TAT	2	6	2563982	2563987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_002505	TTCT	2	8	2563993	2564000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7031	NC_002505	CGGC	2	8	2564957	2564964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7032	NC_002505	ACCG	2	8	2564970	2564977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7033	NC_002505	GAT	2	6	2569957	2569962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_002505	CGAG	2	8	2572216	2572223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7035	NC_002505	A	6	6	2580650	2580655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_002505	CCA	2	6	2580657	2580662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7037	NC_002505	ATG	2	6	2580675	2580680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_002505	GTA	2	6	2580734	2580739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_002505	TCAC	2	8	2580761	2580768	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7040	NC_002505	CCT	2	6	2580789	2580794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7041	NC_002505	ATCCC	2	10	2580912	2580921	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7042	NC_002505	CGG	2	6	2580936	2580941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_002505	CT	3	6	2580946	2580951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7044	NC_002505	C	6	6	2580975	2580980	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7045	NC_002505	TCC	2	6	2581020	2581025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_002505	CGG	2	6	2581094	2581099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_002505	A	8	8	2581199	2581206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_002505	AGC	2	6	2581215	2581220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_002505	TCAA	2	8	2581228	2581235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7050	NC_002505	AACCA	2	10	2581245	2581254	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7051	NC_002505	CTTTTT	2	12	2581270	2581281	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7052	NC_002505	TCTA	2	8	2582738	2582745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7053	NC_002505	GTT	2	6	2582746	2582751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_002505	ACA	2	6	2582877	2582882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_002505	GAC	2	6	2582973	2582978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_002505	TTG	2	6	2587598	2587603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_002505	CAA	2	6	2588498	2588503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_002505	GAA	2	6	2588602	2588607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_002505	T	6	6	2588617	2588622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_002505	T	6	6	2588643	2588648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_002505	AGG	2	6	2588674	2588679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_002505	ATC	2	6	2588687	2588692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_002505	TCG	2	6	2588694	2588699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_002505	TTA	2	6	2588780	2588785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_002505	TTAG	2	8	2588791	2588798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_002505	TGAC	2	8	2588825	2588832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7067	NC_002505	A	7	7	2588837	2588843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_002505	GTT	2	6	2590771	2590776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7070	NC_002505	TG	3	6	2592584	2592589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_002505	CAGA	2	8	2594375	2594382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7072	NC_002505	ATT	2	6	2594388	2594393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7075	NC_002505	ACCAA	2	10	2595033	2595042	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7076	NC_002505	CCCCT	2	10	2595091	2595100	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
7077	NC_002505	GGGA	2	8	2595106	2595113	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_002505	CCCT	2	8	2595139	2595146	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7079	NC_002505	AGGG	2	8	2595162	2595169	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_002505	GGC	2	6	2595812	2595817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_002505	AAGT	2	8	2595818	2595825	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_002505	GAAC	2	8	2595860	2595867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7083	NC_002505	GCCA	2	8	2595969	2595976	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7084	NC_002505	GGTTT	2	10	2595989	2595998	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_002505	AGG	2	6	2596960	2596965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7088	NC_002505	TCA	2	6	2597042	2597047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7090	NC_002505	C	6	6	2597103	2597108	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7091	NC_002505	GC	3	6	2600613	2600618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7092	NC_002505	TGA	2	6	2602956	2602961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_002505	CA	3	6	2602972	2602977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7094	NC_002505	GCT	2	6	2603013	2603018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7097	NC_002505	T	6	6	2607515	2607520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_002505	ATT	2	6	2607546	2607551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_002505	CAAG	2	8	2607602	2607609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7101	NC_002505	GCA	2	6	2607733	2607738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_002505	ACA	2	6	2607760	2607765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_002505	AGTC	2	8	2607768	2607775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7104	NC_002505	ATCA	2	8	2607776	2607783	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7105	NC_002505	AAT	2	6	2607799	2607804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_002505	TA	3	6	2610366	2610371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_002505	T	6	6	2610384	2610389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_002505	A	6	6	2610433	2610438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_002505	A	6	6	2610527	2610532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_002505	ATT	2	6	2610541	2610546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_002505	TA	3	6	2611896	2611901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_002505	ACC	2	6	2611955	2611960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7113	NC_002505	GAT	2	6	2611973	2611978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_002505	GGT	2	6	2611982	2611987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_002505	AGC	2	6	2611990	2611995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7116	NC_002505	CTT	2	6	2611996	2612001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_002505	CAC	2	6	2612023	2612028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7118	NC_002505	CTT	2	6	2612041	2612046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_002505	TCT	2	6	2612061	2612066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7124	NC_002505	T	6	6	2612375	2612380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_002505	ACC	2	6	2612493	2612498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7126	NC_002505	CGG	2	6	2612503	2612508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_002505	CGC	2	6	2612561	2612566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7128	NC_002505	CTT	2	6	2612611	2612616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_002505	TGGG	2	8	2612622	2612629	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_002505	GCA	2	6	2612656	2612661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7131	NC_002505	AGC	2	6	2612802	2612807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7132	NC_002505	CAC	2	6	2612812	2612817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7133	NC_002505	GCC	2	6	2612867	2612872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7134	NC_002505	CTG	2	6	2612890	2612895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7137	NC_002505	CTG	2	6	2613031	2613036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7400	NC_002505	T	6	6	2686405	2686410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7401	NC_002505	AAT	2	6	2686412	2686417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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