MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 8197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_002505	ATG	2	6	2350307	2350312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_002505	GCA	2	6	2350346	2350351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_002505	CAAA	2	8	2350796	2350803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6504	NC_002505	A	6	6	2350823	2350828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_002505	A	8	8	2352122	2352129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_002505	TATC	2	8	2352135	2352142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6507	NC_002505	TAA	3	9	2360695	2360703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_002505	AG	3	6	2360802	2360807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_002505	TGAA	2	8	2360853	2360860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_002505	CATC	2	8	2360891	2360898	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_002505	TCC	2	6	2361755	2361760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_002505	CAAT	2	8	2361805	2361812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6513	NC_002505	AGCTC	2	10	2361908	2361917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6514	NC_002505	A	7	7	2361937	2361943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_002505	GTT	2	6	2361967	2361972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_002505	CTTC	2	8	2364128	2364135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_002505	CAAAA	2	10	2364174	2364183	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6518	NC_002505	CGA	2	6	2364234	2364239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_002505	CAT	2	6	2364301	2364306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_002505	TAA	2	6	2364316	2364321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_002505	CAAAT	2	10	2364326	2364335	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6522	NC_002505	TAGA	2	8	2364373	2364380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_002505	AG	3	6	2364401	2364406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_002505	AG	3	6	2364467	2364472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_002505	A	6	6	2365213	2365218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_002505	TGA	2	6	2365252	2365257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_002505	ATT	2	6	2365267	2365272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_002505	AAAAAG	2	12	2366358	2366369	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_002505	TTA	2	6	2366380	2366385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_002505	ATA	2	6	2366473	2366478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_002505	A	6	6	2366478	2366483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_002505	GGCTTT	2	12	2366501	2366512	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6533	NC_002505	AAC	2	6	2366524	2366529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_002505	TTCGC	2	10	2366536	2366545	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6535	NC_002505	ACCTT	2	10	2368098	2368107	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6536	NC_002505	AAGGTT	2	12	2368108	2368119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_002505	AGG	2	6	2368141	2368146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_002505	A	6	6	2371391	2371396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_002505	AAAAG	2	10	2371400	2371409	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_002505	ATT	2	6	2371459	2371464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_002505	AGTGA	2	10	2371467	2371476	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_002505	CTGC	2	8	2374149	2374156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_002505	T	6	6	2374220	2374225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_002505	TTC	2	6	2374355	2374360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_002505	AAAG	2	8	2374395	2374402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_002505	CA	3	6	2374414	2374419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6547	NC_002505	CAA	2	6	2374429	2374434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_002505	CAA	2	6	2374458	2374463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_002505	CGG	2	6	2375465	2375470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_002505	TTCT	2	8	2375697	2375704	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6551	NC_002505	TC	3	6	2375743	2375748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6552	NC_002505	CAG	2	6	2375761	2375766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_002505	A	6	6	2375777	2375782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_002505	TGC	2	6	2375848	2375853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_002505	GGA	2	6	2375896	2375901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_002505	TCT	2	6	2375922	2375927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_002505	T	6	6	2376112	2376117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_002505	TA	3	6	2376186	2376191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_002505	CTAGC	2	10	2377886	2377895	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6560	NC_002505	TTA	2	6	2377971	2377976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_002505	AGAA	2	8	2379537	2379544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_002505	TAA	2	6	2380525	2380530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_002505	TC	3	6	2380535	2380540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_002505	CTTT	2	8	2382233	2382240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6565	NC_002505	ACA	2	6	2382263	2382268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_002505	GAAC	2	8	2382288	2382295	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6567	NC_002505	TCAA	2	8	2383263	2383270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6568	NC_002505	CG	3	6	2383859	2383864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6570	NC_002505	AAG	2	6	2383967	2383972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_002505	AG	3	6	2383983	2383988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_002505	CT	3	6	2384152	2384157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6573	NC_002505	TTCA	2	8	2386673	2386680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6574	NC_002505	AAC	2	6	2386691	2386696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6582	NC_002505	TTA	3	9	2393443	2393451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6586	NC_002505	CAA	2	6	2394618	2394623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_002505	CAAA	2	8	2394719	2394726	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6588	NC_002505	ATA	2	6	2394729	2394734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_002505	GAAC	2	8	2394821	2394828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6597	NC_002505	CTCA	2	8	2403153	2403160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6598	NC_002505	AAT	2	6	2403176	2403181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_002505	ATCA	2	8	2408541	2408548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6600	NC_002505	AGC	2	6	2411145	2411150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6602	NC_002505	TGC	2	6	2412824	2412829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6604	NC_002505	TCA	2	6	2414277	2414282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_002505	ATT	2	6	2415365	2415370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_002505	TG	4	8	2416177	2416184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_002505	GC	3	6	2416253	2416258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6608	NC_002505	TG	3	6	2416279	2416284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_002505	A	6	6	2416290	2416295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_002505	TCG	2	6	2416297	2416302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_002505	GAC	2	6	2416348	2416353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_002505	TG	3	6	2416405	2416410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_002505	T	7	7	2417318	2417324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_002505	CAAC	2	8	2420077	2420084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6615	NC_002505	TA	3	6	2420119	2420124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_002505	GGC	2	6	2420150	2420155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_002505	AGTG	2	8	2420157	2420164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_002505	GAAC	2	8	2420202	2420209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6619	NC_002505	CTG	2	6	2422257	2422262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6622	NC_002505	TAGG	2	8	2423415	2423422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_002505	ATT	2	6	2423487	2423492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6631	NC_002505	A	9	9	2431307	2431315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6633	NC_002505	TCT	2	6	2431852	2431857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6894	NC_002505	AG	4	8	2515668	2515675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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