MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 34971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_022543	CTT	3	9	2113983	2113991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720189
33502	NC_022543	TCGA	2	8	2114003	2114010	25 %	25 %	25 %	25 %	549720189
33503	NC_022543	CAG	3	9	2114068	2114076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720189
33504	NC_022543	CCG	2	6	2114168	2114173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549720189
33505	NC_022543	AAC	2	6	2114192	2114197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549720189
33506	NC_022543	A	6	6	2114269	2114274	100 %	0 %	0 %	0 %	549720189
33507	NC_022543	CAGA	2	8	2114472	2114479	50 %	0 %	25 %	25 %	549720189
33508	NC_022543	TGC	2	6	2114670	2114675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720190
33509	NC_022543	GTC	2	6	2114762	2114767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720190
33510	NC_022543	TAA	2	6	2114822	2114827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549720190
33511	NC_022543	AGCC	2	8	2114828	2114835	25 %	0 %	25 %	50 %	549720190
33512	NC_022543	CTGG	2	8	2114855	2114862	0 %	25 %	50 %	25 %	549720190
33513	NC_022543	TCT	2	6	2114988	2114993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720190
33514	NC_022543	CCA	2	6	2115037	2115042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720190
33515	NC_022543	AACC	2	8	2115058	2115065	50 %	0 %	0 %	50 %	549720190
33516	NC_022543	TTC	2	6	2115125	2115130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720190
33517	NC_022543	ATG	2	6	2115132	2115137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720190
33518	NC_022543	TTA	2	6	2115150	2115155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549720190
33519	NC_022543	AGCTG	2	10	2115163	2115172	20 %	20 %	40 %	20 %	549720190
33520	NC_022543	TGA	2	6	2115190	2115195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720190
33521	NC_022543	AT	3	6	2115229	2115234	50 %	50 %	0 %	0 %	549720190
33522	NC_022543	ATGA	2	8	2115386	2115393	50 %	25 %	25 %	0 %	549720190
33523	NC_022543	AATA	2	8	2115503	2115510	75 %	25 %	0 %	0 %	549720190
33524	NC_022543	ATC	2	6	2115518	2115523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720190
33525	NC_022543	GC	3	6	2115703	2115708	0 %	0 %	50 %	50 %	549720191
33526	NC_022543	AAG	2	6	2115731	2115736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720191
33527	NC_022543	GAA	2	6	2115814	2115819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720191
33528	NC_022543	AAC	2	6	2115839	2115844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549720191
33529	NC_022543	GAG	2	6	2115920	2115925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549720191
33530	NC_022543	ATG	2	6	2115982	2115987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720192
33531	NC_022543	T	7	7	2116028	2116034	0 %	100 %	0 %	0 %	549720192
33532	NC_022543	T	6	6	2116053	2116058	0 %	100 %	0 %	0 %	549720192
33533	NC_022543	CTG	2	6	2116070	2116075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720192
33534	NC_022543	CTGAA	2	10	2116170	2116179	40 %	20 %	20 %	20 %	549720193
33535	NC_022543	CAGC	2	8	2116327	2116334	25 %	0 %	25 %	50 %	549720193
33536	NC_022543	ATC	2	6	2116376	2116381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720193
33537	NC_022543	GTT	2	6	2116435	2116440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549720193
33538	NC_022543	CCAG	2	8	2116463	2116470	25 %	0 %	25 %	50 %	549720193
33539	NC_022543	CA	3	6	2116648	2116653	50 %	0 %	0 %	50 %	549720194
33540	NC_022543	CCA	2	6	2116699	2116704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720194
33541	NC_022543	TGG	2	6	2116711	2116716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549720194
33542	NC_022543	TTC	2	6	2116767	2116772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720194
33543	NC_022543	ACAG	2	8	2116797	2116804	50 %	0 %	25 %	25 %	549720194
33544	NC_022543	ACC	2	6	2116886	2116891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720194
33545	NC_022543	GC	3	6	2116968	2116973	0 %	0 %	50 %	50 %	549720194
33546	NC_022543	CAG	2	6	2116997	2117002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720194
33547	NC_022543	TGC	2	6	2117191	2117196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720194
33548	NC_022543	TTC	2	6	2117198	2117203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720194
33549	NC_022543	GGC	2	6	2117221	2117226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549720194
33550	NC_022543	ATC	2	6	2117232	2117237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720194
33551	NC_022543	TGA	2	6	2117242	2117247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720194
33552	NC_022543	GTC	2	6	2117273	2117278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720194
33553	NC_022543	GCG	2	6	2117657	2117662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549720194
33554	NC_022543	GCG	2	6	2117921	2117926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549720194
33555	NC_022543	GCA	2	6	2117953	2117958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720194
33556	NC_022543	CTT	2	6	2118007	2118012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720194
33557	NC_022543	TTCA	2	8	2118074	2118081	25 %	50 %	0 %	25 %	549720194
33558	NC_022543	GCCA	3	12	2118195	2118206	25 %	0 %	25 %	50 %	549720194
33559	NC_022543	TGCTT	2	10	2118223	2118232	0 %	60 %	20 %	20 %	549720194
33560	NC_022543	GCT	3	9	2118268	2118276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720194
33561	NC_022543	CGA	2	6	2118335	2118340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720194
33562	NC_022543	ATC	2	6	2118350	2118355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720194
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33564	NC_022543	TCT	2	6	2118387	2118392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720194
33565	NC_022543	A	7	7	2118811	2118817	100 %	0 %	0 %	0 %	549720195
33566	NC_022543	CT	3	6	2118830	2118835	0 %	50 %	0 %	50 %	549720195
33567	NC_022543	CAAT	2	8	2118847	2118854	50 %	25 %	0 %	25 %	549720195
33568	NC_022543	TGA	2	6	2118915	2118920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720195
33569	NC_022543	GCG	3	9	2118983	2118991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549720195
33570	NC_022543	ACCAA	2	10	2119152	2119161	60 %	0 %	0 %	40 %	549720195
33571	NC_022543	CGA	2	6	2119260	2119265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720195
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33583	NC_022543	A	6	6	2120298	2120303	100 %	0 %	0 %	0 %	549720197
33584	NC_022543	TC	3	6	2120308	2120313	0 %	50 %	0 %	50 %	549720197
33585	NC_022543	TGG	2	6	2120384	2120389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549720197
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33588	NC_022543	GAT	2	6	2120615	2120620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720197
33589	NC_022543	ATC	2	6	2120643	2120648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720197
33590	NC_022543	GTC	2	6	2120649	2120654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720197
33591	NC_022543	TGA	2	6	2120692	2120697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720197
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33598	NC_022543	CTCAA	2	10	2121041	2121050	40 %	20 %	0 %	40 %	549720197
33599	NC_022543	ACT	2	6	2121188	2121193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720197
33600	NC_022543	ATT	2	6	2121288	2121293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549720198
33601	NC_022543	AGCAA	2	10	2121295	2121304	60 %	0 %	20 %	20 %	549720198
33602	NC_022543	GAA	2	6	2121387	2121392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720198
33603	NC_022543	AC	3	6	2121447	2121452	50 %	0 %	0 %	50 %	549720198
33604	NC_022543	ATG	2	6	2121565	2121570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720198
33605	NC_022543	AAG	2	6	2121592	2121597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720198
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33607	NC_022543	CCA	2	6	2122028	2122033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720199
33608	NC_022543	CAA	2	6	2122037	2122042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549720199
33609	NC_022543	TCG	2	6	2122052	2122057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720199
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33611	NC_022543	GCA	2	6	2122114	2122119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720199
33612	NC_022543	GTG	3	9	2122144	2122152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549720199
33613	NC_022543	AACCG	2	10	2122158	2122167	40 %	0 %	20 %	40 %	549720199
33614	NC_022543	AT	3	6	2122256	2122261	50 %	50 %	0 %	0 %	549720199
33615	NC_022543	TG	3	6	2122365	2122370	0 %	50 %	50 %	0 %	549720199
33616	NC_022543	CACT	2	8	2122382	2122389	25 %	25 %	0 %	50 %	549720199
33617	NC_022543	GTAA	2	8	2122464	2122471	50 %	25 %	25 %	0 %	549720199
33618	NC_022543	TCCA	2	8	2122503	2122510	25 %	25 %	0 %	50 %	549720199
33619	NC_022543	ACC	2	6	2122534	2122539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720199
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33621	NC_022543	CAG	2	6	2122734	2122739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720199
33622	NC_022543	TGC	2	6	2122781	2122786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720199
33623	NC_022543	TTC	2	6	2122842	2122847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720199
33624	NC_022543	CTGG	2	8	2122905	2122912	0 %	25 %	50 %	25 %	549720199
33625	NC_022543	GTA	2	6	2122914	2122919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720199
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33629	NC_022543	TCA	2	6	2123191	2123196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720199
33630	NC_022543	GTA	2	6	2123214	2123219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720199
33631	NC_022543	TGT	2	6	2123228	2123233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549720199
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33648	NC_022543	TTCA	2	8	2124497	2124504	25 %	50 %	0 %	25 %	549720200
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33687	NC_022543	TGA	2	6	2126736	2126741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720201
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33730	NC_022543	ACG	2	6	2129872	2129877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720204
33731	NC_022543	TCAA	2	8	2129902	2129909	50 %	25 %	0 %	25 %	549720204
33732	NC_022543	CCA	2	6	2129937	2129942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720204
33733	NC_022543	TCG	2	6	2130050	2130055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720204
33734	NC_022543	ATCCA	2	10	2130069	2130078	40 %	20 %	0 %	40 %	549720204
33735	NC_022543	ATG	2	6	2130142	2130147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720205
33736	NC_022543	GAG	2	6	2130265	2130270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549720205
33737	NC_022543	CTT	2	6	2130287	2130292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720205
33738	NC_022543	CTG	2	6	2130353	2130358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720205
33739	NC_022543	CTG	2	6	2130411	2130416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720205
33740	NC_022543	GCA	2	6	2130508	2130513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549720205
33741	NC_022543	AGCTC	2	10	2130551	2130560	20 %	20 %	20 %	40 %	549720205
33742	NC_022543	TGT	2	6	2130579	2130584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549720205
33743	NC_022543	CAA	2	6	2130695	2130700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549720205
33744	NC_022543	CTT	2	6	2130722	2130727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720205
33745	NC_022543	CAC	2	6	2130740	2130745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720205
33746	NC_022543	A	6	6	2131119	2131124	100 %	0 %	0 %	0 %	549720206
33747	NC_022543	CACAA	2	10	2131131	2131140	60 %	0 %	0 %	40 %	549720206
33748	NC_022543	A	7	7	2131153	2131159	100 %	0 %	0 %	0 %	549720206
33749	NC_022543	GGA	2	6	2131172	2131177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549720206
33750	NC_022543	TGA	2	6	2131360	2131365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720206
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33752	NC_022543	GCT	2	6	2131511	2131516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720206
33753	NC_022543	ACAA	2	8	2131536	2131543	75 %	0 %	0 %	25 %	549720206
33754	NC_022543	CTT	2	6	2131563	2131568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720206
33755	NC_022543	C	6	6	2131587	2131592	0 %	0 %	0 %	100 %	549720206
33756	NC_022543	ATT	2	6	2131602	2131607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549720206
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33760	NC_022543	GAA	2	6	2131814	2131819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549720206
33761	NC_022543	TCT	2	6	2131849	2131854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720206
33762	NC_022543	TGG	2	6	2131900	2131905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549720206
33763	NC_022543	ACA	3	9	2132013	2132021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549720207
33764	NC_022543	CTG	2	6	2132037	2132042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720207
33765	NC_022543	TGA	2	6	2132069	2132074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720207
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33772	NC_022543	ATA	2	6	2132512	2132517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549720207
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33814	NC_022543	TCC	2	6	2134637	2134642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549720209
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33833	NC_022543	ACC	2	6	2135674	2135679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720210
33834	NC_022543	TGG	2	6	2135726	2135731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549720210
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33837	NC_022543	CAC	2	6	2135825	2135830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549720210
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33840	NC_022543	CAT	2	6	2135974	2135979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720210
33841	NC_022543	A	6	6	2136047	2136052	100 %	0 %	0 %	0 %	549720210
33842	NC_022543	TTC	2	6	2136453	2136458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549720211
33843	NC_022543	TGA	2	6	2136466	2136471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549720211
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33845	NC_022543	GATG	2	8	2136559	2136566	25 %	25 %	50 %	0 %	549720211
33846	NC_022543	GA	3	6	2136592	2136597	50 %	0 %	50 %	0 %	549720211
33847	NC_022543	GCT	2	6	2136673	2136678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549720211
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33849	NC_022543	TCA	2	6	2136713	2136718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549720211
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